拟南芥poly(A)位点的特征提取和识别算法
摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-12页 |
第一章 绪论 | 第12-22页 |
·前言 | 第12-13页 |
·分子生物学基础 | 第13-16页 |
·遗传物质 | 第13-14页 |
·基因的结构及表达 | 第14-16页 |
·机器学习方法 | 第16-18页 |
·Poly(A)位点识别研究的意义 | 第18-19页 |
·植物poly(A)位点识别的现状及存在的问题 | 第19-20页 |
·本文主要工作 | 第20-21页 |
·本文的结构 | 第21-22页 |
第二章 拟南芥ploy(A)位点特征提取 | 第22-33页 |
·训练及测试的数据库 | 第22页 |
·核苷分布特征 | 第22-23页 |
·统计特征分析 | 第23-24页 |
·特征提取 | 第24-29页 |
·基于熵的算法 | 第26-29页 |
·熵值分析法 | 第29页 |
·SVM 的位点分类研究 | 第29-33页 |
第三章 拟南芥ploy(A)位点识别算法 | 第33-45页 |
·基于GHMM 的植物poly(A)位点识别模型 | 第33-37页 |
·广义隐马尔可夫模型 | 第33-34页 |
·植物poly(A)位点识别模型 | 第34-35页 |
·模型参数设置 | 第35-37页 |
·一阶异构马尔可夫子模型 | 第37-39页 |
·Poly(A)位点识别范围扩展 | 第39页 |
·GHMM 标定算法 | 第39-41页 |
·EST 数据集多位点判别和整合方法 | 第41-45页 |
第四章 拟南芥poly(A)位点计算机识别系统 | 第45-54页 |
·用户界面 | 第46-47页 |
·程序功能模块 | 第47-49页 |
·输入模块 | 第47-48页 |
·输出及图形处理模块 | 第48-49页 |
·位点识别计算模块 | 第49页 |
·数据结构 | 第49-51页 |
·内存管理及程序优化 | 第51-52页 |
·位点识别程序流程 | 第52-54页 |
第五章 位点识别实验与结果分析 | 第54-62页 |
·PAS 的敏感度和特异度分析 | 第54-56页 |
·多位点序列位点识别效果分析 | 第56-59页 |
·选择性位点序列位点识别效果分析 | 第59页 |
·突变序列位点识别效果分析 | 第59-62页 |
第六章 结论与建议 | 第62-65页 |
·全文总结 | 第62-63页 |
·不足与改进建议 | 第63-65页 |
参考文献 | 第65-67页 |
致谢 | 第67页 |