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腾冲热海禁热菌噬菌体TTP23的分离及TSP4与其宿主的相互作用研究

摘要第1-6页
Abstract第6-18页
第一章 序言第18-43页
   ·栖热菌属(THERMUS)概述第19-22页
     ·栖热菌的分类地位第19页
     ·栖热菌属(Thermus)的地理分布和分类第19-21页
     ·Thermus属嗜热菌的形态结构与生长代谢第21页
     ·腾冲热海栖热菌多样性第21-22页
   ·THERMUS属体外遗传因子第22-29页
     ·Thermus属质粒第22-23页
     ·Thermus属嗜热菌噬菌体第23-27页
     ·云南腾冲热海已发现的Thermus属嗜热菌噬菌体第27-29页
   ·THERMUS属嗜热菌噬菌体基因组特征第29-36页
     ·ΦYS40基因组特征第29-31页
     ·P23-45和P74-26基因组特征第31-33页
     ·ΦN93噬菌体基因组特征第33-34页
     ·腾冲热海TSP4噬菌体基因组特征第34-36页
   ·噬菌体的基因表达调控第36-40页
     ·大肠杆菌λ噬菌体的基因调控第36-38页
     ·Thermus属噬菌体P23-45及ΦYS40的基因表达调控第38-40页
   ·研究的目的和意义第40-43页
第二章 腾冲热海栖热菌噬菌体TTP23的分离纯化及鉴定第43-65页
 引言第43页
   ·材料和方法第43-51页
     ·样品采集第43-44页
     ·培养基组成第44-45页
     ·主要仪器与设备第45页
     ·栖热菌的分离纯化及保存第45-46页
     ·栖热菌基因组DNA的提取、16S rRNA基因扩增及测序第46-47页
     ·栖热病毒TTP23的分离纯化及PEG沉淀第47-48页
     ·栖热菌HMZ23及其噬菌体TTP23的形态观察第48页
     ·栖热菌HMZ23的生长曲线第48页
     ·HMZ23菌株16S rRNA基因序列测定及系统发育学分析第48-49页
     ·TTP23噬菌体生物学特性研究第49-50页
     ·物理和化学因素对TTP23噬菌体活性的影响第50-51页
     ·二价阳离子对TTP23吸附及噬菌斑形成过程的影响第51页
   ·实验结果第51-63页
     ·样品采集地第51-52页
     ·栖热菌HMZ23宿主菌株的分离纯化第52-53页
     ·栖热菌HMZ23宿主菌株的显微镜观察第53-54页
     ·TTP23噬菌体的培养、分离及纯化第54-55页
     ·TTP23噬菌体的电镜图第55页
     ·栖热菌HMZ23生长曲线的测定第55-56页
     ·宿主菌株的系统进化分析及基因序列相似性比较第56-58页
     ·噬菌体TTP23基因组限制性酶切第58页
     ·噬菌体TTP23的最佳感染复数第58-59页
     ·噬菌体TTP23一步生长曲线的测定第59-60页
     ·物理及化学因素对噬菌体活性的影响第60-62页
     ·二价阳离子对噬菌体吸附及噬菌斑形成过程的影响第62-63页
   ·讨论第63-65页
第三章 栖热菌噬菌体TSP4基因的时序表达研究第65-96页
 引言第65-66页
   ·材料和方法第66-76页
     ·菌种及噬菌体来源第66页
     ·培养基第66页
     ·TSP4噬菌体RNA提取第66-68页
     ·RNA的纯化第68-69页
     ·RNA的评价与鉴定第69-70页
     ·TSP4噬菌体RNA反转录第70页
     ·TSP4基因中分子伴侣与血友病因子的共表达研究第70-72页
     ·TSP4基因组中各基因的时序表达分析第72-75页
     ·实时荧光定量PCR分析第75-76页
   ·结果及分析第76-94页
     ·TSP4噬菌体的培养第76-77页
     ·宿主菌株TC16的16S基因序列第77-78页
     ·方法一RNA提取结果第78-79页
     ·方法二RNA提取结果第79-80页
     ·分子伴侣及血友病因子共表达的初步研究第80-84页
     ·病毒基因在宿主体内时序表达的初步研究第84-91页
     ·实时荧光定量PCR结果分析第91-94页
   ·讨论第94-96页
     ·分子伴侣与血友病因子的共表达研究第94页
     ·噬菌体TSP4基因在宿主细胞内的时序表达第94-96页
第四章 栖热菌噬菌体TSP4与其宿主菌的相互作用关系机理的初步研究第96-116页
 前言第96-97页
   ·材料和方法第97-99页
     ·菌株及噬菌体第97页
     ·RNA提取及反转录第97页
     ·引物设计方案第97-98页
     ·TSP4复制对宿主菌的宏观影响第98页
     ·通过利福平实验对TSP4的早、中、晚基因进行验证第98页
     ·宿主细胞对噬菌体响应机制第98-99页
   ·实验结果第99-111页
     ·TSP4复制对宿主菌的宏观影响第100页
     ·RNA的提取第100-101页
     ·时序基因在TSP4基因组上分布的理论推测第101-103页
     ·TSP4早期、中晚期启动子的序列比较第103-104页
     ·通过利福平实验对TSP4的早、中晚基因启动子进行验证第104-106页
     ·宿主细胞对噬菌体的响应机制第106-111页
   ·结果及讨论第111-116页
     ·噬菌体TSP4感染宿主细胞后对宿主的调节机制第111-114页
     ·宿主菌对外来噬菌体或者复制子的响应机制第114-116页
第五章 总结与展望第116-118页
致谢第118-119页
参考文献第119-124页
附录A 攻读硕士期间发表论文目录第124-125页
附录B 试验常用试剂及其配制第125-128页

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