| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-36页 |
| 1.1 玉米的重要性及生物强化 | 第13页 |
| 1.2 生育酚的研究进展 | 第13-26页 |
| 1.2.1 生育酚简介 | 第13-15页 |
| 1.2.2 生育酚的生物合成途径 | 第15-20页 |
| 1.2.2.1 核心途径 | 第15-18页 |
| 1.2.2.2 高等植物中其他调控生育酚基因 | 第18-20页 |
| 1.2.3 植物中生育酚自然变异的正向遗传研究 | 第20-24页 |
| 1.2.4 植物生育酚基因工程 | 第24-26页 |
| 1.3 植物关联分析 | 第26-30页 |
| 1.3.1 连锁不平衡与关联分析 | 第26页 |
| 1.3.2 关联分析简介 | 第26-27页 |
| 1.3.3 关联分析的统计方法 | 第27-28页 |
| 1.3.4 关联分析在玉米中的研究进展 | 第28-30页 |
| 1.4 连锁分析(即QTL定位) | 第30-35页 |
| 1.4.1 QTL与分子标记简介 | 第30页 |
| 1.4.2 QTL定位方法 | 第30-32页 |
| 1.4.3 QTL定位群体 | 第32页 |
| 1.4.4 图位克隆与精细定位 | 第32-33页 |
| 1.4.5 结合关联分析与连锁分析的优势 | 第33-35页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第35-36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-46页 |
| 2.1 材料来源 | 第36页 |
| 2.2 田间试验 | 第36页 |
| 2.3 高通量基因型数据的获得 | 第36-37页 |
| 2.4 生育酚含量测定 | 第37-39页 |
| 2.5 全基因组关联分析 | 第39-40页 |
| 2.5.1 表型统计分析 | 第39页 |
| 2.5.2 全基因组关联分析 | 第39-40页 |
| 2.6 基因注释 | 第40页 |
| 2.7 候选基因的GO分析 | 第40-41页 |
| 2.8 候选基因重测序 | 第41页 |
| 2.9 关联群体转录组及eQTL分析 | 第41-42页 |
| 2.10 基因互作网络构建 | 第42页 |
| 2.11 连锁分析 | 第42-43页 |
| 2.11.1 表型统计分析 | 第42页 |
| 2.11.2 QTL定位 | 第42-43页 |
| 2.11.3 QTL上位检测 | 第43页 |
| 2.12 利用剩余杂合家系(HIF)进行精细定位 | 第43-46页 |
| 2.12.1 分子标记的开发 | 第44-45页 |
| 2.12.2 重组筛选及后代测验 | 第45-46页 |
| 3 结果与分析 | 第46-83页 |
| 3.1 全基因组关联分析 | 第46-64页 |
| 3.1.1 关联群体的生育酚表型统计分析 | 第46-48页 |
| 3.1.2 全基因组关联分析结果 | 第48-61页 |
| 3.1.2.1 有利等位基因的分布 | 第55-56页 |
| 3.1.2.2 重点候选基因的分析 | 第56-59页 |
| 3.1.2.3 候选基因重测序及候选基因关联分析 | 第59-61页 |
| 3.1.3 根据转录组数据构建生育酚途径调控网络 | 第61-64页 |
| 3.2 利用6个重组自交系(RIL)群体进行连锁分析 | 第64-77页 |
| 3.2.1 表型统计分析 | 第65-70页 |
| 3.2.2 6个RIL群体的QTL定位 | 第70-74页 |
| 3.2.3 QTL互作 | 第74页 |
| 3.2.4 连锁分析与GWAS的结果比较 | 第74-77页 |
| 3.3 一个主效QTL(qVTE8)的精细定位 | 第77-83页 |
| 4 讨论 | 第83-87页 |
| 参考文献 | 第87-105页 |
| 附录 | 第105-137页 |
| 附录A 附表 | 第105-129页 |
| 附录B 本研究所用重要引物 | 第129-130页 |
| 附录C 常用实验方法 | 第130-135页 |
| I CTAB法少量提取植物叶片DNA | 第130-131页 |
| II PCR扩增体系 | 第131页 |
| III 6%聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第131-133页 |
| IV KASP标记的开发与鉴定 | 第133-135页 |
| 附录D 作者简介 | 第135-137页 |
| 作者简介 | 第135页 |
| 在读期间发表的论文 | 第135-136页 |
| 会议摘要和海报 | 第136-137页 |
| 致谢 | 第137-139页 |