| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 缩略词表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-31页 |
| 1.1 引言 | 第14-15页 |
| 1.2 悬铃木国内外研究进展 | 第15页 |
| 1.3 成花诱导及花发育分子机理 | 第15-23页 |
| 1.3.1 成花诱导调控机理 | 第15-21页 |
| 1.3.1.1 光周期途径 | 第15-17页 |
| 1.3.1.2 温度途径 | 第17-19页 |
| 1.3.1.3 赤霉素途径 | 第19-21页 |
| 1.3.1.4 年龄途径 | 第21页 |
| 1.3.2 花序分生组织及花分生组织决定 | 第21-22页 |
| 1.3.3 花器官发育调控机理 | 第22-23页 |
| 1.4 植物生长阶段转变研究进展 | 第23-30页 |
| 1.4.1 植物在不同生长阶段表观差异及持续时间 | 第23-24页 |
| 1.4.2 不同生长阶段与激素的关系 | 第24-25页 |
| 1.4.2.1 IAA与生长阶段 | 第24页 |
| 1.4.2.2 GA与生长阶段 | 第24-25页 |
| 1.4.2.3 ABA与生长阶段 | 第25页 |
| 1.4.2.4 CTK以及其他激素与生长阶段 | 第25页 |
| 1.4.3 生长阶段与植物的抗逆性 | 第25-26页 |
| 1.4.4 生长阶段转换相关的蛋白质研究 | 第26页 |
| 1.4.5 调控生长阶段转变的分子机制 | 第26-29页 |
| 1.4.6 植物生长阶段转换机制研究中存在的疑问 | 第29-30页 |
| 1.5 本研究的目的及意义 | 第30-31页 |
| 第二章 悬铃木转录组及成花诱导过程表达谱差异分析 | 第31-65页 |
| 2.1 前言 | 第31页 |
| 2.2 材料与方法 | 第31-35页 |
| 2.2.1 植物材料 | 第31-32页 |
| 2.2.2 总RNA的提取及反转录 | 第32页 |
| 2.2.3 文库构建和转录组及DEG测序 | 第32页 |
| 2.2.4 转录组组装及功能注释 | 第32-33页 |
| 2.2.5 基因表达量计算 | 第33页 |
| 2.2.6 差异基因筛选及功能注释 | 第33-34页 |
| 2.2.7 相关基因qPCR验证 | 第34-35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-59页 |
| 2.3.1 RNA提取质量检测 | 第35页 |
| 2.3.2 转录组测序及分析 | 第35-39页 |
| 2.3.2.1 悬铃木转录组测序情况汇总 | 第35-37页 |
| 2.3.2.2 转录组基因功能注释及分析 | 第37页 |
| 2.3.2.3 悬铃木转录组GO分类注释 | 第37-38页 |
| 2.3.2.4 悬铃木转录组COG分类注释 | 第38-39页 |
| 2.3.3 悬铃木成花诱导过程数字表达谱测序分析 | 第39-59页 |
| 2.3.3.1 悬铃木成花诱导数字表达谱测序情况汇总 | 第39-40页 |
| 2.3.3.2 悬铃木成花诱导三个阶段基因差异数量分析 | 第40-42页 |
| 2.3.3.3 悬铃木成花诱导过程三个阶段差异基因KEGG代谢路径富集分析 | 第42-47页 |
| 2.3.3.4 悬铃木成花诱导过程三个阶段差异基因GO功能注释及显著性富集分析 | 第47-48页 |
| 2.3.3.5 激素合成相关基因分析 | 第48-50页 |
| 2.3.3.6 悬铃木转录组转录因子预测及筛选 | 第50-51页 |
| 2.3.3.7 对基因进行表达模式聚类分析 | 第51-54页 |
| 2.3.3.8 开花途径关键基因分析 | 第54-55页 |
| 2.3.3.9 MADS-box基因表达水平聚类分析 | 第55-57页 |
| 2.3.3.10 利用qPCR验证测序结果 | 第57-59页 |
| 2.4 讨论 | 第59-65页 |
| 2.4.1 转录组测序为研究悬铃木成花诱导机理提供了基础数据 | 第59页 |
| 2.4.2 悬铃木成花诱导过程中在花序原基分化期基因表达变化剧烈 | 第59-60页 |
| 2.4.3 植物激素对于成花诱导的作用 | 第60-61页 |
| 2.4.4 转录因子在悬铃木成花诱导阶段发挥功能 | 第61-63页 |
| 2.4.5 MADS-box基因在悬铃木成花诱导过程中可能的功能 | 第63-64页 |
| 2.4.6 多遗传背景复合分析 | 第64-65页 |
| 第三章 处于不同生长阶段悬铃木柄下芽表达谱分析 | 第65-93页 |
| 3.1 前言 | 第65页 |
| 3.2 材料和方法 | 第65-68页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第65-66页 |
| 3.2.2 总RNA的提取及反转录 | 第66页 |
| 3.2.3 文库构建及DEG测序 | 第66页 |
| 3.2.4 基因表达量计算 | 第66页 |
| 3.2.5 差异基因筛选及功能注释 | 第66页 |
| 3.2.6 相关基因qPCR验证 | 第66-68页 |
| 3.3 结果与分析 | 第68-85页 |
| 3.3.1 RNA提取质量检测 | 第68页 |
| 3.3.2 不同生长阶段悬铃木柄下芽表达谱测序分析 | 第68-85页 |
| 3.3.2.1 不同生长阶段悬铃木柄下芽表达谱测序情况汇总 | 第68-69页 |
| 3.3.2.2 不同生长阶段悬铃木柄下芽差异基因数量分析 | 第69-71页 |
| 3.3.2.3 不同生长阶段悬铃木柄下芽差异基因KEGG及GO富集分析 | 第71页 |
| 3.3.2.4 开花途径关键基因分析 | 第71-74页 |
| 3.3.2.5 对筛选出的存在表达差异的开花相关基因在额外株系中验证 | 第74-76页 |
| 3.3.2.6 差异表达转录因子筛选分析 | 第76-79页 |
| 3.3.2.7 差异表达基因的筛选分析 | 第79-80页 |
| 3.3.2.8 利用qPCR验证测序结果 | 第80-85页 |
| 3.4 讨论 | 第85-93页 |
| 3.4.1 表达谱分析为研究生长阶段转换调控机理提供了大量数据 | 第85-86页 |
| 3.4.2 木质化以及激素和生长阶段的关系 | 第86页 |
| 3.4.3 悬铃木开花相关基因与生长阶段转变的关系 | 第86-88页 |
| 3.4.4 悬铃木FUL,SEP3同源基因可能起到的作用 | 第88-89页 |
| 3.4.5 不同生长阶段悬铃木中存在差异表达的转录因子 | 第89-92页 |
| 3.4.6 其他差异基因调控生长阶段的可能 | 第92页 |
| 3.4.7 多遗传背景复合分析 | 第92-93页 |
| 第四章 悬铃木SPL3同源基因克隆,表达分析及功能研究 | 第93-111页 |
| 4.1 前言 | 第93页 |
| 4.2 材料与方法 | 第93-98页 |
| 4.2.1 植物生长环境及处理 | 第93-94页 |
| 4.2.2 菌株和载体 | 第94页 |
| 4.2.3 主要分子生物学试剂 | 第94页 |
| 4.2.4 仪器设备 | 第94-95页 |
| 4.2.5 基因组DNA,总RNA提取及cDNA合成 | 第95页 |
| 4.2.6 基因克隆及序列分析 | 第95-96页 |
| 4.2.7 序列比对分析及系统进化树构建 | 第96-97页 |
| 4.2.8 基因表达分析 | 第97页 |
| 4.2.9 悬铃木PaSPL3表达载体构建,植物转化及开花时间检测 | 第97-98页 |
| 4.2.10 数据统计分析 | 第98页 |
| 4.3 结果与分析 | 第98-107页 |
| 4.3.1 悬铃木PaSPL3同源基因分子克隆及序列分析 | 第98-100页 |
| 4.3.2 悬铃木PaSPL3基因表达模式 | 第100-102页 |
| 4.3.3 悬铃木PaSPL3异源超量表达实验分析 | 第102-104页 |
| 4.3.4 悬铃木PaSPL3基因在叶片中的表达呈现季节性变化 | 第104页 |
| 4.3.5 悬铃木PaSPL3基因受温度变化的调控 | 第104-106页 |
| 4.3.6 悬铃木PaSPL3基因不同生长阶段悬铃木中的表达 | 第106-107页 |
| 4.4 讨论 | 第107-111页 |
| 4.4.1 PaSPL3为悬铃木中SPL3/4/5同源基因 | 第107-108页 |
| 4.4.2 PaSPL3对于开花调控功能探讨 | 第108-109页 |
| 4.4.3 PaSPL3对环境因子反应以及在生长阶段转变中的功能 | 第109-111页 |
| 第五章 悬铃木CO同源基因克隆,表达分析及功能研究 | 第111-128页 |
| 5.1 前言 | 第111页 |
| 5.2 材料与方法 | 第111-115页 |
| 5.2.1 植物材料及处理 | 第111页 |
| 5.2.2 菌株和载体 | 第111页 |
| 5.2.3 主要分子生物学试剂 | 第111页 |
| 5.2.4 仪器设备 | 第111页 |
| 5.2.5 基因组DNA,RNA提取及cDNA合成 | 第111页 |
| 5.2.6 基因克隆及引物设计 | 第111-113页 |
| 5.2.7 PaCOL1/2基因序列及系谱进化树构建分析 | 第113-114页 |
| 5.2.8 时空表达分析 | 第114页 |
| 5.2.9 数据统计及处理分析 | 第114页 |
| 5.2.10 载体构建及模式植物转化 | 第114-115页 |
| 5.2.11 数据统计分析 | 第115页 |
| 5.3 结果与分析 | 第115-124页 |
| 5.3.1 悬铃木PaCOL1/2基因结构分析及系谱进化分析 | 第115-117页 |
| 5.3.2 悬铃木PaCOL1/2在不同组织中表达模式 | 第117-118页 |
| 5.3.3 悬铃木PaCOL1/2基因在一天周期内表达情况 | 第118-121页 |
| 5.3.4 悬铃木PaCOL1/2基因在不同季节及不同温度下表达 | 第121-122页 |
| 5.3.5 悬铃木PaCOL1/2基因在不同生长阶段下植株中表达 | 第122-123页 |
| 5.3.6 悬铃木PaCOL1/2基因转基因表型分析 | 第123-124页 |
| 5.4 讨论 | 第124-128页 |
| 5.4.1 PaCOL1/2基因功能探讨 | 第124-127页 |
| 5.4.2 PaCOL1/2促进开花能力的探讨 | 第127-128页 |
| 第六章 总结与展望 | 第128-131页 |
| 6.1 悬铃木成花诱导分子机制 | 第128页 |
| 6.2 控制悬铃木生长阶段转换可能的分子机理 | 第128-129页 |
| 6.3 激活悬铃木成花诱导过程可能的因子 | 第129页 |
| 6.4 悬铃木SPL3,CO同源基因的功能可能与拟南芥不同 | 第129页 |
| 6.5 组学研究方法对于悬铃木育种的应用前景 | 第129-131页 |
| 参考文献 | 第131-157页 |
| 博士在读期间已发表或拟发表文章情况 | 第157-158页 |
| 致谢 | 第158-159页 |
