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海洋假交替单胞菌适应海冰环境的机制及其遗传操作体系的建立

目录第1-9页
摘要第9-15页
Abstract第15-23页
符号说明及缩写词第23-25页
第一章 研究背景与立题依据第25-45页
   ·研究背景第25-41页
     ·海洋生态环境第25-27页
     ·适冷微生物及其环境适应机制第27-28页
     ·假交替单胞菌研究进展第28-33页
     ·丝状噬菌体研究概况第33-37页
     ·极地噬菌体研究概况第37-38页
     ·适冷酶及适冷表达体系研究进展第38-41页
   ·立题依据与研究内容第41-45页
     ·立题依据第41-43页
     ·研究内容第43-45页
第二章 北极海冰假交替单胞菌丝状噬菌体的分离及基本性质研究第45-65页
   ·引言第45页
   ·实验材料、仪器和试剂第45-49页
     ·菌株与质粒第45-46页
     ·主要试剂第46-47页
     ·主要仪器设备第47-48页
     ·培养基配制第48-49页
     ·数据库与分析软件第49页
   ·实验方法第49-54页
     ·菌株与质粒保存第49页
     ·丝状噬菌体f327复制形式(R_F)的提取第49页
     ·丝状噬菌体颗粒的提取第49-50页
     ·丝状噬菌体f327的电镜观察第50页
     ·单链形式丝状噬菌体DNA的提取第50页
     ·丝状噬菌体基因组基本性质的测定第50页
     ·丝状噬菌体主要衣壳蛋白N端序列测定第50-51页
     ·利用PCR检测北极海冰假交替单胞菌中丝状噬菌体的分布第51-52页
     ·利用rpoD基因构建含丝状噬菌体基因的宿主菌进化树第52-53页
     ·DNA-DNA杂交第53-54页
   ·结果与分析第54-64页
     ·丝状噬菌体f327的分离及形态观察第54-55页
     ·丝状噬菌体f327基因组结构分析第55-59页
     ·丝状噬菌体f327的基本性质测定第59-61页
     ·丝状噬菌体在北极海冰假交替单胞菌中的分布第61-64页
   ·讨论第64-65页
第三章 丝状噬菌体f327介导的假交替单胞菌适应海冰环境的机制第65-83页
   ·引言第65页
   ·实验材料、仪器和试剂第65-67页
     ·菌株与质粒第65页
     ·主要试剂和试剂盒第65-67页
     ·主要仪器设备第67页
     ·培养基配制第67页
   ·实验方法第67-71页
     ·高温消除丝状噬菌体复制形式RF327第67页
     ·Southern blot杂交验证缺失突变株第67-69页
     ·菌株生长与耐盐实验第69页
     ·菌株H2O2耐受性实验第69页
     ·菌株运动性检测第69-70页
     ·细菌总RNA的提取与转录组分析第70页
     ·反转录与实时定量PCR(RT qPCR)第70-71页
   ·结果与分析第71-81页
     ·丝状噬菌体复制形式RF327的消除第71-74页
     ·丝状噬菌体f327对宿主生长及耐受性的影响第74-76页
     ·丝状噬菌体f327对宿主运动性的影响第76-77页
     ·丝状噬菌体f327影响宿主的分子机制第77-81页
   ·讨论第81-83页
第四章 深海适冷假交替单胞菌Pseudoalteromonas sp.SM9913高效接合转移体系的构建第83-97页
   ·引言第83页
   ·实验材料与仪器第83-84页
     ·菌株与质粒第83页
     ·主要试剂与试剂盒第83-84页
     ·主要仪器设备第84页
     ·培养基配制第84页
     ·抗生素的配制第84页
   ·实验方法第84-89页
     ·Ps.sp.SM9913药敏实验第84页
     ·细菌基因组DNA及质粒的提取第84-85页
     ·PCR扩增及PCR产物的回收、纯化与克隆第85-88页
     ·穿梭载体pOriT-4EM的构建第88页
     ·E.coli ET12567(pUZ8002)感受态细胞的制备第88页
     ·接合转移方法的建立第88-89页
   ·结果与分析第89-95页
     ·Ps.sp.SM9913对不同抗生素的敏感性第89-90页
     ·穿梭载体pOriT-4EM的构建第90-93页
     ·接合转移体系的建立第93-95页
   ·讨论第95-97页
第五章 深海适冷假交替单胞菌Pseudoalteromonas sp.SM9913基因敲除方法的建立及基因的敲除第97-113页
   ·引言第97页
   ·实验材料、仪器和试剂第97-98页
     ·菌株与质粒第97页
     ·主要试剂与试剂盒第97-98页
     ·主要仪器设备第98页
     ·培养基配制第98页
   ·实验方法第98-102页
     ·epsT基因同源臂及筛选标记的扩增第98-99页
     ·epsT基因无标记敲除载体pMT的构建第99-100页
     ·第一次同源重组突变株的筛选及验证第100页
     ·第二次同源重组突变株的筛选及验证第100-101页
     ·胞外多糖产量的测定第101-102页
     ·胞外多糖的发酵及提取第102页
   ·结果与分析第102-110页
     ·epsT基因无标记敲除载体pMT的构建第102-105页
     ·epsT基因的无标记敲除第105-108页
     ·epsT基因缺失突变株的表型检测第108-109页
     ·Ps.sp.SM9913运动性相关基因的敲除第109-110页
   ·讨论第110-113页
第六章 北极海冰假交替单胞菌Pseudoalteromonas sp.BSi20429适冷异源表达体系的建立及异源蛋白的表达第113-135页
   ·引言第113页
   ·实验材料、仪器和试剂第113-114页
     ·菌株与质粒第113-114页
     ·主要试剂及配制第114页
     ·主要仪器设备第114页
   ·实验方法第114-120页
     ·穿梭载体pOriT-4CM的构建和Ps.sp.SM20429接合转移体系的建立第114-115页
     ·报告载体的构建第115-117页
     ·纤维素酶活的测定第117页
     ·异源表达载体pEV的构建第117-118页
     ·重组蛋白表达载体的构建第118-119页
     ·重组pseudoalterin的表达第119页
     ·弹性蛋白酶酶活测定第119页
     ·利用His-tag纯化重组蛋白第119-120页
     ·重组蛋白N端序列测定第120页
   ·结果与分析第120-132页
     ·穿梭载体pOriT-4CM的构建与Ps.sp.SM20429接合转移体系的建立第120-121页
     ·报告载体的构建第121-124页
     ·红霉素抗性基因在Ps.sp.SM20429中的表达第124-125页
     ·不同启动子下纤维素酶酶活的比较第125-126页
     ·异源表达载体pEV的构建第126-127页
     ·多个适冷酶的重组表达与纯化第127-132页
   ·讨论第132-135页
全文总结与展望第135-137页
 一、本文取得的创新性结果第135-136页
 二、本文存在的问题及深入方向第136-137页
附录第137-139页
参考文献第139-153页
在读期间论文发表及专利申请情况第153-155页
致谢第155-156页
附件第156-165页
学位论文评阅及答辩情况表第165页

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