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毛竹SSR位点引物开发及部分竹种系统学分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-16页
第一章 绪论第16-44页
   ·引言第16-17页
   ·国内外研究进展第17-40页
     ·竹类植物的世界分布第17页
     ·竹类植物的开发利用第17-18页
     ·竹类植物的分类研究历史及分类依据第18-23页
     ·竹类植物分类存在的问题第23-25页
     ·分子生物学分类方法第25-29页
     ·SSR 标记第29-31页
     ·SSR 标记的应用第31-33页
     ·SSR 标记在竹子分类中的应用第33-34页
     ·SSR 位点的开发策略第34-40页
   ·研究目标和研究内容第40-41页
     ·研究目标第40页
     ·研究内容第40-41页
   ·课题来源第41-42页
   ·研究技术路线第42-44页
第二章 微卫星富集文库的构建与筛选第44-65页
   ·材料与方法第45页
     ·样品采集及处理第45页
   ·实验仪器及药品第45-48页
     ·实验仪器第45页
     ·基因组DNA 提取试剂第45页
     ·基因组DNA 酶切、连接及PCR 试剂第45-46页
     ·磁珠回收试剂第46-47页
     ·感受态细胞的制备第47-48页
   ·试验方法第48-54页
     ·基因组DNA 的提取与纯化第48-49页
     ·基因组DNA 纯度和浓度检测第49页
     ·基因组AFLP 小片段的获得第49-51页
     ·SSR 富集文库的构建第51-53页
     ·阳性克隆的筛选第53-54页
   ·结果与分析第54-62页
     ·基因组DNA 的提取第54-55页
     ·基因组DNA 酶切体系的建立第55-57页
     ·磁珠回收效果检测第57-58页
     ·克隆PCR 检测第58-60页
     ·阳性菌落测序第60-61页
     ·微卫星文库的评估第61-62页
   ·讨论第62-64页
   ·小结第64-65页
第三章 毛竹SSR 富集文库序列分析第65-82页
   ·材料第65页
   ·软件工具第65页
   ·方法第65-66页
     ·载体及接头序列去除第65页
     ·冗余序列检测第65-66页
     ·序列分析第66页
     ·GenBank 序列上传第66页
   ·结果第66-79页
     ·载体及接头序列的去除第66页
     ·冗余序列检测结果第66-68页
     ·序列长度分析第68-69页
     ·SSR 位点统计第69-71页
     ·DNA 序列BLAST 比对分析第71-79页
   ·讨论第79-80页
   ·小结第80-82页
第四章 毛竹SSR 引物设计及位点特征分析第82-103页
   ·材料第82-83页
   ·方法第83-85页
     ·基因组DNA 的提取第83页
     ·引物设计第83-85页
   ·结果与分析第85-100页
     ·基因组DNA 提取第85页
     ·引物设计及PCR 条件确定第85-90页
     ·荧光标记引物SSR-PCR 毛细管电泳检测第90-91页
     ·微卫星位点特征分析第91-93页
     ·特异位点分析第93-100页
   ·讨论第100-101页
   ·小结第101-103页
第五章 部分竹种的SSR 标记系统学分析第103-116页
   ·前言第103页
   ·材料与试剂第103-106页
     ·材料第103-105页
     ·主要试剂第105-106页
     ·主要仪器第106页
   ·实验方法第106-107页
     ·基因组DNA 提取第106页
     ·微卫星位点引物选择第106页
     ·微卫星引物PCR第106-107页
     ·毛细管电泳检测第107页
     ·GeneMarker v 1.80 (val)软件分析产物长度第107页
     ·数据统计与分析第107页
   ·结果与分析第107-115页
     ·基因组DNA 的提取第107-108页
     ·PCR 扩增电泳检测第108-111页
     ·聚类分析第111-115页
   ·讨论第115页
   ·小结第115-116页
第六章 结论与展望第116-119页
   ·论文主要结论第116-117页
   ·展望第117-119页
参考文献第119-131页
攻读博士学位期间参加的科研项目第131页
攻读博士期间发表论文及专利情况第131页
作者简介第131-132页
致谢第132页

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