| 英文缩略词表 | 第3-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 引言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献研究 | 第13-30页 |
| 1 合成生物学 | 第13-14页 |
| 1.1 合成生物学与植物次生代谢工程概念 | 第13页 |
| 1.2 植物活性成分的次生代谢工程研究现状 | 第13-14页 |
| 2 转录组及比较转录组学 | 第14-16页 |
| 2.1 转录组学 | 第14-15页 |
| 2.2 比较转录组学 | 第15-16页 |
| 3 三萜皂苷及其生物合成概述 | 第16-23页 |
| 3.1 三萜皂苷概述 | 第16-17页 |
| 3.2 三萜皂苷的合成研究 | 第17-23页 |
| 3.3 底盘生物的选择 | 第23页 |
| 4 毛冬青、岗梅及穿心莲 | 第23-29页 |
| 4.1 毛冬青与岗梅的比较 | 第25-28页 |
| 4.2 穿心莲与毛冬青、岗梅的比较 | 第28页 |
| 4.3 岗梅乌苏烷型三萜皂苷生物合成研究进展 | 第28-29页 |
| 5 本文的研究思路 | 第29-30页 |
| 第二章 材料和方法 | 第30-49页 |
| 1 材料 | 第30-33页 |
| 1.1 植物材料 | 第30页 |
| 1.2 菌株 | 第30页 |
| 1.3 主要试剂及工具酶 | 第30页 |
| 1.4 主要溶液的配制 | 第30-32页 |
| 1.5 主要仪器设备 | 第32-33页 |
| 1.6 常用软件 | 第33页 |
| 2 方法 | 第33-49页 |
| 2.1 毛冬青总RNA的提取方法及优化 | 第33页 |
| 2.2 毛冬青转录组测序及数据分析 | 第33-37页 |
| 2.3 比较转录组分析 | 第37-38页 |
| 2.4 Amyrin synthase的克隆和功能分析 | 第38-42页 |
| 2.5 基因重组表达质粒的构建 | 第42-46页 |
| 2.6 蛋白表达及功能分析 | 第46-49页 |
| 第三章 实验结果 | 第49-92页 |
| 1 毛冬青总RNA提取方法的确定 | 第49-50页 |
| 1.1 总RNA的提取方法优化 | 第49页 |
| 1.2 优化后的毛冬青总RNA的提取方法 | 第49-50页 |
| 1.3 总RNA质量分析 | 第50页 |
| 2 毛冬青转录组测序结果 | 第50-57页 |
| 2.1 测序产量、序列组装和表达概况 | 第51-52页 |
| 2.2 基因注释和分类 | 第52-57页 |
| 3 毛冬青中次生代谢产物生物合成相关酶基因的挖掘 | 第57-63页 |
| 3.1 毛冬青中三萜生物合成途径分析 | 第57-61页 |
| 3.2 黄酮生物合成相关酶基因的挖掘 | 第61-62页 |
| 3.3 次生代谢产物生物合成相关转录因子的挖掘 | 第62-63页 |
| 4 毛冬青与岗梅比较转录组分析 | 第63-66页 |
| 4.1 基因蛋白家族分析 | 第63页 |
| 4.2 物种共有基因与特有基因分析 | 第63-65页 |
| 4.3 单拷贝同源基因的Ka/Ks分析 | 第65-66页 |
| 5 毛冬青与岗梅中次生代谢产物相关酶基因再挖掘 | 第66-73页 |
| 5.1 毛冬青与岗梅三萜皂苷生物合成相关酶基因 | 第66-70页 |
| 5.2 毛冬青与岗梅黄酮生物合成相关酶基因 | 第70页 |
| 5.3 毛冬青与岗梅转录因子挖掘 | 第70-71页 |
| 5.4 毛冬青与岗梅共有基因与穿心莲的比较分析 | 第71-73页 |
| 6 Amyrin synthase的克隆和功能分析 | 第73-92页 |
| 6.1 Amyrin synthase的选择 | 第73页 |
| 6.2 RNA提取及反转录 | 第73页 |
| 6.3 克隆载体构建 | 第73-77页 |
| 6.4 基因重组表达质粒的构建 | 第77-79页 |
| 6.5 蛋白表达及功能分析 | 第79-81页 |
| 6.6 IpAs1与其他已知AS间的比较 | 第81-87页 |
| 6.7 IpAS1的蛋白结构分析 | 第87-92页 |
| 第四章 总结和讨论 | 第92-95页 |
| 1 总结 | 第92-93页 |
| 1.1 建立了毛冬青转录基因信息库 | 第92页 |
| 1.2 比较转录组分析毛冬青及其他物种转录组 | 第92页 |
| 1.3 克隆并鉴定了一个多功能amyrin synthase | 第92-93页 |
| 2 讨论 | 第93-94页 |
| 2.1 转录组测序及基因挖掘方面的讨论 | 第93页 |
| 2.2 比较转录组分析方面讨论 | 第93-94页 |
| 3 展望 | 第94-95页 |
| 3.1 在植物中进行表达 | 第94页 |
| 3.2 有待进一步研究的候选基因 | 第94页 |
| 3.3 扩大研究部位 | 第94页 |
| 3.4 其他 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-104页 |
| 附录 | 第104-134页 |
| 在校期间发表的论文 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135-136页 |
| 附件 | 第136页 |
