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对虾白斑杆状病毒全基因组转录图谱分析及功能基因研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
1 前言第10-34页
   ·对虾白斑杆状病毒及其功能基因研究第10-21页
     ·对虾白斑杆状病毒研究概况第10-16页
     ·白斑杆状病毒功能基因研究第16-21页
   ·基因芯片技术第21-34页
     ·基因芯片技术的基本概念第22页
     ·历史发展第22-24页
     ·技术关键以及存在的问题第24-31页
     ·DNA微阵列的应用第31-34页
2 对虾白斑杆状病毒人工感染增殖研究第34-39页
   ·材料与方法第34-35页
     ·材料第34页
     ·病毒PCR模板的制备第34页
     ·对虾及白斑杆状病毒的人工感染第34-35页
     ·定量PCR测定病毒DNA含量第35页
     ·对虾白斑杆状病毒人工感染早期的感染增殖观察第35页
     ·对虾白斑病毒感染后不同个体的存活规律观察第35页
     ·病毒在对虾体内最大累积量观察第35页
   ·结果与讨论第35-39页
     ·定量PCR判定WSBV人工感染的增殖规律第35-36页
     ·感染对虾体重大小与存活时间的关系第36-37页
     ·死亡感染对虾的病毒最大累积量观察第37-39页
3 对虾白斑杆状病毒全基因组微阵列分析第39-62页
   ·材料与方法第39-41页
     ·对虾白斑杆状病毒基因片段的扩增第39页
     ·膜微阵列的制备第39页
     ·感染病毒虾总RNA的提取与质量鉴定第39-40页
     ·~(32)P-dATP逆转录标记cDNA第40页
     ·微阵列 杂交反应第40-41页
     ·微阵列图像扫描与数据分析第41页
   ·结果与讨论第41-62页
     ·WSBV基因组膜DNA微阵列的制备第41页
     ·RNA的提取第41-42页
     ·微阵列图像扫描结果第42-43页
     ·WSBV基因组微阵列数据分析结果第43-62页
4 对虾白斑杆状病毒全基因组易变区研究第62-68页
   ·材料与方法第62-63页
     ·对虾白斑杆状病毒基因组长片段的PCR扩增第62页
     ·对虾白斑病毒基因片段的纯化、克隆及序列测定第62页
     ·对虾白斑病毒基因组DNA片段缺失和毒力关系的研究及电镜观察第62-63页
   ·结果与讨论第63-68页
     ·不同来源病毒易变区片段的长度第63页
     ·病毒基因易变区序列的测定第63-64页
     ·对虾白斑病毒基因组DNA片段缺失和毒力关系的研究第64页
     ·病毒电镜观察第64-68页
5 对虾白斑杆状病毒基因功能研究第68-99页
   ·材料与方法第68-86页
     ·WSBV功能基因的克隆与表达第68页
     ·基因表达产物的纯化第68-69页
       ·Glutathione Sepharose 4B亲合色谱第68-69页
       ·Ni-NTA组氨酸变性条件亲合色谱第69页
     ·WP486(wsv238)基因的片段表达序列第69-71页
     ·WP136(wsv492)基因的表达序列第71页
     ·WP228(wsv493)基因的表达序列第71-72页
     ·免疫电镜定位观察第72-74页
     ·虾细胞核提取物的提取第74页
     ·对虾腮腺病毒蛋白的提取第74-75页
     ·DNA探针的DIG标记第75-76页
     ·Northern blot第76-77页
     ·抗-WSBV重组蛋白多克隆抗体的制备第77页
     ·抗-WSBV重组蛋白多克隆抗体的间接ELISA测定第77-78页
     ·抗-WSBV重组蛋白多克隆抗体IgG的ProteinA色谱柱纯化第78页
     ·Western blot第78-79页
     ·DNA结合蛋白特异结合位点的确定第79-82页
       ·基本原理第79-80页
       ·实验过程第80-82页
     ·RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)法确定基因5`-端和3`-端序列第82-85页
       ·5`-RACE原理及操作步骤第83-84页
       ·3`-RACE原理及操作步骤第84-85页
     ·抗体亲合色谱提取天然蛋白第85-86页
   ·结果与讨论第86-99页
     ·WP228(Wsv493)基因的克隆表达、纯化和功能研究第86-89页
       ·WP228(Wsv493)基因的克隆表达和纯化第86页
       ·WP228蛋白序列及结构特点第86-87页
       ·WP228与DNA的结合反应第87-89页
     ·WP136(Wsv492)基因的克隆表达、纯化第89-91页
       ·WP136(Wsv492)基因的克隆表达、纯化第89-90页
       ·WP136(Wsv492)蛋白序列及结构特点第90-91页
     ·WP486(Wsv238)基因的克隆表达、纯化和功能研究第91-94页
       ·WP486(Wsv238)基因的克隆表达、纯化第91页
       ·WP486(Wsv238)蛋白的结构特点第91-93页
       ·WP486(Wsv238)蛋白的免疫定位研究第93-94页
     ·WP486(Wsv238)基因的体内表达分析第94-99页
       ·Northern blot分析第94页
       ·WP486(Wsv238)基因的RACE分析第94-96页
       ·抗-WP486重组蛋白多克隆抗体的ELISA测定第96页
       ·Western blot分析第96-99页
6 总结第99-100页
参考文献第100-125页
附录1 博士期间撰写的论文、参加的课题及获得奖励第125-126页
附录2 常规实验试剂及配制第126-132页
附录3 常规实验方法第132-136页

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