摘要 | 第9-11页 |
ABSTRACT | 第11-14页 |
缩略语表 | 第15-16页 |
1 文献综述 | 第16-40页 |
1.1 硼的物理和化学性质 | 第16页 |
1.2 硼的天然来源 | 第16页 |
1.3 农田土壤中硼的有效性 | 第16-17页 |
1.4 植物中硼的缺乏和毒害 | 第17页 |
1.5 硼在植物体内的功能 | 第17-18页 |
1.6 硼在植物体内的吸收和转运 | 第18-29页 |
1.6.1 硼的跨膜运输 | 第18-19页 |
1.6.2 BORs家族基因与硼的吸收与转运 | 第19-23页 |
1.6.3 NIPs家族基因与硼的吸收与转运 | 第23-28页 |
1.6.4 PIPs家族基因与硼的吸收与转运 | 第28页 |
1.6.5 TIPs家族基因与硼的吸收与转运 | 第28页 |
1.6.6 XIPs家族基因与硼的吸收与转运 | 第28-29页 |
1.6.7 转录因子与硼的吸收转运 | 第29页 |
1.7 植物QTLs的定位与克隆策略 | 第29-33页 |
1.8 甘蓝型油菜QTLs的定位与克隆研究进展 | 第33-35页 |
1.9 高通量测序在甘蓝型油菜组学研究中的应用 | 第35-37页 |
1.10 甘蓝型油菜硼高效的生理和分子机制研究 | 第37-38页 |
1.11 甘蓝型油菜硼高效的遗传基础研究 | 第38-40页 |
2 本研究的背景﹑内容和技术路线 | 第40-42页 |
2.1 研究背景 | 第40页 |
2.2 研究内容 | 第40-41页 |
2.3 技术路线 | 第41-42页 |
3 不同硼效率品种响应低硼胁迫的形态﹑生理和转录组差异与遗传变异 | 第42-72页 |
3.1 前言 | 第42页 |
3.2 材料与方法 | 第42-50页 |
3.2.1 试验材料 | 第42页 |
3.2.2 营养液培养试验 | 第42-43页 |
3.2.3 盆栽试验 | 第43页 |
3.2.4 硼含量的测定 | 第43-44页 |
3.2.5 显微分析 | 第44页 |
3.2.6 高纯度基因组DNA的提取 | 第44-45页 |
3.2.7 总RNA的提取 | 第45-46页 |
3.2.8 RNA的逆转录与荧光定量PCR | 第46-48页 |
3.2.9 全基因组重测序 | 第48页 |
3.2.10 数字基因表达谱测序 | 第48-49页 |
3.2.11 基因表达分析 | 第49页 |
3.2.12 统计分析 | 第49-50页 |
3.3 结果与分析 | 第50-68页 |
3.3.1 硼高效品种和硼低效品种苗期响应缺硼的形态和生理差异 | 第50-54页 |
3.3.2 硼高效品种与硼低效品种成熟期响应缺硼的形态和生理差异 | 第54-57页 |
3.3.3 硼高效品种与硼低效品种的基因组差异 | 第57-61页 |
3.3.4 硼高效品种与硼低效品种的差异表达基因 | 第61-68页 |
3.4 讨论 | 第68-72页 |
3.4.1 全基因组重测序解析不同硼效率品种间丰富的遗传变异 | 第68-69页 |
3.4.2 数字基因表达谱鉴定不同硼效率品种响应缺硼的差异表达基因 | 第69-70页 |
3.4.3 甘蓝型油菜不同硼效率品种对缺硼胁迫的差异响应模型 | 第70-72页 |
4 甘蓝型油菜硼高效QTL qBEC-A3a的精细定位与克隆 | 第72-123页 |
4.1 前言 | 第72-73页 |
4.2 材料与方法 | 第73-80页 |
4.2.1 试验材料 | 第73页 |
4.2.2 营养液培养与盆栽试验 | 第73页 |
4.2.3 硼效率的鉴定 | 第73页 |
4.2.4 高通量测序 | 第73-74页 |
4.2.5 QTL-seq分析 | 第74页 |
4.2.6 核酸多态性位点的鉴定和InDel-based分子标记的开发 | 第74-75页 |
4.2.7 InDel-based分子标记的PCR扩增 | 第75页 |
4.2.8 聚丙烯酰氨凝胶电泳(PAGE) | 第75-76页 |
4.2.9 遗传连锁图谱的构建 | 第76页 |
4.2.10 基因序列的克隆 | 第76-79页 |
4.2.11 生物信息学分析 | 第79-80页 |
4.3 结果与分析 | 第80-118页 |
4.3.1 硼高效主效QTL qBEC-A3a位点的遗传分析 | 第80-82页 |
4.3.2 硼高效主效QTL qBEC-A3a对硼效率的影响 | 第82-88页 |
4.3.3 QTL-seq验证硼高效主效QTL qBEC-A3a | 第88-89页 |
4.3.4 硼高效主效QTL qBEC-A3a的精细定位 | 第89-96页 |
4.3.5 数字基因表达谱辅助的候选基因分析 | 第96-99页 |
4.3.6 硼高效候选基因BnaA3.NIP5;1 的分子特征 | 第99-109页 |
4.3.7 硼高效基因BnaA3.NIP5;1 的共表达分析 | 第109-112页 |
4.3.8 QTL-seq鉴定全基因组硼高效QTLs | 第112-118页 |
4.4 讨论 | 第118-123页 |
4.4.1 QTL-seq鉴定甘蓝型油菜硼效率QTLs | 第118-120页 |
4.4.2 硼高效主效QTL qBEC-A3a的精细定位 | 第120页 |
4.4.3 高通量测序在数量性状基因克隆上的应用 | 第120-121页 |
4.4.4 BnaA3.NIP5;1 蛋白作为NIP家族成员的调控解析 | 第121-123页 |
5 甘蓝型油菜响应缺硼和过量硼胁迫的表达谱分析 | 第123-147页 |
5.1 前言 | 第123页 |
5.2 材料与方法 | 第123-126页 |
5.2.1 试验材料 | 第123页 |
5.2.2 营养液培养试验 | 第123-124页 |
5.2.3 硼﹑光合色素﹑SPAD和花青素的测定 | 第124页 |
5.2.4 叶片比重的计算和SPAD值的测定 | 第124页 |
5.2.5 花青素的测定 | 第124-125页 |
5.2.6 数字基因表达谱分析 | 第125页 |
5.2.7 统计分析 | 第125-126页 |
5.3 结果与分析 | 第126-143页 |
5.3.1 甘蓝型油菜响应不同硼胁迫的形态和生理差异 | 第126-129页 |
5.3.2 甘蓝型油菜全基因组数字基因表达谱 | 第129-133页 |
5.3.3 油菜BORs家族基因对缺硼和硼毒胁迫的表达反应 | 第133-135页 |
5.3.4 油菜MIPs家族基因对缺硼和硼毒处理的表达反应 | 第135-138页 |
5.3.5 油菜WRKYs家族基因对缺硼和硼毒胁迫的表达反应 | 第138-139页 |
5.3.6 油菜抗氧化酶家族基因对缺硼和硼毒处理的表达反应 | 第139-141页 |
5.3.7 数字基因表达谱的定量PCR验证 | 第141-143页 |
5.4 讨论 | 第143-147页 |
5.4.1 甘蓝型油菜对缺硼和硼毒胁迫的形态与生理响应 | 第143-144页 |
5.4.2 甘蓝型油菜对缺硼和硼毒胁迫的分子响应 | 第144-147页 |
6 总结与展望 | 第147-150页 |
6.1 总结 | 第147-148页 |
6.2 本研究的创新点 | 第148页 |
6.3 本研究的不足与展望 | 第148-150页 |
参考文献 | 第150-170页 |
附录I 本研究中常用试剂的配制方法 | 第170-173页 |
附录II 本研究所用引物序列 | 第173-174页 |
附录III 本研究所克隆基因序列 | 第174-177页 |
附录IV 本研究常用数据库/软件网址 | 第177-178页 |
作者简介 | 第178页 |
在读期间发表论文 | 第178-179页 |
致谢 | 第179-181页 |