| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 RNA结构-功能关系研究的背景与意义 | 第10-11页 |
| 1.2 RNA的结构特征 | 第11-13页 |
| 1.3 RNA的生物学功能 | 第13-15页 |
| 1.4 RNA结构-功能关系的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.5 本论文的研究内容及章节安排 | 第16-17页 |
| 第2章 RNA结构-功能关系的计算机模拟研究 | 第17-27页 |
| 2.1 基于分子动力学模拟的RNA结构-功能关系研究 | 第17-21页 |
| 2.1.1 分子动力学模拟的基本原理 | 第17-19页 |
| 2.1.2 分子动力学模拟在RNA结构-功能关系研究中的应用 | 第19-21页 |
| 2.2 基于弹性网络模型的RNA结构－功能关系研究 | 第21-26页 |
| 2.2.1 弹性网络模型的基本原理 | 第21-24页 |
| 2.2.2 弹性网络模型在RNA结构-功能关系研究中的应用 | 第24-26页 |
| 2.3 本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 基于RNA结构的弹性网络模型的构建和应用 | 第27-39页 |
| 3.1 引言 | 第27-29页 |
| 3.2 理论模型与研究方法 | 第29-32页 |
| 3.2.1 弹性网络模型的基本原理 | 第29-31页 |
| 3.2.2 关联系数 | 第31-32页 |
| 3.2.3 共价相互作用弹簧劲度系数的优化方法 | 第32页 |
| 3.3 研究结果与讨论 | 第32-38页 |
| 3.3.1 RNA空间结构的简化 | 第32-33页 |
| 3.3.2 嗜热四膜虫内含子P4-P6结构域和tRNA共价相互作用劲度系数的优化过程及结果 | 第33-38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 结论 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-47页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48页 |
