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基于“Clip-Chip”技术的全局性蛋白质去乙酰化酶的发现研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
缩略词表第10-11页
第一章 绪论第11-20页
   ·组蛋白质乙酰化修饰概述第11-12页
   ·非组蛋白乙酰化修饰概述第12-14页
   ·蛋白质去乙酰化酶概述第14-18页
     ·真核生物去乙酰化酶概述第15-18页
     ·原核生物去乙酰化酶概述第18页
   ·本章小结第18-19页
 本课题研究目标第19-20页
第二章 基于大肠杆菌全蛋白芯片“CLIP-CHIP”技术的建立第20-29页
   ·芯片的制备第20-23页
     ·材料和方法第20页
     ·乙酰化底物蛋白的表达和纯化第20-21页
     ·蛋白芯片和底物芯片的制备第21-23页
   ·CLIP-CHIP 试验第23-25页
     ·“Clip-Chip”技术原理概述第23-24页
     ·材料和方法第24页
     ·“Clip-Chip”试验流程第24-25页
   ·试验结果第25-28页
     ·乙酰化底物蛋白表达纯化结果第25-26页
     ·“Clip-Chip”试验结果及分析第26-28页
   ·本章小结第28-29页
第三章 体外验证 YCGC 的去乙酰化酶活力第29-39页
   ·实验材料第29-30页
   ·实验方法第30-33页
     ·新型去乙酰化酶的表达及其纯化第30页
     ·体外验证提取的去乙酰化酶活性第30-31页
     ·YcgC 对底物蛋白 YcdC 酶活性的检测以及酶活动力曲线的测定第31-32页
     ·乙酰化蛋白 YcdC 反应前后的质谱鉴定第32-33页
   ·实验结果及其分析第33-38页
     ·去乙酰化酶 CobB 和 YcgC 蛋白纯化结果第33-34页
     ·体外 western 验证 YcgC 去乙酰化能力结果第34-35页
     ·YcgC 去乙酰化酶活动力曲线的绘制第35页
     ·测定 YcgC 以 YcdC 为底物时的去乙酰化位点第35-38页
   ·本章小结第38-39页
第四章 体内验证 YCGC 的去乙酰化酶活力第39-55页
   ·本章概述第39-40页
   ·实验材料和仪器第40页
   ·实验方法第40-48页
     ·目的基因的 PCR 扩增及处理第40-41页
     ·测定 E.coli 全蛋白的乙酰化第41-42页
     ·设计合成 C 末端带有 3X FLAG 标签的 YcdC 全基因序列第42-43页
     ·将合成的目的基因敲入到宿主菌中第43-44页
     ·用 3X FLAG 抗体进行敲入验证第44-46页
     ·YcgC 质粒转入 W3100(YcdC_3X FLAG)菌株第46页
     ·体内验证 YcgC 对底物蛋白 YcdC 的去乙酰化反应第46-48页
   ·结果及分析第48-53页
     ·YcdC_3X FLAG 基因的 PCR 结果第48-49页
     ·E.coli 全蛋白的乙酰化结果第49-50页
     ·基因水平验证 YcdC_3X FLAG 片段敲入结果第50页
     ·蛋白水平验证 YcdC_3X FLAG 片段敲入结果第50-51页
     ·体内验证 YcgC 对底物蛋白 YcdC 的去乙酰化反应第51-53页
   ·本章小结第53-55页
第五章 YCDC 控制的 GAD SYSTEM 基因的调节变化第55-61页
   ·本章概述第55页
   ·材料和方法第55-56页
   ·REAL-TIME PCR 验证 YCDC 所调控基因的转录情况第56-58页
     ·RNA 的提取与逆转录第56页
     ·荧光定量 PCR 验证 Gad system 基因变化第56-58页
   ·结果分析第58-60页
     ·RNA 的提取结果第58页
     ·YcdC 控制的 Gad System 基因转录变化结果第58-60页
   ·本章小结第60-61页
本研究的创新点及下一步工作计划第61-62页
参考文献第62-69页
致谢第69-70页
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第70-71页
附录 Ⅰ 仪器信息第71-72页
附录 Ⅱ 缓冲液信息第72-75页

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