| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-31页 |
| 第一节 乳汁管的研究进展 | 第15-17页 |
| 1.1 乳汁管的类别 | 第15-16页 |
| 1.2 乳汁的物理特征和成分 | 第16页 |
| 1.3 甘遂乳汁管的研究 | 第16-17页 |
| 第二节 植物转录组学的研究进展 | 第17-21页 |
| 2.1 转录组测序的基因发掘 | 第17-20页 |
| 2.1.1 次生代谢产物合成基因的分析 | 第17-18页 |
| 2.1.2 发育相关基因的分析 | 第18-19页 |
| 2.1.3 抗性相关基因的分析 | 第19页 |
| 2.1.4 参与压力响应相关基因的分析 | 第19-20页 |
| 2.2 SSR标记开发 | 第20-21页 |
| 2.3 基于转录组数据库的蛋白质组学分析 | 第21页 |
| 第三节 植物响应胁迫的蛋白质组学研究进展 | 第21-27页 |
| 3.1 非生物胁迫对植物蛋白质组的影响 | 第21-26页 |
| 3.1.1 低温胁迫 | 第21-22页 |
| 3.1.2 高温胁迫 | 第22-23页 |
| 3.1.3 盐胁迫 | 第23-24页 |
| 3.1.4 重金属胁迫 | 第24-25页 |
| 3.1.5 机械损伤 | 第25页 |
| 3.1.6 臭氧胁迫 | 第25-26页 |
| 3.1.7 UV-B辐射 | 第26页 |
| 3.2 生物胁迫对植物蛋白质组的影响 | 第26-27页 |
| 3.2.1 病原菌胁迫 | 第26-27页 |
| 3.2.2 昆虫胁迫 | 第27页 |
| 第四节 乳汁蛋白质组学研究 | 第27-30页 |
| 4.1 次生代谢产物 | 第28-29页 |
| 4.2 乳汁管的发育及分化 | 第29-30页 |
| 4.3 病毒感染 | 第30页 |
| 第五节 本研究目的和意义 | 第30-31页 |
| 第二章 甘遂的转录组测序及分析 | 第31-49页 |
| 2.1 前言 | 第31-32页 |
| 2.2 实验材料和方法 | 第32-34页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第32页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第32-34页 |
| 2.2.2.1 RNA提取 | 第32页 |
| 2.2.2.2 构建cDNA文库 | 第32-33页 |
| 2.2.2.3 从头组装和数据分析 | 第33页 |
| 2.2.2.4 基因注释 | 第33页 |
| 2.2.2.5 检测SSR位点、引物设计和验证分子标记 | 第33-34页 |
| 2.2.2.6 SSR标记的数据分析 | 第34页 |
| 2.3 结果 | 第34-46页 |
| 2.3.1 RNA样品的提取和检测 | 第34页 |
| 2.3.2 序列组装和数据分析 | 第34-36页 |
| 2.3.3 基因功能注释 | 第36-37页 |
| 2.3.4 GO功能分类 | 第37-38页 |
| 2.3.5 COG功能分类 | 第38-39页 |
| 2.3.6 KEGG代谢通路分析 | 第39-40页 |
| 2.3.7 参与萜类生物合成的候选基因 | 第40-43页 |
| 2.3.8 EST-SSR开发和验证 | 第43-46页 |
| 2.4 讨论 | 第46-49页 |
| 2.4.1 转录组序列组装 | 第46页 |
| 2.4.2 基因的功能注释和分类 | 第46页 |
| 2.4.3 萜类生物合成相关的候选基因 | 第46-47页 |
| 2.4.4 开发SSR标记 | 第47-49页 |
| 第三章 UV-B辐射下甘遂乳汁的比较蛋白质组学研究 | 第49-70页 |
| 3.1 前言 | 第49页 |
| 3.2 实验材料和方法 | 第49-55页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第49页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第49-55页 |
| 3.2.2.1 实验设计 | 第49-50页 |
| 3.2.2.2 甘遂乳汁蛋白的提取和纯化 | 第50页 |
| 3.2.2.3 iTRAQ标记和质谱分析 | 第50-51页 |
| 3.2.2.4 蛋白定量 | 第51页 |
| 3.2.2.5 蛋白样品酶解 | 第51页 |
| 3.2.2.6 iTRAQ标记 | 第51页 |
| 3.2.2.7 强阳离子交换色谱(SCX) | 第51-52页 |
| 3.2.2.8 LTQ Orbitrap HCD的LC-ESI-MSMS分析 | 第52页 |
| 3.2.2.9 质谱鉴定及数据分析 | 第52-53页 |
| 3.2.2.10 生物信息分析 | 第53页 |
| 3.2.2.11 免疫印迹分析 | 第53-55页 |
| 3.3 实验结果 | 第55-64页 |
| 3.3.1 甘遂乳汁蛋白的定量分析 | 第55-59页 |
| 3.3.1.1 甘遂乳汁蛋白的GO分析 | 第56-57页 |
| 3.3.1.2 甘遂乳汁蛋白的COG分析 | 第57-58页 |
| 3.3.1.3 甘遂乳汁蛋白的KEGG分析 | 第58-59页 |
| 3.3.2 乳汁差异蛋白质组学分析 | 第59-62页 |
| 3.3.2.1 差异表达蛋白的GO富集分析 | 第59-62页 |
| 3.3.2.2 差异表达蛋白的KEGG富集分析 | 第62页 |
| 3.3.3 免疫印迹分析 | 第62-64页 |
| 3.4 讨论 | 第64-70页 |
| 3.4.1 甘遂乳汁蛋白组分分析 | 第64-65页 |
| 3.4.2 乳汁管发育相关途径的分析 | 第65-67页 |
| 3.4.2.1 泛素-蛋白酶体途径 | 第65-66页 |
| 3.4.2.2 自噬途径 | 第66-67页 |
| 3.4.3 萜类合成相关的蛋白质 | 第67-68页 |
| 3.4.4 UV-B处理对甘遂乳汁蛋白的影响 | 第68-70页 |
| 结论 | 第70-73页 |
| 参考文献 | 第73-92页 |
| 附录 | 第92-116页 |
| 攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第116-118页 |
| 致谢 | 第118页 |
