| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-17页 |
| ·研究背景 | 第10页 |
| ·自抑域的研究 | 第10-12页 |
| ·自抑域的概述 | 第10-11页 |
| ·自抑域的研究 | 第11-12页 |
| ·P_(2B)ATP、CRKs家族、C_AV家族的自抑域生物学研究 | 第12-16页 |
| ·P_(2B)ATP酶自抑域特性的生物信息学研究 | 第12-13页 |
| ·CRKs家族自抑域特性的生物信息学研究 | 第13-14页 |
| ·CaV家族自抑域特性的生物信息学研究 | 第14-16页 |
| ·研究的目的和意义 | 第16-17页 |
| 第二章 拟南芥P2BATP酶自抑域特性的生物信息学研究 | 第17-41页 |
| ·实验方法与材料 | 第17-27页 |
| ·文献的查找与下载 | 第17-18页 |
| ·用选定家族中的已知蛋白,在NCBI上用blast进行搜索,寻找该家族中的其它成员以及相关蛋白 | 第18页 |
| ·对所有已知成员进行全序列多重比对分析 | 第18页 |
| ·以已知蛋白的自抑域序列,用比对的方法寻找家族其它成员可能的自抑域序列 | 第18页 |
| ·对所选家族成员的可能自抑域序列进行多重比对分析 | 第18页 |
| ·在序列分析的基础上构建该家族的进化树 | 第18-19页 |
| ·家族成员的蛋白质序列进行膜拓扑结构分析 | 第19-27页 |
| ·拟南芥P_(2B)ATP酶家族成员序列查寻结果 | 第27页 |
| ·拟南芥P_(2B)ATP酶家族生物信息学分析结果 | 第27-37页 |
| ·对这八个蛋白质进行全序列比对分析得到下图 | 第27-28页 |
| ·以已知的ACA2的自抑域序列用clustalx1.83分别寻找其它七个蛋白可能的自抑域区段 | 第28页 |
| ·对这八个蛋白的自抑域序列进行多重序列比对分析,得出以下图片 | 第28-29页 |
| ·通过对这八个蛋白的全序列比对以及对其自抑域进行了比对后,分别以全序列比对和自抑域比对的结果对这八种蛋白进行了进化树的构建 | 第29页 |
| ·实验中用TMHMM软件对这八个蛋白的全序列进行了膜拓扑结构的分析 | 第29-37页 |
| ·结果讨论 | 第37-41页 |
| ·蛋白质自抑域性质分析 | 第37-38页 |
| ·P_(2B)ATP蛋白家族的特质 | 第38页 |
| ·拟南芥P_(2B)ATP酶家族成员全序列比对分析 | 第38-39页 |
| ·拟南芥P_(2B)ATP酶家族成员自抑域序列比对分析 | 第39页 |
| ·拟南芥P_(2B)ATP酶家族进化树分析 | 第39页 |
| ·拟南芥P_(2B)ATP酶家族成员膜拓扑结构分析 | 第39-41页 |
| 第三章 拟南芥CRKS家族自抑域序列推测及其自抑机制分析 | 第41-46页 |
| ·材料和方法 | 第41页 |
| ·拟南芥8种CRKs(CRK1～CRK8)和34种CDPKs(CDPK1～CDPK34)蛋白质序列的下载 | 第41页 |
| ·蛋白质序列多重比对分析 | 第41页 |
| ·进化树构建 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-45页 |
| ·拟南芥8种CRKs(CRK1～CRK8)和34种CDPKs(CDPK1～CDPK34)进化树构建 | 第41-42页 |
| ·拟南芥八种CRKs自抑域序列的获得 | 第42-43页 |
| ·拟南芥八种CRKs全序列及自抑域序列进化树构建 | 第43-44页 |
| ·拟南芥34种CDPKs与8种CRKs自抑域序列进化树构建 | 第44-45页 |
| ·CRKs可能自抑机制的推测 | 第45-46页 |
| 第四章 CAV1家族自抑域特性的生物信息学研究 | 第46-58页 |
| ·实验方法与材料 | 第46-48页 |
| ·对所选蛋白进行全序列多重比对分析 | 第46页 |
| ·通过已知蛋白的自抑域序列寻找家族其它成员可能的自抑域序列 | 第46页 |
| ·对所选家族成员的可能自抑域序列进行多重比对分析 | 第46-47页 |
| ·在序列分析的基础上构建该家族的进化树 | 第47页 |
| ·家族成员的蛋白质序列膜拓扑结构分析 | 第47-48页 |
| ·结果 | 第48-56页 |
| ·褐家鼠CaV1家族全序列比对分析结果 | 第48页 |
| ·利用已知自抑域序列寻找褐家鼠CaV1家族的自抑域序列 | 第48-49页 |
| ·褐家鼠CaV1四个蛋白自抑域序列多重比对结果 | 第49页 |
| ·褐家鼠CaV1家族4个蛋白质的进化关系 | 第49-50页 |
| ·四个蛋白的全序列膜拓扑结构分析 | 第50-56页 |
| ·分析讨论 | 第56-58页 |
| ·褐家鼠家族成员全序列比对分析 | 第56-57页 |
| ·褐家鼠家族成员自抑域序列比对分析 | 第57页 |
| ·褐家鼠家族进化树分析 | 第57页 |
| ·褐家鼠CaV1家族成员膜拓扑结构分析 | 第57-58页 |
| 第五章 结果和讨论 | 第58-59页 |
| ·研究结论 | 第58页 |
| ·自抑域的氨基酸序列保守性 | 第58页 |
| ·自抑域序列可以在一定程度上反映进化的同源性 | 第58页 |
| ·同一家族二级结构上的相似性 | 第58页 |
| ·创新点 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 附录 | 第63-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 个人简介 | 第75页 |
