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琯溪蜜柚汁胞发育过程的差异蛋白质组学研究

摘要第1-14页
Abstract第14-18页
缩写词第18-20页
第一章 前言第20-43页
 1 柑橘果实成熟过程的相关生理研究第21-27页
   ·碳水化合物方面的研究第21-25页
     ·糖类代谢第22-23页
     ·淀粉代谢第23页
     ·果胶代谢第23-24页
     ·糖诱导的酶活性调节第24-25页
   ·有机酸的变化第25-26页
   ·膨压和渗透压调节第26-27页
 2 柑橘果实粒化的研究进展第27-33页
   ·果实的大小和重量、果形第28页
   ·种子的饱满度和生存力第28-29页
   ·汁胞第29-30页
   ·可溶性固形物第30页
   ·可滴定酸和汁液的pH 值第30页
   ·生长调节剂第30-31页
   ·酶和酶的活性第31-32页
   ·无机物组成第32页
   ·其它物质第32-33页
 3 差异蛋白质组学研究第33-39页
   ·二维凝胶电泳第34页
   ·差异凝胶电泳第34页
   ·质谱技术第34-36页
   ·同位素标记亲和标签第36页
   ·蛋白质芯片第36页
   ·蛋白质的翻译后修饰第36-37页
   ·研究蛋白质组学的生物信息学第37-38页
   ·蛋白质组学在植物上的应用第38-39页
 4 植物抗坏血酸过氧化物酶的作用机制、酶学及分子特性第39-41页
   ·H_2O_2 的产生和清除及APX 的作用机制第39-40页
   ·植物APX 的分子和酶学特征第40页
   ·植物APX 的系统分布及同工酶间的异同第40-41页
 本论文研究的目的意义和主要内容第41-43页
  1 本论文研究的目的意义第41-42页
  2 本论文研究的主要内容第42-43页
第二章 琯溪蜜柚汁胞双向电泳体系优化第43-55页
 1 材料与方法第44-49页
   ·仪器与试剂第44页
   ·蛋白质样品的提取优化第44-45页
   ·蛋白质含量的测定第45页
   ·琯溪蜜柚汁胞蛋白质组的双向电泳第45-49页
     ·IPG 的水化和电泳第45-46页
     ·平衡第46-47页
     ·SDS 垂直电泳第47-48页
     ·染色第48-49页
     ·凝胶图像分析第49页
 2 结果与分析第49-52页
   ·不同提取方法的比较第49页
   ·蛋白质裂解液对2-DE 的影响第49-50页
   ·不同长度IPG 干胶条的比较第50-52页
 3 讨论和小结第52-55页
   ·影响蛋白质分离因素第52-53页
   ·IEF 一些影响因素第53-55页
第三章 琯溪蜜柚汁胞发育过程中的差异蛋白质组学研究第55-72页
 1 材料与方法第55-57页
   ·材料第55页
   ·双向电泳及银染第55页
   ·差异表达蛋白点质谱鉴定第55-57页
     ·质谱样品制备第56页
     ·质谱分析与数据库检索第56-57页
 2 结果与分析第57-65页
   ·不同发育时期的琯溪蜜柚汁胞蛋白质2-DE 分析第57-61页
   ·MALDI-TOF-TOF MS 分析及数据库检索第61-65页
 3 讨论第65-72页
   ·质谱鉴定技术的应用第65页
   ·EST 数据库的应用第65-66页
   ·影响鉴定结果的关键因素第66-67页
   ·差异蛋白的功能第67-72页
     ·糖类和能量代谢相关蛋白质第68-69页
     ·蛋白质合成与代谢相关蛋白质第69页
     ·细胞结构相关蛋白质第69-70页
     ·信号传导与转录因子相关蛋白质第70页
     ·抗性相关蛋白质第70-71页
     ·调控相关蛋白质第71-72页
第四章 琯溪蜜柚汁胞粒化过程中的差异蛋白质组学研究第72-79页
 1 材料与方法第72页
   ·材料第72页
   ·双向电泳、差异蛋白点质谱分析与鉴定第72页
 2 结果与分析第72-77页
   ·不同粒化程度的琯溪蜜柚汁胞蛋白质2-DE 分析第72-74页
     ·9.28 正常汁胞与9.28 粒化汁胞的分析第72-73页
     ·10.18 正常汁胞与10.18 粒化汁胞的分析第73-74页
   ·MALDI-TOF-TOF MS 分析及数据库检索第74-76页
   ·差异表达的蛋白质的功能分析第76-77页
 3 讨论第77-79页
第五章 汁胞差异蛋白质点G6 的cDNA 克隆第79-90页
 1. 材料与方法第80-84页
   ·仪器与试剂第80页
   ·琯溪蜜柚汁胞RNA 提取及总RNA 含量和浓度测定第80-81页
   ·差异蛋白质点G6 cDNA 扩增第81-84页
     ·cDNA 第一链的合成第81页
     ·引物设计第81-82页
     ·RT-PCR 扩增第82页
     ·3' RACE PCR 扩增第82页
     ·PCR 产物的回收纯化第82-83页
     ·目的片段与T 载体连接、转化及鉴定第83页
     ·质粒的提取第83-84页
 2. 结果与分析第84-88页
   ·RNA 的质量第84-85页
   ·保守区扩增结果第85页
   ·3' RACE 结果第85-86页
   ·G6 的同源性分析第86-88页
 3. 讨论第88-90页
   ·Germin 的发现第88页
   ·OXO 的研究状况第88-89页
   ·Germin 蛋白的功能第89页
   ·Germin 蛋白在琯溪蜜柚汁胞发育与粒化过程中的作用第89-90页
第六章 琯溪蜜柚汁胞APX 活性测定与同工酶分析第90-97页
 1 材料与方法第90-92页
   ·仪器与试剂第90-91页
   ·方法第91-92页
     ·琯溪蜜柚汁胞APX 酶液的测定第91页
     ·琯溪蜜柚汁胞APX 同工酶电泳第91-92页
     ·琯溪蜜柚汁胞APX 同工酶的染色第92页
     ·琯溪蜜柚汁胞APX 同工酶迁移率的计算第92页
 2 结果与分析第92-95页
   ·不同生长时期琯溪蜜柚汁胞的APX 活性变化第92-93页
   ·正常汁胞与粒化汁胞的APX 活性变化第93页
   ·不同生长时期琯溪蜜柚汁胞的APX 同工酶变化第93-94页
   ·正常汁胞与粒化汁胞的APX 同工酶变化第94-95页
 3 小结和讨论第95-97页
第七章 琯溪蜜柚汁胞APX1 cDNA 的克隆及原核表达第97-118页
 1. 材料与方法第97-106页
   ·材料第97页
   ·琯溪蜜柚汁胞RNA 提取及总RNA 含量和浓度测定第97-98页
   ·APX1 cDNA 保守区的扩增第98-99页
     ·cDNA 第一链的合成第98页
     ·引物设计第98页
     ·RT-PCR第98-99页
     ·PCR 产物的回收纯化第99页
     ·目的片段与T 载体连接、转化及鉴定第99页
     ·质粒的提取第99页
   ·3'RACE第99-100页
     ·3'RACE PCR 扩增第99-100页
     ·3'RACE PCR 产物的回收、纯化第100页
     ·3'RACE 目的片度与T 载体连接、转化和鉴定第100页
   ·5'RACE第100-102页
     ·RNA 的逆转录(cDNA 第一链的合成)第100页
     ·柱纯化cDNA 第一链合成产物第100-101页
     ·cDNA 第一链3’端加尾(TaKaRa TdT 试剂)第101页
     ·柱纯化cDNA 第一链3’端加尾产物第101页
     ·cDNA 第二链的合成第101页
     ·PCR 扩增第101-102页
     ·PCR 产物的回收、纯化、连接、转化和鉴定第102页
     ·目的片度与T 载体连接、转化和鉴定第102页
   ·含酶切位点ORF 的扩增第102-103页
   ·APX1 cDNA 的原核表达第103-106页
     ·载体酶切第104-105页
     ·PCR 回收产物酶切第105页
     ·连接第105页
     ·转化第105页
     ·阳性克隆子的筛选第105页
     ·测序第105页
     ·p32-APX1 克隆至大肠杆菌表达宿主第105-106页
   ·重组质粒诱导表达产物的APX 活性测定第106页
 2. 结果与分析第106-116页
   ·RNA 的质量第106-107页
   ·APX1 cDNA 全长的扩增结果第107-110页
     ·保守区扩增结果第107-108页
     ·3' RACE 结果第108-109页
     ·5' RACE 结果第109-110页
   ·APX1 cDNA 全长及其序列分析第110-113页
     ·全长序列拼接第110-111页
     ·APX1 ORF 推导的氨基酸与其它APX 氨基酸序列比对第111-112页
     ·APX1 cDNA 编码的氨基酸的性质及组成第112-113页
     ·编码蛋白质产物的疏水性分析第113页
   ·APX1 cDNA 的原核表达第113-116页
     ·APX1 cDNA ORF 的扩增第113-114页
     ·APX1 cDNA 插入载体pET-32a第114-115页
     ·p32-APX1 在Trans Rosetta(DE3)中的表达第115-116页
     ·重组质粒p32-APX1 原核表达产物活性测定第116页
 3 讨论第116-118页
第八章 琯溪蜜柚汁胞APX2 cDNA 的克隆及原核表达第118-135页
 1. 材料与方法第118-124页
   ·材料第118页
   ·琯溪蜜柚汁胞中APX2 cDNA 保守区的克隆第118-119页
     ·cDNA 第一链的合成第118页
     ·引物设计第118页
     ·RT-PCR第118-119页
     ·PCR 产物的回收纯化第119页
     ·目的片段与T 载体连接、转化及鉴定第119页
   ·3'RACE 和5'RACE 及全长的拼接第119-121页
     ·3'RACE第119-120页
     ·5'RACE第120-121页
   ·APX2 cDNA 的原核表达第121-124页
     ·含酶切位点ORF 的扩增第122-123页
     ·载体酶切第123页
     ·PCR 回收产物酶切第123页
     ·连接第123页
     ·转化第123-124页
     ·阳性克隆子的筛选第124页
     ·测序第124页
     ·p28-APX2 克隆至大肠杆菌表达宿主E.c oli BL21(DE3) 感受态细胞的制备第124页
 2. 结果与分析第124-133页
   ·保守区扩增结果第124-125页
   ·3' RACE 结果第125-126页
   ·5' RACE 结果第126-127页
   ·APX2 cDNA 全长及其序列分析第127-130页
     ·APX2 ORF 推导的氨基酸与其它APX 氨基酸序列比对第128-129页
     ·APX2 cDNA 编码的氨基酸的性质及组成第129-130页
     ·疏水性分析第130页
   ·APX 2 cDNA 的原核表达第130-133页
     ·APX 2 cDNA ORF 的扩增第130-131页
     ·APX 2 cDNA 插入载体pET-28a第131-132页
     ·p28-APX2 在E. coli BL21(DE3)中的表达第132-133页
     ·重组质粒PET28a-APX2 原核表达产物活性测定第133页
 3. 小结和讨论第133-135页
第九章 琯溪蜜柚汁胞差异蛋白质点ACTIN 与HSP cDNA 的克隆第135-147页
 1. 方法第137-139页
   ·琯溪蜜柚汁胞中ACTIN cDNA ORF 的克隆第137-138页
     ·cDNA 第一链的合成第137页
     ·引物设计第137页
     ·PCR 扩增第137页
     ·PCR 产物的回收纯化第137页
     ·目的片段与T 载体连接、转化及鉴定第137-138页
   ·琯溪蜜柚汁胞中HSP cDNA 的克隆第138-139页
     ·cDNA 第一链的合成第138页
     ·引物设计第138页
     ·PCR 扩增第138页
     ·PCR 产物的回收纯化第138页
     ·目的片段与T 载体连接、转化及鉴定第138-139页
 2. 结果与分析第139-144页
   ·ACTIN cDNA ORF 的克隆与分析第139-143页
     ·ACTIN ORF 扩增结果第139-140页
     ·ACTIN ORF 推导的氨基酸与其它ACTIN 氨基酸序列比对第140-141页
     ·ACTIN cDNA 编码的氨基酸的性质及组成第141-142页
     ·编码蛋白质产物的疏水性分析第142-143页
   ·HSP cDNA 的克隆与分析第143-144页
 3 讨论第144-147页
   ·ACTIN 在细胞中的作用第144-145页
   ·HSP 在细胞中的作用第145-147页
总结与展望第147-152页
 1. 总结第147-150页
 2. 展望第150-152页
参考文献第152-162页
在学期间发表的相关论文第162-164页
致谢第164页

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