| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第9-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-40页 |
| ·表观遗传学 | 第14-18页 |
| ·表观遗传信息的继承与生殖系重编程 | 第15-16页 |
| ·表观遗传机制 | 第16-18页 |
| ·DNA甲基化 | 第18-28页 |
| ·概述 | 第18-19页 |
| ·DNA甲基化的维持与建立 | 第19-22页 |
| ·DNA去甲基化 | 第22-24页 |
| ·DNA甲基化与基因表达调控 | 第24页 |
| ·基因组印迹 | 第24-27页 |
| ·DNA甲基化与疾病 | 第27-28页 |
| ·小鼠原始生殖细胞发育中DNA甲基化的重编程 | 第28-32页 |
| ·小鼠原始生殖细胞的发育 | 第28-29页 |
| ·原始生殖细胞发育中DNA去甲基化 | 第29-31页 |
| ·生殖细胞中DNA甲基化模式的重新建立 | 第31-32页 |
| ·小鼠受精后早期胚胎发育中DNA甲基化的重编程 | 第32-35页 |
| ·小鼠受精后的胚胎发育 | 第32-33页 |
| ·小鼠受精后胚胎发育中DNA去甲基化 | 第33-35页 |
| ·小鼠胚胎发育中DNA甲基化模式的重新建立 | 第35页 |
| ·5mC及其氧化衍生物的测序方法 | 第35-39页 |
| ·5mC测序方法 | 第35-37页 |
| ·5mC氧化衍生物测序方法 | 第37-39页 |
| ·研究内容 | 第39-40页 |
| 第二章 材料与方法 | 第40-57页 |
| ·实验材料 | 第40-44页 |
| ·小鼠品系 | 第40页 |
| ·小鼠样品 | 第40-41页 |
| ·引物序列 | 第41页 |
| ·抗体 | 第41页 |
| ·DNA寡核苷酸序列 | 第41-42页 |
| ·试剂与试剂盒 | 第42-43页 |
| ·常用溶液 | 第43页 |
| ·实验仪器 | 第43-44页 |
| ·实验方法 | 第44-57页 |
| ·小鼠MII卵细胞的收集 | 第44页 |
| ·小鼠成熟精子的收集 | 第44页 |
| ·杂交小鼠胚胎的收集 | 第44-45页 |
| ·E13.5原始生殖细胞的收集 | 第45-46页 |
| ·DNA提取 | 第46页 |
| ·RNA提取 | 第46页 |
| ·DNA重测序建库 | 第46-48页 |
| ·全基因组亚硫酸氢盐测序建库 | 第48-49页 |
| ·TAB-seq建库 | 第49-51页 |
| ·fCAB-seq建库 | 第51页 |
| ·RNA-seq建库 | 第51-52页 |
| ·斑点印迹实验 | 第52页 |
| ·免疫荧光染色 | 第52-53页 |
| ·重测序数据分析 | 第53页 |
| ·DNA甲基化数据分析 | 第53-54页 |
| ·5hmC数据分析 | 第54-55页 |
| ·5fC数据分析 | 第55-56页 |
| ·转录组数据分析 | 第56-57页 |
| 第三章 研究结果 | 第57-85页 |
| ·DNA甲基化测序建库方法的优化 | 第57-59页 |
| ·测序数据概况 | 第59-65页 |
| ·DNA甲基化数据 | 第59-60页 |
| ·DNA亲本来源的区分及其代表性的评估 | 第60-63页 |
| ·5hmC测序数据 | 第63-64页 |
| ·5fC测序数据 | 第64-65页 |
| ·早期胚胎发育中DNA甲基化及其氧化产物图谱的特征 | 第65-74页 |
| ·配子与早期胚胎的独特的DNA甲基化模式 | 第65-66页 |
| ·配子与早期胚胎中DNA各元件的甲基化动态变化 | 第66-68页 |
| ·配子特异甲基化的启动子区的甲基化动态变化 | 第68-69页 |
| ·卵细胞中甲基化的非CG位点相对富集 | 第69-70页 |
| ·二细胞期胚胎的5hmC图谱及亲本来源特异的分布特征 | 第70-72页 |
| ·二细胞期胚胎的5fC图谱及亲本来源特异的分布特征 | 第72-74页 |
| ·受精后胚胎发育中DNA主动去甲基化 | 第74-80页 |
| ·早期胚胎发育中父源和母源DNA甲基化的动态变化 | 第74页 |
| ·父源5mC主动去甲基化 | 第74-76页 |
| ·母源5mC主动去甲基化 | 第76-78页 |
| ·受精后DNA去甲基化不主要依赖5hmC/5fC/5caC的被动稀释 | 第78-80页 |
| ·早期胚胎发育过程中印迹调控区甲基化的动态变化 | 第80-82页 |
| ·E13.5原始生殖细胞的甲基化图谱与继承 | 第82-85页 |
| 第四章 结论 | 第85-86页 |
| 第五章 讨论 | 第86-90页 |
| ·哺乳动物受精后的主动去甲基化 | 第86-88页 |
| ·不同物种中DNA甲基化重编程的比较 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-117页 |
| 附录 | 第117-127页 |
| A. 配子特异高甲基化的CpG岛 | 第117-127页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第127-129页 |
