| 致谢 | 第4-11页 |
| 摘要 | 第11-14页 |
| 1 文献综述:脂质代谢的研究进展 | 第14-30页 |
| 1.1 脂质的种类 | 第14-15页 |
| 1.2 脂质代谢 | 第15-19页 |
| 1.2.1 脂肪生成 | 第15-16页 |
| 1.2.2 脂蛋白的组装与转运 | 第16-19页 |
| 1.2.3 脂蛋白的分解与利用 | 第19页 |
| 1.3 脂质代谢的调控 | 第19-27页 |
| 1.3.1 激素对脂质代谢的调控 | 第20-21页 |
| 1.3.2 营养物质对脂质代谢的调控 | 第21页 |
| 1.3.3 miRNAs对脂质代谢的调控 | 第21-24页 |
| 1.3.3.1 miRNA的生成 | 第21-22页 |
| 1.3.3.2 miRNAs的生物学功能 | 第22页 |
| 1.3.3.3 miRNA与肝脏脂质代谢调控 | 第22-24页 |
| 1.3.4 LncRNA对脂质代谢的调控 | 第24-27页 |
| 1.3.4.1 LncRNA的生物合成 | 第24页 |
| 1.3.4.2 LncRNA的生物学功能 | 第24-25页 |
| 1.3.4.3 LncRNA与肝脏脂肪代谢调控 | 第25-27页 |
| 1.4 转录组技术的发展及其在研究中的应用 | 第27-30页 |
| 2 引言 | 第30-32页 |
| 3 鸡产蛋期肝脏脂质代谢调控相关基因的研究 | 第32-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第32-37页 |
| 3.1.1 试验动物及组织样采集 | 第32页 |
| 3.1.2 RNA提取及检测 | 第32-33页 |
| 3.1.3 测序文库构建及测序 | 第33页 |
| 3.1.4 测序数据分析流程 | 第33-37页 |
| 3.1.4.1 测序数据预处理 | 第33-34页 |
| 3.1.4.2 测序数据与参考基因组比对 | 第34页 |
| 3.1.4.3 差异表达基因定量分析 | 第34页 |
| 3.1.4.4 实时荧光定量验证(qRT-PCR) | 第34-36页 |
| 3.1.4.5 差异基因生物信息学分析 | 第36页 |
| 3.1.4.6 新基因及可变剪接体分析 | 第36-37页 |
| 3.2 结果与分析 | 第37-52页 |
| 3.2.1 RNA样本质检 | 第37-38页 |
| 3.2.2 文库质量检测 | 第38-40页 |
| 3.2.3 测序质控分析 | 第40-41页 |
| 3.2.4 测序数据分析 | 第41-43页 |
| 3.2.5 差异表达基因分析 | 第43-50页 |
| 3.2.6 qRT-PCR验证 | 第50页 |
| 3.2.7 差异表达基因功能分析 | 第50-52页 |
| 3.3 讨论 | 第52-56页 |
| 4 鸡产蛋期肝脏中PNPLA3基因表达调控研究 | 第56-68页 |
| 4.1 材料与方法 | 第57-60页 |
| 4.1.1 试验动物及样品采集 | 第57页 |
| 4.1.2 试验主要仪器及试剂 | 第57页 |
| 4.1.3 雌激素处理体内试验 | 第57-58页 |
| 4.1.4 鸡胚肝脏原代细胞分离与培养 | 第58-59页 |
| 4.1.5 油红O脂肪染色 | 第59页 |
| 4.1.6 雌激素处理鸡胚肝脏原代细胞 | 第59页 |
| 4.1.7 反转录与实时荧光定量PCR | 第59-60页 |
| 4.1.8 数据统计与分析 | 第60页 |
| 4.2 结果 | 第60-66页 |
| 4.2.1 RNA提取及质量检测 | 第60-61页 |
| 4.2.2 鸡PNPLA3基因的组织表达规律 | 第61页 |
| 4.2.3 鸡PNPLA3基因在肝脏组织中的时空表达规律 | 第61-62页 |
| 4.2.4 雌激素处理对鸡肝脏组织中PNPLA3基因表达的影响 | 第62-63页 |
| 4.2.5 雌激素处理对鸡胚肝脏原代细胞PNPLA3基因表达的影响 | 第63-65页 |
| 4.2.6 雌激素受体拮抗剂对PNPLA3基因表达的影响 | 第65-66页 |
| 4.3 讨论 | 第66-68页 |
| 5 鸡肝脏脂肪代谢调控相关miRNA的研究 | 第68-86页 |
| 5.1 材料与方法 | 第68-71页 |
| 5.1.1 试验动物及样品采集 | 第68页 |
| 5.1.2 RNA提取及检测 | 第68页 |
| 5.1.3 测序文库构建及质量检测 | 第68-69页 |
| 5.1.4 数据分析流程 | 第69页 |
| 5.1.5 数据分析处理 | 第69-70页 |
| 5.1.6 QRT-PCR验证 | 第70页 |
| 5.1.7 miRNA靶基因预测及功能分析 | 第70-71页 |
| 5.2 结果与分析 | 第71-84页 |
| 5.2.1 RNA样本质量检测 | 第71页 |
| 5.2.2 测序文库质量检测 | 第71-73页 |
| 5.2.3 测序数据质控分析 | 第73-74页 |
| 5.2.4 小RNA序列分类注释 | 第74-75页 |
| 5.2.5 已知miRNAs鉴定及差异表达分析 | 第75-78页 |
| 5.2.6 新miRNAs鉴定 | 第78-80页 |
| 5.2.7 qRT-PCR鉴定差异表达miRNAs | 第80-81页 |
| 5.2.8 miRNAs靶基因预测及功能分析 | 第81-83页 |
| 5.2.9 miRNAs与靶基因整合分析 | 第83-84页 |
| 5.3 讨论 | 第84-86页 |
| 6 鸡miR-22-3p靶向调控ELOVL6基因表达 | 第86-102页 |
| 6.1 材料与方法 | 第86-92页 |
| 6.1.1 试验动物及样品采集 | 第86页 |
| 6.1.2 主要试剂及仪器 | 第86-87页 |
| 6.1.3 miR-22-3p靶基因预测及生物信息学分析 | 第87页 |
| 6.1.4 引物设计及载体构建 | 第87-91页 |
| 6.1.5 DF1细胞培养与转染 | 第91页 |
| 6.1.6 双荧光素酶报告基因活性检测 | 第91页 |
| 6.1.7 鸡胚肝脏原代细胞培养及处理 | 第91页 |
| 6.1.8 实时荧光定量PCR | 第91-92页 |
| 6.1.9 数据统计分析 | 第92页 |
| 6.2 结果分析 | 第92-100页 |
| 6.2.1 鸡miR-22-3p靶基因预测分析 | 第92-93页 |
| 6.2.2 miR-22-3p及其与ELOVL6的结合位点保守性分析 | 第93-94页 |
| 6.2.3 ELOVL6 3'UTR重组质粒构建与鉴定 | 第94-95页 |
| 6.2.4 鸡miR-22-3p与ELOVL6在肝脏中表达 | 第95-96页 |
| 6.2.5 鸡miR-22-3p和ELOVL6组织表达特异性分析 | 第96-97页 |
| 6.2.6 鸡miR-22-3p和ELOVL6在肝脏组织中的时空表达规律 | 第97-98页 |
| 6.2.7 鸡miR-22-3p与ELOVL6的靶向关系鉴定 | 第98-99页 |
| 6.2.8 过表达miR-22-3p对肝脏细胞ELOVL6表达的影响 | 第99-100页 |
| 6.3 讨论 | 第100-102页 |
| 7 鸡肝脏脂质代谢调控相关长链非编码RNA的研究 | 第102-114页 |
| 7.1 材料与方法 | 第102-105页 |
| 7.1.1 试验动物及样品采集 | 第102-103页 |
| 7.1.2 RNA提取及检测 | 第103页 |
| 7.1.3 测序文库构建及质量检测 | 第103页 |
| 7.1.4 上机测序及数据质量控制 | 第103页 |
| 7.1.5 测序数据分析流程 | 第103页 |
| 7.1.6 lncRNA差异表达分析 | 第103页 |
| 7.1.7 实时荧光定量PCR | 第103-104页 |
| 7.1.8 lncRNA靶基因预测 | 第104-105页 |
| 7.1.9 差异表达lncRNA靶基因生物信息学分析 | 第105页 |
| 7.1.10 差异表达lncRNA-mRNA-miRNA之间的整合分析 | 第105页 |
| 7.2 结果与分析 | 第105-112页 |
| 7.2.1 鸡肝脏中差异表达lncRNA分析 | 第105-108页 |
| 7.2.2 qRT-PCR验证差异表达lncRNA | 第108-109页 |
| 7.2.3 lncRNA靶基因功能注释分析 | 第109-110页 |
| 7.2.4 lncRNA-mRNA-miRNA整合分析 | 第110-112页 |
| 7.3 讨论 | 第112-114页 |
| 8 LncLER在鸡肝脏中表达调控的研究 | 第114-122页 |
| 8.1 材料与方法 | 第114-117页 |
| 8.1.1 试验样品 | 第114-115页 |
| 8.1.2 主要试剂配制 | 第115页 |
| 8.1.3 引物设计与合成 | 第115页 |
| 8.1.4 总RNA提取与反转录 | 第115-116页 |
| 8.1.5 半定量RT-PCR | 第116页 |
| 8.1.6 实时荧光定量PCR | 第116页 |
| 8.1.7 鸡胚胎肝脏原代细胞培养及处理 | 第116页 |
| 8.1.8 雌激素处理鸡胚胎肝脏原代细胞 | 第116-117页 |
| 8.1.9 数据统计分析 | 第117页 |
| 8.2 结果分析 | 第117-120页 |
| 8.2.1 LncLER的筛选和鉴别 | 第117页 |
| 8.2.2 不同组织中lncLER的表达量分析 | 第117-118页 |
| 8.2.3 鸡肝脏中lncLER的时空表达规律 | 第118页 |
| 8.2.4 雌激素处理对鸡肝脏lncLER表达的影响 | 第118-119页 |
| 8.2.5 雌激素处理鸡胚胎肝脏原代细胞对lncLER表达的影响 | 第119-120页 |
| 8.3 讨论 | 第120-122页 |
| 9 全文结论及创新点 | 第122-124页 |
| 9.1 全文结论 | 第122-123页 |
| 9.2 创新点 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-140页 |
| Abstract | 第140-143页 |
| 个人简介 | 第144-146页 |
