| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| ·有机磷农药研究现状 | 第14-21页 |
| ·有机磷农药的环境危害及毒性机理 | 第14-16页 |
| ·农药残留的解决途径 | 第16页 |
| ·微生物降解农药的方式 | 第16页 |
| ·有机磷降解酶的分离纯化及降解酶基因克隆 | 第16-18页 |
| ·有机磷降解酶的分子结构研究 | 第18-21页 |
| ·毒死蜱研究现状 | 第21-26页 |
| ·毒死蜱降解菌资源 | 第22-24页 |
| ·毒死蜱的降解途径 | 第24-26页 |
| ·微生物基因组学研究现状 | 第26-28页 |
| ·微生物基因组研究进展 | 第26-27页 |
| ·高通量测序技术 | 第27-28页 |
| ·本研究目的意义及主要内容 | 第28-30页 |
| 第二章 TRP菌株复壮、基本特性及毒死蜱降解基因克隆探索 | 第30-56页 |
| ·实验材料 | 第30-33页 |
| ·材料 | 第30页 |
| ·培养基 | 第30页 |
| ·试剂及配制 | 第30-33页 |
| ·仪器 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-42页 |
| ·TRP菌株复壮及降解能力的测定 | 第33-34页 |
| ·TRP菌株的分子生物学鉴定 | 第34-37页 |
| ·蛋白含量的测定 | 第37页 |
| ·毒死蜱降解酶的表达特性 | 第37-38页 |
| ·TRP菌株基因组文库的构建 | 第38-42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-54页 |
| ·TRP菌株的复壮 | 第42-44页 |
| ·TRP菌株的变异检测 | 第44-47页 |
| ·TRP菌株的抗生素抗性实验 | 第47页 |
| ·TRP菌株的生物表面活性剂生成的检测 | 第47-48页 |
| ·TRP菌株毒死蜱降解酶的表达特性 | 第48-49页 |
| ·TRP菌株毒死蜱降解酶基因的同源克隆 | 第49-52页 |
| ·TRP菌株基因组文库的构建 | 第52-54页 |
| ·小结 | 第54-56页 |
| 第三章 副球菌TRP基因组测序 | 第56-76页 |
| ·实验材料 | 第56-57页 |
| ·材料 | 第56页 |
| ·仪器 | 第56页 |
| ·基因组DNA提取试剂 | 第56-57页 |
| ·实验方法 | 第57-60页 |
| ·副球菌TRP基因组DNA的提取 | 第57页 |
| ·副球菌TRP基因组测序流程 | 第57-58页 |
| ·副球菌TRP基因组测序数据的生物信息分析 | 第58-60页 |
| ·使用到的数据库 | 第60页 |
| ·数据文件的格式及打开文件方式 | 第60页 |
| ·结果与讨论 | 第60-74页 |
| ·副球菌TRP基因组DNA的提取 | 第60-61页 |
| ·副球菌TRP基因组测序数据的生物信息分析 | 第61-72页 |
| ·毒死蜱降解酶基因cpd的预测 | 第72-73页 |
| ·副球菌TRP基因组序列提交GenBank | 第73-74页 |
| ·小结 | 第74-76页 |
| 第四章 毒死蜱降解酶基因cpd的克隆、表达及纯化 | 第76-104页 |
| ·实验材料 | 第76-77页 |
| ·材料 | 第76页 |
| ·试剂及配制 | 第76-77页 |
| ·仪器设备 | 第77页 |
| ·实验方法 | 第77-83页 |
| ·cpd基因的克隆 | 第77-78页 |
| ·cpd基因的表达 | 第78-79页 |
| ·CPD蛋白的纯化 | 第79-80页 |
| ·CPD蛋白酯酶活力测定 | 第80页 |
| ·CPD蛋白对毒死蜱的降解 | 第80页 |
| ·TRP菌株cpd基因的敲除 | 第80-82页 |
| ·TRP△cpd菌株对毒死蜱的降解 | 第82-83页 |
| ·结果与讨论 | 第83-102页 |
| ·cpd基因的克隆 | 第83-90页 |
| ·cpd基因的表达 | 第90-93页 |
| ·CPD蛋白的纯化 | 第93-94页 |
| ·CPD蛋白酯酶活力测定 | 第94-96页 |
| ·CPD蛋白对毒死蜱的降解 | 第96页 |
| ·TRP菌株cpd基因的敲除 | 第96-101页 |
| ·TRP△cpd菌株对毒死蜱的降解 | 第101-102页 |
| ·小结 | 第102-104页 |
| 第五章 毒死蜱降解酶CPD结构与功能的关系研究 | 第104-117页 |
| ·实验材料 | 第104页 |
| ·质粒和菌株 | 第104页 |
| ·试剂盒 | 第104页 |
| ·仪器设备 | 第104页 |
| ·实验方法 | 第104-106页 |
| ·CPD二级结构预测 | 第104-105页 |
| ·CPD三级结构预测 | 第105页 |
| ·CPD与CP的分子对接 | 第105页 |
| ·CPD定点突变 | 第105-106页 |
| ·CPD-S155A蛋白的表达和纯化 | 第106页 |
| ·CPD-S155A蛋白对毒死蜱的降解 | 第106页 |
| ·结果与讨论 | 第106-116页 |
| ·CPD二级结构预测 | 第106页 |
| ·CPD三级结构预测 | 第106-110页 |
| ·CPD与CP的分子对接 | 第110-111页 |
| ·CPD定点突变 | 第111-115页 |
| ·CPD-S155A蛋白的表达和纯化 | 第115页 |
| ·CPD-S155A蛋白对毒死蜱的降解 | 第115-116页 |
| ·小结 | 第116-117页 |
| 第六章 全文总结 | 第117-120页 |
| ·全文总结 | 第117-119页 |
| ·创新点 | 第119页 |
| ·进一步工作展望 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-129页 |
| 附录 | 第129-134页 |
| 致谢 | 第134-135页 |
| 作者简历 | 第135-136页 |