| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-34页 |
| 1 微卫星标记概述 | 第12-17页 |
| ·微卫星含量和分布 | 第12-13页 |
| ·微卫星的多态性 | 第13页 |
| ·微卫星标记的获得 | 第13-15页 |
| ·微卫星分子标记在水产动物中的应用 | 第15-17页 |
| 2 遗传连锁图谱概述 | 第17-28页 |
| ·遗传连锁图谱构建的理论基础及统计学原理 | 第17页 |
| ·遗传连锁图谱的构建和应用 | 第17-26页 |
| ·水产生物遗传连锁图谱的研究进展 | 第26-28页 |
| 3 水产生物QTL定位研究进展 | 第28-29页 |
| 4 研究的立论依据及目的意义 | 第29-34页 |
| ·大黄鱼资源及养殖现状 | 第29页 |
| ·大黄鱼遗传育种现状 | 第29-33页 |
| ·研究目的及意义 | 第33-34页 |
| 第二章 大黄鱼微卫星标记的开发 | 第34-50页 |
| 1 前言 | 第34页 |
| 2 材料与方法 | 第34-43页 |
| ·实验仪器 | 第34页 |
| ·主要试剂及溶液 | 第34-38页 |
| ·实验材料 | 第38页 |
| ·实验方法 | 第38-43页 |
| 3 结果与分析 | 第43-46页 |
| ·大黄鱼基因组DNA的提取 | 第43页 |
| ·接头连接、载体连接和磁珠富集结果 | 第43-44页 |
| ·测序结果及序列分析 | 第44页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第44-46页 |
| 4 讨论 | 第46-50页 |
| ·微卫星富集文库的效率 | 第46-48页 |
| ·微卫星标记的多态性检验 | 第48页 |
| ·群体的遗传多样性分析 | 第48-50页 |
| 第三章 大黄鱼EST-SSRs的筛选和跨种扩增 | 第50-60页 |
| 1 前言 | 第50页 |
| 2 材料与方法 | 第50-52页 |
| ·实验材料 | 第50-52页 |
| ·实验方法 | 第52页 |
| 3 结果与分析 | 第52-57页 |
| ·从大黄鱼EST数据库中筛选EST-SSRs | 第52-53页 |
| ·EST-SSRs的多态性分析 | 第53-55页 |
| ·EST-SSRs跨种扩增结果 | 第55-57页 |
| 4 讨论 | 第57-60页 |
| ·大黄鱼EST-SSRs核心重复的碱基组成 | 第57页 |
| ·EST-SSRs的多态性及官井洋野生群的遗传多样性分析 | 第57-59页 |
| ·多态EST-SSR位点的跨种扩增 | 第59-60页 |
| 第四章 作图家系的选择和亲本的基因分型 | 第60-69页 |
| 1 前言 | 第60页 |
| 2 材料与方法 | 第60-63页 |
| ·实验材料 | 第60-61页 |
| ·亲子鉴定及亲本繁殖贡献率分析 | 第61页 |
| ·作图家系的选择及微卫星标记的基因分型 | 第61-63页 |
| 3 结果与分析 | 第63-66页 |
| ·亲子鉴定及繁殖贡献率 | 第63-64页 |
| ·引物筛选结果 | 第64页 |
| ·微卫星标记的分离方式 | 第64-66页 |
| 4 讨论 | 第66-69页 |
| ·繁殖贡献率 | 第66-67页 |
| ·作图家系的选择 | 第67页 |
| ·微卫星标记的分离 | 第67-69页 |
| 第五章 大黄鱼遗传连锁图谱的构建 | 第69-85页 |
| 1 前言 | 第69页 |
| 2 材料与方法 | 第69-70页 |
| ·材料 | 第69页 |
| ·连锁分析和作图 | 第69-70页 |
| ·遗传连锁图谱预期长度和覆盖率 | 第70页 |
| 3 结果 | 第70-80页 |
| ·雌性连锁图谱 | 第70-71页 |
| ·雄性连锁图谱 | 第71-75页 |
| ·作图家系间个体重组率的差异 | 第75-78页 |
| ·基因组长度及图谱覆盖率 | 第78-79页 |
| ·雌雄个体间重组率的差异 | 第79-80页 |
| 4 讨论 | 第80-85页 |
| ·作图策略 | 第80-81页 |
| ·大黄鱼雌、雄连锁图谱 | 第81-82页 |
| ·性别间及家系间重组率的差异 | 第82-84页 |
| ·偏分离标记的分布 | 第84-85页 |
| 第六章 生长相关性状QTL的定位分析 | 第85-94页 |
| 1 前言 | 第85页 |
| 2 材料与方法 | 第85-86页 |
| ·材料 | 第85页 |
| ·表型数据测量 | 第85页 |
| ·各性状正态分布检测及之间的相关性分析 | 第85-86页 |
| ·QTL定位 | 第86页 |
| ·等位基因替代效应 | 第86页 |
| 3 结果 | 第86-91页 |
| ·性状分布 | 第86-87页 |
| ·各性状相关分析 | 第87-88页 |
| ·QTL定位 | 第88-91页 |
| 4 讨论 | 第91-94页 |
| ·QTL定位策略及亲本选择 | 第91页 |
| ·QTL定位 | 第91-94页 |
| 第七章 总结 | 第94-96页 |
| 1 研究结论 | 第94-95页 |
| 2 研究创新 | 第95页 |
| 3 展望 | 第95-96页 |
| 附表A EST-SSRs BLASTx分析 | 第96-98页 |
| 附表B 多态EST-SSRs BLASTx分析 | 第98-99页 |
| 附录C 本研究开发的大黄鱼微卫星标记 | 第99-109页 |
| 参考文献 | 第109-132页 |
| 致谢 | 第132-134页 |
| 作者简介 | 第134-135页 |
| 在学期间发表的论文及参加的科研项目 | 第135-136页 |