| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-33页 |
| 1 经典遗传学在动物遗传育种中的应用 | 第16-17页 |
| 2 QTL和QTL的提出 | 第17-22页 |
| ·QTL的概念 | 第17页 |
| ·主基因 | 第17-18页 |
| ·QTL的检测方法 | 第18-22页 |
| ·基因组扫描法 | 第18-19页 |
| ·基因组扫描法的基本步骤 | 第18-19页 |
| ·基因组扫描法存在的问题 | 第19页 |
| ·候选基因法 | 第19-22页 |
| ·候选基因法分析的步骤 | 第19-21页 |
| ·候选基因法检测存在的问题 | 第21页 |
| ·候选基因法检测到QTL的成功实例 | 第21-22页 |
| ·绘制QTL图谱所选用的群体 | 第22页 |
| 3 猪QTL定位研究进展 | 第22-25页 |
| ·肉质性状 | 第22-23页 |
| ·繁殖性状 | 第23-24页 |
| ·生长性状 | 第24-25页 |
| ·抗病性状 | 第25页 |
| 4 猪遗传图谱研究进展 | 第25-27页 |
| 5 统计方法 | 第27-28页 |
| 6 SNPs及其应用 | 第28-32页 |
| ·SNPs的概念及特点 | 第28页 |
| ·SNPs的检测方法 | 第28-31页 |
| ·PCR-测序的方法 | 第29页 |
| ·以构象为基础的方法 | 第29-30页 |
| ·PCR-SSCP | 第29-30页 |
| ·变性高压液相色谱法(DHPLC) | 第30页 |
| ·基于PCR的限制性片段长度多态性(PCR-RFLP) | 第30页 |
| ·基因芯片技术 | 第30-31页 |
| ·实时荧光PCR | 第31页 |
| ·SNP的应用 | 第31-32页 |
| 7 研究目的、意义和主要内容 | 第32-33页 |
| 第二章 SNP标记定位猪4号染色体QTL_s研究 | 第33-59页 |
| 1 材料与方法 | 第33-43页 |
| ·试验材料 | 第33-34页 |
| ·试验猪群 | 第33-34页 |
| ·性状的表型记录 | 第34页 |
| ·主要设备和仪器 | 第34页 |
| ·主要试剂和药品 | 第34-35页 |
| ·试剂 | 第34-35页 |
| ·主要试剂的配制 | 第35页 |
| ·猪耳组织中提取基因组DNA的方法 | 第35-36页 |
| ·SNP标记的选择 | 第36-38页 |
| ·PCR-RFLP | 第38-39页 |
| ·引物设计 | 第38页 |
| ·PCR扩增 | 第38页 |
| ·PCR反应程序 | 第38-39页 |
| ·限制性内切酶及产物大小 | 第39页 |
| ·酶切反应体系 | 第39页 |
| ·PCR-SSCP分析 | 第39-40页 |
| ·引物设计 | 第39-40页 |
| ·PCR扩增 | 第40页 |
| ·PCR扩增产物变性 | 第40页 |
| ·PCR-直接测序 | 第40页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第40页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第40-41页 |
| ·制胶 | 第41页 |
| ·点样和电泳 | 第41页 |
| ·银染染色 | 第41页 |
| ·凝胶成像及基因型分析 | 第41-42页 |
| ·主要分子生物学分析工具软件 | 第42页 |
| ·统计分析 | 第42-43页 |
| ·基因型频率和基因频率计算 | 第42页 |
| ·估计标记型效应的混合模型 | 第42-43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-53页 |
| ·PCR扩增产物的检测 | 第43-44页 |
| ·PCR-RFLP分析 | 第44-46页 |
| ·PCR-SSCP分析 | 第46-47页 |
| ·SORT1基因位点的直接测序(C/T突变) | 第47-48页 |
| ·各基因SNP位点的基因分型结果 | 第48-49页 |
| ·SNP标记分析与遗传连锁图谱的构建 | 第49页 |
| ·QTL的遗传效应和连锁位置 | 第49-53页 |
| ·猪pHI的QTL遗传效应和连锁位置 | 第49-50页 |
| ·猪pHU的QTL遗传效应和连锁位置 | 第50-51页 |
| ·猪背膘厚的QTL遗传效应和连锁位置 | 第51-52页 |
| ·猪屠宰重、日均屠宰重的QTL遗传效应和连锁位置 | 第52页 |
| ·定位猪4号染色体上显著QTL的错误概率分析 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-57页 |
| ·关于SNPs的检测 | 第53-55页 |
| ·关于QTL及QTL定位 | 第55页 |
| ·关于QTL | 第55页 |
| ·关于QTL定位 | 第55页 |
| ·关于资源家系 | 第55-56页 |
| ·猪4号染色体上的QTL | 第56-57页 |
| 4 小结 | 第57-59页 |
| 第三章 DECR1基因SNPS筛选及其与猪肉质、胴体性状的关联分析 | 第59-81页 |
| 1 前言 | 第59-64页 |
| ·关于线粒体2,4-双烯酰辅酶A还原酶1 | 第59-61页 |
| ·人DECR1基因的结构 | 第61页 |
| ·pH值与线粒体2,4—双烯酰辅酶A还原酶的关系 | 第61-63页 |
| ·关于猪的线粒体2,4-双烯酰辅酶A还原酶1 | 第63页 |
| ·猪DECR1与胴体和肉质性状的相关性 | 第63页 |
| ·研究目的与意义 | 第63-64页 |
| 2 材料与方法 | 第64-66页 |
| ·试验猪及样品采集 | 第64页 |
| ·主要设备和仪器 | 第64页 |
| ·主要试剂和药品 | 第64页 |
| ·试剂配制 | 第64页 |
| ·基因组DNA的提取和纯化 | 第64页 |
| ·猪DECR1基因SNP位点的PCR扩增 | 第64-65页 |
| ·PCR扩增引物的设计与合成 | 第64-65页 |
| ·PCR扩增反应体系 | 第65页 |
| ·PCR扩增反应程序 | 第65页 |
| ·PCR扩增产物检测和PCR-SSCP分析 | 第65页 |
| ·DECR1基因的测序分析 | 第65页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第65页 |
| ·主要分析软件 | 第65-66页 |
| ·统计分析方法 | 第66页 |
| 3 结果与分析 | 第66-76页 |
| ·猪与4个不同物种DECR1基因的同源性分析 | 第66-67页 |
| ·猪与4个不同物种DECR1基因蛋白质序列的同源性分析 | 第67页 |
| ·猪DECR1基因SNP的筛选 | 第67-68页 |
| ·猪DECR1基因Exon6和Exon8扩增产物检测 | 第68-69页 |
| ·猪DECR1基因Exon6产物扩增 | 第68页 |
| ·猪DECR1基因Exon8产物扩增 | 第68-69页 |
| ·猪DECR1基因Exon6和Exon8扩增产物的PCR-SSCP分析 | 第69-70页 |
| ·猪DECR1基因Exon6的PCR-SSCP检测 | 第69页 |
| ·猪DECR1基因Exon8的PCR-SSCP分析 | 第69-70页 |
| ·猪DECR1基因Exon6和Exon8的测序分析 | 第70-71页 |
| ·猪DECR1基因Exon6测序分析 | 第70页 |
| ·猪DECR1基因Exon8的测序分析 | 第70-71页 |
| ·猪DECR1基因Exon6和Exon8突变位点的多态性分析 | 第71-72页 |
| ·DECR1基因Exon6(C/T)位点的遗传多态性分析 | 第71页 |
| ·DECR1基因Exon8(C/G)位点的遗传多态性分析 | 第71-72页 |
| ·DECR1基因Exon6(C/T)多态性与猪经济性状的关联分析 | 第72-74页 |
| ·DECR1基因Exon6(C/T)多态性与猪肉质性状的关联分析 | 第72-73页 |
| ·DECR1基因Exon6(C/T)多态性与猪胴体性状的关联分析 | 第73-74页 |
| ·DECR1基因Exon8(C/G)多态性与猪经济性状的关联分析 | 第74-76页 |
| ·DECR1基因Exon8(C/G)多态性与猪肉质性状的关联分析 | 第74-75页 |
| ·DECR1基因Exon8(C/G)多态性与猪胴体性状的关联分析 | 第75-76页 |
| 4 讨论 | 第76-80页 |
| ·猪与4个不同物种DECR1基因同源性分析 | 第76-77页 |
| ·关于PCR引物的设计 | 第77页 |
| ·关于SNPs的筛选技术 | 第77-78页 |
| ·猪DECR1基因突变位点的遗传结构分析 | 第78页 |
| ·猪DECR1基因Exon6(C/T)位点的遗传结构分析 | 第78页 |
| ·猪DECR1基因Exon8(C/G)位点的遗传结构分析 | 第78页 |
| ·猪DECR1基因突变位点与肉质和胴体性状的相关性 | 第78-80页 |
| ·DECR1基因Exon6(C/T)位点与猪肉质性状的相关性 | 第79页 |
| ·DECR1基因Exon6(C/T)位点与猪胴体性状的相关性 | 第79页 |
| ·DECR1基因Exon8(C/G)位点与猪肉质性状的相关性 | 第79-80页 |
| ·DECR1基因Exon8(C/G)位点与猪胴体性状的相关性 | 第80页 |
| 5 小结 | 第80-81页 |
| 第四章 结论 | 第81-86页 |
| 1 主要研究结果 | 第81-83页 |
| 2 主要创新之处 | 第83-84页 |
| 3 问题与展望 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-96页 |
| 附录 | 第96-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 作者简历 | 第106页 |
| 博士在读期间的学术成果 | 第106页 |
