| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1. 研究目的和意义 | 第11-13页 |
| ·研究意义 | 第11-12页 |
| ·研究目的 | 第12页 |
| ·技术路线 | 第12-13页 |
| 2. 文献综述 | 第13-35页 |
| ·SSR标记及其在柑橘种质研究的应用 | 第13-14页 |
| ·分子系统学概述 | 第14-20页 |
| ·植物分子系统学分析方法 | 第15-17页 |
| ·分子系统学中常用的叶绿体基因组DNA序列标记 | 第17-18页 |
| ·分子系统学常用的核基因组DNA序列标记 | 第18-19页 |
| ·分子系统学常用的线粒体基因组DNA序列标记 | 第19-20页 |
| ·柑橘类果树种质的研究进展 | 第20-35页 |
| ·真正柑橘类植物起源与演化 | 第21-23页 |
| ·柑橘属果树的分类 | 第23页 |
| ·柑橘属及部分种的起源与演化 | 第23-28页 |
| ·大翼橙类与柑橘属的起源 | 第24-25页 |
| ·柚 | 第25页 |
| ·枸橼 | 第25-26页 |
| ·甜橙和酸橙 | 第26页 |
| ·藜檬 | 第26-27页 |
| ·柠檬 | 第27页 |
| ·莱檬 | 第27页 |
| ·葡萄柚 | 第27页 |
| ·粗柠檬 | 第27-28页 |
| ·四季橘 | 第28页 |
| ·香橙 | 第28页 |
| ·宽皮柑橘类各品种间的遗传多样性及系统演化研究 | 第28-32页 |
| ·宽皮柑橘的分类 | 第28-30页 |
| ·宽皮柑橘的演化 | 第30-32页 |
| ·宽皮柑橘一些生物型的起源 | 第32页 |
| ·我国野橘种质的研究进展 | 第32-33页 |
| ·柑橘分子系统发育研究进展 | 第33-35页 |
| 3. 材料与方法 | 第35-44页 |
| ·实验材料 | 第35-38页 |
| ·SSR分析用的实验材料 | 第35-36页 |
| ·测序分析用的实验材料 | 第36-38页 |
| ·DNA的提取 | 第38页 |
| ·SSR分析 | 第38-39页 |
| ·PCR扩增及SSR标记的检测 | 第38-39页 |
| ·SSR数据的统计分析 | 第39页 |
| ·DNA序列性状分析 | 第39-44页 |
| ·目的基因片段的扩增 | 第39-41页 |
| ·序列片段的回收与克隆、测序 | 第41页 |
| ·序列比对和处理 | 第41-42页 |
| ·数据集间的相容性检验 | 第42页 |
| ·最大简约树的构建 | 第42页 |
| ·最大似然树的构建 | 第42-43页 |
| ·邻接距离树的构建 | 第43页 |
| ·系统发育树的KHTest和SHTest分析 | 第43-44页 |
| 4. 结果与分析 | 第44-82页 |
| ·遗传多样性研究的结果与分析 | 第44-54页 |
| ·核基因组SSR检测到的宽皮柑橘及野橘的多态性 | 第44-46页 |
| ·叶绿体基因组SSR检测到的宽皮柑橘及野橘的多态性 | 第46-47页 |
| ·基于核基因组SSR的宽皮柑橘及野橘的聚类分析 | 第47-49页 |
| ·地方品种的聚类分析 | 第47-49页 |
| ·野橘群体的聚类分析 | 第49页 |
| ·基于叶绿体基因组SSR的宽皮柑橘及野橘的聚类分析 | 第49页 |
| ·基于SSR的宽皮柑橘及野橘间的亲缘关系 | 第49-54页 |
| ·DNA序列性状研究的结果与分析 | 第54-82页 |
| ·叶绿体基因组matK基因片段的变异分析 | 第54-55页 |
| ·叶绿体基因组trnL-trnF基因片段的变异分析 | 第55页 |
| ·核基因组LEAFY第二个内含子(FLint2)序列变异的分析 | 第55-56页 |
| ·数据集间的相容性 | 第56页 |
| ·叶绿体基因组trnL-trnF基因片段的MP、ML和NJ系统树 | 第56-64页 |
| ·叶绿体基因组matK基因片段的MP、ML和NJ系统树 | 第64-67页 |
| ·叶绿体基因组trnL-trnF和matK联合数据集构建的MP系统树 | 第67-74页 |
| ·核基因组LEAFY第二个内含子序列(FLint2)的MP、ML和NJ系统树 | 第74-82页 |
| 5. 讨论 | 第82-87页 |
| ·地方品种及野橘种质间的遗传差异 | 第82页 |
| ·野橘种质与宽皮柑橘的亲缘关系 | 第82-83页 |
| ·一些柑橘生物型的起源 | 第83-85页 |
| ·大翼橙类与现代柑橘的起源 | 第85页 |
| ·DNA序列与柑橘系统发育研究 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 附录一 在读期间发表的论文 | 第106-107页 |
| 附录二 红江橙嵌合体材料的遗传鉴定 | 第107-112页 |
