| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 英文缩写表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 摩擦禾简介 | 第12-13页 |
| 1.1.1 摩擦禾属的特点 | 第12页 |
| 1.1.2 摩擦禾的用途与意义 | 第12-13页 |
| 1.2 测序技术 | 第13-15页 |
| 1.2.1 高通量测序技术的优点 | 第13-14页 |
| 1.2.2 测序技术的应用 | 第14-15页 |
| 1.3. 重复序列 | 第15-19页 |
| 1.3.1 重复序列概述 | 第15页 |
| 1.3.2 重复序列的利用 | 第15-16页 |
| 1.3.3 重复序列的类型和分布 | 第16-19页 |
| 1.3.4 重复序列的功能 | 第19页 |
| 1.3.5 重复序列的进化 | 第19页 |
| 1.4 生物信息学研究进展 | 第19-22页 |
| 1.4.1 生物信息学的概念 | 第19-20页 |
| 1.4.2 生物信息学在基因组分析的应用 | 第20-21页 |
| 1.4.3 生物信息学在基因组研究中存在的挑战 | 第21-22页 |
| 1.5 荧光原位杂交技术及其应用 | 第22-25页 |
| 1.5.1 荧光原位杂交原理 | 第22页 |
| 1.5.2 荧光原位杂交探针类型 | 第22-23页 |
| 1.5.3 荧光原位杂交的发展 | 第23-24页 |
| 1.5.4 荧光原位杂交在基因组分析中的应用 | 第24-25页 |
| 1.6 本课题研究意义 | 第25-26页 |
| 第二章 材料和方法 | 第26-36页 |
| 2.1 技术路线 | 第26页 |
| 2.2 材料 | 第26-27页 |
| 2.3 方法 | 第27-36页 |
| 2.3.1 基因组大小估算——流式细胞仪法 | 第27页 |
| 2.3.2 基因组DNA提取 | 第27页 |
| 2.3.3 测序 | 第27-28页 |
| 2.3.4 基因组结构分析 | 第28页 |
| 2.3.5 摩擦禾基因组结构比较 | 第28页 |
| 2.3.6 摩擦禾属与近缘属间基因组结构比较 | 第28-29页 |
| 2.3.7 PCR | 第29页 |
| 2.3.8 琼脂糖凝胶电泳 | 第29页 |
| 2.3.9 DNA凝胶回收 | 第29页 |
| 2.3.10 克隆 | 第29-30页 |
| 2.3.11 提质粒(小提) | 第30页 |
| 2.3.12 摩擦禾中期染色体制片 | 第30-31页 |
| 2.3.14 探针的标记 | 第31页 |
| 2.3.15 荧光原位杂交 | 第31-32页 |
| 2.3.16 免疫荧光染色 | 第32页 |
| 2.3.17 ChIP | 第32-35页 |
| 2.3.18 ChIP-seq分析 | 第35页 |
| 2.3.19 染色质免疫沉淀PCR | 第35-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-54页 |
| 3.1 摩擦禾的基因组大小估算 | 第36-37页 |
| 3.2 摩擦禾的低覆盖度测序及基因组结构分析 | 第37-39页 |
| 3.3 摩擦禾卫星重复序列比较分析 | 第39-42页 |
| 3.4 二倍体摩擦禾MR、DD的中期染色体核型分析 | 第42-44页 |
| 3.5 四倍体摩擦禾DL中卫星重复序列的染色体分布 | 第44-46页 |
| 3.6 四倍体摩擦禾GISH分析 | 第46-47页 |
| 3.7 摩擦禾着丝粒重复序列分析 | 第47-48页 |
| 3.8 摩擦禾ITS区(Internal Transcribed Spacer)序列分析 | 第48-51页 |
| 3.9 摩擦禾MR,DD,DL的基因组重复序列比较 | 第51-52页 |
| 3.10 摩擦禾属与其近缘属的基因组重复序列比较 | 第52-54页 |
| 第四章 讨论 | 第54-58页 |
| 4.1 摩擦禾基因组研究价值 | 第54页 |
| 4.2 低覆盖度测序对重复序列分析的有效性 | 第54-55页 |
| 4.3 重复序列与摩擦禾基因组 | 第55页 |
| 4.4 摩擦禾的核型特点以及卫星重复序列的分布模式 | 第55-56页 |
| 4.5 ITS区序列在摩擦禾物种间进化分析的应用 | 第56-57页 |
| 4.6 摩擦禾着丝粒重复序列 | 第57页 |
| 4.7 重复序列在摩擦禾属及其近缘属间进化分析中的应用 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-68页 |
| 附录 | 第68-74页 |
| 附录Ⅰ 实验引物 | 第68-69页 |
| 附录Ⅱ 博士期间其它工作 | 第69-74页 |
| 1.1 ZmCENH3-YFP在洋葱表皮的瞬时表达 | 第69页 |
| 1.2 ZmCENH3转基因到小麦品种扬158及转基因小麦的表型鉴定 | 第69-70页 |
| 1.3 在ZmCENH3转基因小麦与玉米的杂交组合中玉米染色体消除现象没有被抑制 | 第70-72页 |
| 1.4 在转基因系中ZmCENH3-YFP的表达蛋白没有检测到 | 第72-73页 |
| 1.5 拼接改造的CENH3在小麦Y158的转基因 | 第73页 |
| 1.6 小麦CENH3转基因到Y158 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 个人简介 | 第75页 |
