| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词一览表 | 第11-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-46页 |
| 1.1 植物与微生物互作 | 第15-19页 |
| 1.1.1 有利互作 | 第15-16页 |
| 1.1.2 有害互作 | 第16-19页 |
| 1.2 根瘤菌与豆科植物共生 | 第19-27页 |
| 1.2.1 生物固氮简介 | 第19-21页 |
| 1.2.2 共生固氮的起源与进化 | 第21-23页 |
| 1.2.3 根瘤菌的多样性 | 第23-25页 |
| 1.2.4 豆科植物分类与进化 | 第25-27页 |
| 1.3 共生固氮的场所-根瘤 | 第27-32页 |
| 1.3.1 根瘤菌的侵染方式 | 第27-28页 |
| 1.3.2 根瘤的发育形成过程 | 第28-29页 |
| 1.3.3 根瘤内部的类菌体分化 | 第29-32页 |
| 1.4 根瘤菌与豆科植物互作早期的分子对话 | 第32-37页 |
| 1.4.1 (类)黄酮招募根瘤菌 | 第32-33页 |
| 1.4.2 根瘤菌分泌的化学因子 | 第33-35页 |
| 1.4.3 宿主感知化学因子的受体 | 第35-37页 |
| 1.5 根瘤菌与豆科植物的共生混杂性 | 第37-44页 |
| 1.5.1 混杂性根瘤菌 | 第37-38页 |
| 1.5.2 混杂性宿主 | 第38页 |
| 1.5.3 混杂性共生的分子机制 | 第38-44页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第44-45页 |
| 1.7 本研究总的技术路线 | 第45-46页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第46-59页 |
| 2.1 实验材料 | 第46-49页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第46页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第46-47页 |
| 2.1.3 植物材料 | 第47页 |
| 2.1.4 本论文所用到的引物和质粒 | 第47-49页 |
| 2.2 实验方法 | 第49-59页 |
| 2.2.1 根瘤菌的分离纯化和保藏 | 第49页 |
| 2.2.2 植物种子的萌发与培养 | 第49页 |
| 2.2.3 根瘤菌DNA抽提 | 第49-50页 |
| 2.2.4 根瘤菌接种实验和交叉结瘤 | 第50-51页 |
| 2.2.4 采样点土壤因子分析 | 第51页 |
| 2.2.5 根瘤菌物种分布与土壤因子相关性分析 | 第51页 |
| 2.2.6 GenGIS生物地理分布作图 | 第51-52页 |
| 2.2.7 基因扩增与构建系统发育树 | 第52页 |
| 2.2.8 甲苯胺蓝染色切片和电镜切片 | 第52页 |
| 2.2.9 根瘤菌侵染过程观察 | 第52-53页 |
| 2.2.10 LacZ染色 | 第53页 |
| 2.2.11 碳源利用测定 | 第53页 |
| 2.2.12 其他表型鉴定实验 | 第53-55页 |
| 2.2.13 BOX-PCR指纹图谱 | 第55页 |
| 2.2.14 苦参RNA样品的制备 | 第55-56页 |
| 2.2.15 转录组数据方法 | 第56-57页 |
| 2.2.16 苦参结瘤因子受体NFP的扩增与建树 | 第57-58页 |
| 2.2.17 蒺藜苜蓿根毛转染 | 第58-59页 |
| 第三章 苦参根瘤菌多样性调查及侵染和结瘤研究 | 第59-84页 |
| 3.1 研究背景 | 第59页 |
| 3.2 实验结果 | 第59-81页 |
| 3.2.1 根瘤菌的分离鉴定和采样地土壤理化性质分析 | 第59页 |
| 3.2.2 根瘤菌多样性和地理分布分析 | 第59-67页 |
| 3.2.3 土壤因子影响根瘤菌地理分布 | 第67-68页 |
| 3.2.4 交叉结瘤实验 | 第68-69页 |
| 3.2.5 根瘤菌结瘤和固氮基因系统发育多样性 | 第69-76页 |
| 3.2.6 侵染过程 | 第76-77页 |
| 3.2.7 根瘤切片观察 | 第77-79页 |
| 3.2.8 电镜照片观察类菌体状态 | 第79-81页 |
| 3.3 结论和讨论 | 第81-84页 |
| 第四章 苦参根瘤菌属两个新种的鉴定 | 第84-93页 |
| 4.1 研究背景 | 第84页 |
| 4.2 实验结果与讨论 | 第84-93页 |
| 4.2.1 系统发育比较 | 第84-87页 |
| 4.2.2 表型性状 | 第87-90页 |
| 4.2.3 新种描述 | 第90-93页 |
| 第五章 苦参叶瘤杆菌属新种的鉴定 | 第93-101页 |
| 5.1 研究背景 | 第93页 |
| 5.2 实验结果与讨论 | 第93-101页 |
| 5.2.1 系统发育比较 | 第93-97页 |
| 5.2.2 表型性状 | 第97-100页 |
| 5.2.3 新种描述 | 第100-101页 |
| 第六章 利用转录组学鉴定苦参结瘤因子受体NFP及其功能验证 | 第101-113页 |
| 6.1 研究背景 | 第101页 |
| 6.2 研究结果与讨论 | 第101-113页 |
| 6.2.1 转录组数据评估 | 第101-102页 |
| 6.2.2 转录组数据注释结果 | 第102-105页 |
| 6.2.3 豆科植物NFP系统发育比较 | 第105-106页 |
| 6.2.4 蛋白序列比较 | 第106-107页 |
| 6.2.5 苦参NFP能够完全回补蒺藜苜蓿(Medicago truncatula) nfp突变体 | 第107-110页 |
| 6.2.6 与蒺藜苜蓿共生不匹配的根瘤菌R.yanglingense CCBAU 01603诱导转SfNFP的nfp植株结瘤 | 第110-113页 |
| 第七章 苦参高效根瘤菌的筛选与田间试验 | 第113-119页 |
| 7.1 研究背景 | 第113页 |
| 7.2 研究结果与讨论 | 第113-119页 |
| 7.2.1 蛭石条件下筛选高效菌株 | 第113-115页 |
| 7.2.2 蛭石条件竞争结瘤 | 第115-116页 |
| 7.2.3 土壤与蛭石混合介质验证高效菌株固氮能力 | 第116-117页 |
| 7.2.4 大田验证高效菌株 | 第117页 |
| 7.2.5 考察长治基地的豆科苦参与玉米间作种植 | 第117-119页 |
| 第八章 结论与展望 | 第119-122页 |
| 8.1 结论 | 第119页 |
| 8.2 展望 | 第119-122页 |
| 参考文献 | 第122-140页 |
| 个人简历 | 第140-142页 |
| 致谢 | 第142-144页 |
