昆虫水平基因转移的鉴定与分析
| 目录 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-29页 |
| ·水平基因转移的本质 | 第13-15页 |
| ·水平基因转移的发现 | 第13页 |
| ·水平基因转移与垂直基因转移 | 第13-14页 |
| ·水平基因转移与遗传信息传递 | 第14-15页 |
| ·水平基因转移与遗传变异产生 | 第15页 |
| ·水平基因转移的鉴定 | 第15-19页 |
| ·根据近缘物种基因含量 | 第15-16页 |
| ·根据密码子使用偏差 | 第16页 |
| ·根据序列的相似性 | 第16-17页 |
| ·根据同源序列的分布模式 | 第17页 |
| ·根据系统发生关系的不一致 | 第17-18页 |
| ·污染序列影响水平基因转移探测 | 第18-19页 |
| ·水平基因转移的研究 | 第19-27页 |
| ·原核生物水平基因转移研究 | 第19-21页 |
| ·昆虫水平基因转移研究 | 第21-24页 |
| ·其它真核生物水平基因转移研究 | 第24-27页 |
| ·水平基因转移的分类 | 第27-29页 |
| 2 引言 | 第29-33页 |
| ·研究背景 | 第29-30页 |
| ·研究目的和意义 | 第30-31页 |
| ·研究内容 | 第31-32页 |
| ·技术路线 | 第32-33页 |
| 3 五种昆虫水平基因转移的鉴定 | 第33-41页 |
| ·材料与方法 | 第33-35页 |
| ·序列数据 | 第33页 |
| ·鉴定方法 | 第33-35页 |
| ·结果与分析 | 第35-39页 |
| ·五种昆虫与细菌间水平基因转移的探测结果 | 第35-36页 |
| ·蜜蜂中的候选基因可能是基因组中的污染序列 | 第36页 |
| ·家蚕中存在14类22个细菌来源的水平转移基因 | 第36-38页 |
| ·家蚕中细菌来源的水平转移基因的特点 | 第38-39页 |
| ·讨论 | 第39-41页 |
| ·鉴定方法的合理性和有效性 | 第39页 |
| ·昆虫基因组中水平转移基因的数量不同 | 第39-41页 |
| 4 水平基因转移的供体预测 | 第41-57页 |
| ·材料与方法 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-55页 |
| ·讨论 | 第55-57页 |
| ·家蚕水平基因转移的供体来源多样 | 第55-56页 |
| ·家蚕从病原细菌中获得了大量的外源基因 | 第56-57页 |
| 5 水平基因转移的转移时间估计 | 第57-67页 |
| ·材料与方法 | 第57页 |
| ·序列数据 | 第57页 |
| ·分析方法 | 第57页 |
| ·结果与分析 | 第57-64页 |
| ·运用EST序列估计转移时间 | 第57-63页 |
| ·运用鳞翅目昆虫的基因组数据估计转移时间 | 第63-64页 |
| ·讨论 | 第64-67页 |
| ·鳞翅目昆虫中古老的水平基因转移事件 | 第64-65页 |
| ·鳞翅目昆虫的繁荣与被子植物的繁盛 | 第65-67页 |
| 6 鳞翅目昆虫水平转移基因的进化特征和功能预测 | 第67-83页 |
| ·材料与方法 | 第67页 |
| ·序列数据 | 第67页 |
| ·分析方法 | 第67页 |
| ·结果与分析 | 第67-79页 |
| ·葡萄糖-1-磷酸酶 | 第67-70页 |
| ·甘油磷酰二酯磷酸二酯酶 | 第70-71页 |
| ·NAD依赖性表异构酶/脱水酶 | 第71-73页 |
| ·N-甲基色氨酸氧化酶 | 第73-74页 |
| ·γ-谷氨酰转移酶 | 第74-75页 |
| ·醌氧化酶类似基因 | 第75-76页 |
| ·糖基水解酶 | 第76页 |
| ·半胱氨酸合成酶类似基因 | 第76页 |
| ·其它基因 | 第76-79页 |
| ·讨论 | 第79-83页 |
| ·鳞翅目昆虫水平转移基因具有多样的进化历程 | 第79-80页 |
| ·鳞翅目昆虫水平转移基因的功能 | 第80-83页 |
| 7 综合与讨论 | 第83-85页 |
| ·统一方法下多种昆虫在基因组水平上的比较分析 | 第83页 |
| ·病原菌来源的水平转移基因有助于鳞翅目昆虫的进化 | 第83-84页 |
| ·水平基因转移研究展望 | 第84-85页 |
| 论文的创新 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-97页 |
| 附录 | 第97-111页 |
| 致谢 | 第111-113页 |
| 发表论文及参加课题 | 第113页 |
