| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 蛇足石杉的研究现状 | 第12-14页 |
| 1.1.1 蛇足石杉的形态特征 | 第12页 |
| 1.1.2 蛇足石杉野生资源分布及生态环境 | 第12页 |
| 1.1.3 蛇足石杉的药用价值 | 第12-13页 |
| 1.1.4 HupA化学合成及生物合成 | 第13页 |
| 1.1.5 蛇足石杉的人工繁殖及栽培技术 | 第13页 |
| 1.1.6 蛇足石杉的遗传多样性及进化研究 | 第13-14页 |
| 1.1.7 蛇足石杉功能基因及蛋白的生物信息 | 第14页 |
| 1.2 转录组测序技术的应用 | 第14-15页 |
| 1.2.1 转录组测序技术在代谢网络中的应用 | 第14页 |
| 1.2.2 转录组测序技术在分子标记开发中的应用 | 第14-15页 |
| 1.3 分子标记的类型及特性 | 第15-17页 |
| 1.3.1 显性标记 | 第15页 |
| 1.3.2 共显性标记 | 第15-17页 |
| 1.4 SSR标记的开发 | 第17页 |
| 1.5 SSR标记技术的应用 | 第17-18页 |
| 1.5.1 SSR标记技术在物种遗传多样性及分子育种研究中的应用 | 第17页 |
| 1.5.2 SSR标记技术在种质资源鉴定中的应用 | 第17-18页 |
| 1.5.3 SSR标记技术在遗传图谱构建中的应用 | 第18页 |
| 1.6 物种遗传多样性及群体遗传结构研究 | 第18-19页 |
| 1.7 本研究的目的及意义 | 第19-20页 |
| 总结 | 第20-22页 |
| 第二章 蛇足石杉转录组测序及生物碱代谢合成相关基因分析 | 第22-36页 |
| 2.1 材料及方法 | 第22-24页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第22-24页 |
| 2.2 实验结果 | 第24-30页 |
| 2.2.1 转录组测序 | 第24页 |
| 2.2.2 蛇足石杉转录组组装结果统计 | 第24页 |
| 2.2.3 Unigene功能注释 | 第24-25页 |
| 2.2.4 同源物种数据库(NR databases)比对分析 | 第25-26页 |
| 2.2.5 GO注释和分类 | 第26页 |
| 2.2.6 KEGG及KOG功能注释及分类 | 第26-28页 |
| 2.2.7 生物碱-石杉碱甲代谢合成相关通路 | 第28-30页 |
| 2.2.8 石松类碱代谢合成相关基因预测 | 第30页 |
| 2.3 分析与讨论 | 第30-36页 |
| 2.3.1 蛇足石杉序列组装 | 第30-31页 |
| 2.3.2 蛇足石杉基因功能注释 | 第31-32页 |
| 2.3.3 蛇足石杉生物碱合成相关功能基因 | 第32-36页 |
| 第三章 基于SSR标记技术分析蛇足石杉遗传多样性及群体遗传结构 | 第36-56页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第37-42页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第37页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第37-42页 |
| 3.2 实验结果 | 第42-52页 |
| 3.2.1 蛇足石杉基因组DNA的检测 | 第42页 |
| 3.2.2 蛇足石杉SSR位点的开发 | 第42-44页 |
| 3.2.3 PCR条件的优化及SSR引物的初步筛选 | 第44页 |
| 3.2.4 多态性引物的筛选 | 第44页 |
| 3.2.5 毛细管电泳检测 | 第44-48页 |
| 3.2.6 蛇足石杉野生资源遗传多样性 | 第48页 |
| 3.2.7 蛇足石杉种群分化 | 第48-49页 |
| 3.2.8 蛇足石杉野生资源群体遗传结构 | 第49-50页 |
| 3.2.9 HupA及HupB含量测定 | 第50-52页 |
| 3.3 分析与讨论 | 第52-56页 |
| 3.3.1 蛇足石杉SSR位点的开发 | 第52-53页 |
| 3.3.2 蛇足石杉SSR-PCR反应体系的优化及引物的筛选 | 第53页 |
| 3.3.3 蛇足石杉多态性位点 | 第53页 |
| 3.3.4 蛇足石杉遗传多样性评估 | 第53-54页 |
| 3.3.5 蛇足石杉遗传分化及群体遗传结构 | 第54-56页 |
| 结论 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第68页 |
