| 符号说明 | 第4-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-30页 |
| 1.1 Netrin 与 Fra 的结构研究现状 | 第12-15页 |
| 1.1.1 Netrin 家族 | 第12-13页 |
| 1.1.2 Fra 的同源体和分子结构 | 第13-14页 |
| 1.1.3 Netrin 的其他受体 | 第14-15页 |
| 1.2 Netrin 与 Fra 的功能研究现状 | 第15-18页 |
| 1.2.1 轴突导向与轴突延伸 | 第15页 |
| 1.2.2 轴突分支、定位与突触发生 | 第15-16页 |
| 1.2.3 树突的形态发生 | 第16页 |
| 1.2.4 控制细胞的迁移 | 第16页 |
| 1.2.5 组织器官的发生和发育 | 第16-17页 |
| 1.2.6 肿瘤抑制作用与“依赖型受体”假说 | 第17页 |
| 1.2.7 其他功能 | 第17-18页 |
| 1.3 fra 的调控 | 第18页 |
| 1.4 Netrin 与 Fra 的互作机制 | 第18-22页 |
| 1.4.1 Fra 作为 Netrin 的受体发挥作用 | 第18页 |
| 1.4.2 Fra 通过信号转导分子对轴突运动和轴突生长起吸引作用 | 第18-20页 |
| 1.4.3 Netrin 与 Fra 的捕捉-再定位模型 | 第20-21页 |
| 1.4.4 Fra 通过激活 commissureless 的转录对轴突跨越中线起吸引作用 | 第21页 |
| 1.4.5 Fra 与 UNC-5 结合表现为 UNC-5 的排斥作用 | 第21页 |
| 1.4.6 Fra 的吸引功能受 Slit 和 Robo 的抑制 | 第21-22页 |
| 1.5 基因家族分子进化机制研究进展 | 第22-25页 |
| 1.5.1 基因复制 | 第22页 |
| 1.5.2 复制基因的命运 | 第22-24页 |
| 1.5.2.1 保守进化 | 第22-23页 |
| 1.5.2.2 亚功能化 | 第23页 |
| 1.5.2.3 新功能化 | 第23-24页 |
| 1.5.2.4 假基因化 | 第24页 |
| 1.5.3 分子水平上的适应性进化与中性进化 | 第24页 |
| 1.5.4 基因适应性进化的 dN/dS 检验 | 第24-25页 |
| 1.6 共进化的研究方法 | 第25-27页 |
| 1.6.1 多重序列比对法 | 第25-26页 |
| 1.6.2 相关分析法 | 第26页 |
| 1.6.3 系统发生树分析 | 第26页 |
| 1.6.4 系统发育谱法 | 第26-27页 |
| 1.6.5 实验法 | 第27页 |
| 1.7 Netrin 与 Fra 的进化研究进展 | 第27-28页 |
| 1.8 本研究的目的与意义 | 第28-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-34页 |
| 2.1 材料 | 第30页 |
| 2.1.1 本研究所用网站 | 第30页 |
| 2.1.2 本研究所用软件 | 第30页 |
| 2.2 方法 | 第30-34页 |
| 2.2.1 序列的搜集以及多重序列比对 | 第30-31页 |
| 2.2.1.1 序列的搜集 | 第30-31页 |
| 2.2.1.2 序列的多重比对 | 第31页 |
| 2.2.2 蛋白质结构分析 | 第31-32页 |
| 2.2.3 系统发生树的构建 | 第32页 |
| 2.2.4 相关分析 | 第32页 |
| 2.2.5 选择压力分析 | 第32-33页 |
| 2.2.5.1 实验设计与分组 | 第32页 |
| 2.2.5.2 选择压力的计算 | 第32-33页 |
| 2.2.6 蛋白质三维结构预测 | 第33-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-49页 |
| 3.1 Netrin 的进化分析 | 第34-36页 |
| 3.1.1 Netrin 的系统发生分析 | 第34-35页 |
| 3.1.2 Netrin 的蛋白质结构分析 | 第35-36页 |
| 3.2 Fra 的进化分析 | 第36-39页 |
| 3.2.1 Fra 的系统发生分析 | 第36-38页 |
| 3.2.2 Fra 的蛋白质结构分析 | 第38-39页 |
| 3.3 Netrin 和 Fra 的共进化 | 第39-49页 |
| 3.3.1 Netrin 和 Fra 共进化的特点 | 第39-41页 |
| 3.3.1.1 Netrin 和 Fra 的系统发生树的比较 | 第39-40页 |
| 3.3.1.2 Netrin 和 Fra 的相关分析 | 第40-41页 |
| 3.3.2 netrin 和 fra 的选择压力分析 | 第41-49页 |
| 3.3.2.1 无脊椎类 netrin 和 fra 的选择压力分析 | 第41-43页 |
| 3.3.2.2 无脊椎类 netrin 和 fra 互作区的正选择位点分析 | 第43-44页 |
| 3.3.2.3 脊椎动物 netrin 和 fra 的选择压力分析 | 第44-46页 |
| 3.3.2.4 脊椎类 netrin 和 fra 互作区的正选择位点分析 | 第46-49页 |
| 4 讨论 | 第49-55页 |
| 4.1 Netrin 与 Fra 的起源 | 第49页 |
| 4.2 Netrin 与 Fra 在进化过程中的结构变化 | 第49-50页 |
| 4.3 基因的复制与丢失 | 第50-51页 |
| 4.4 Netrin 与 Fra 的序列分析 | 第51-55页 |
| 4.4.1 同源基因的确定 | 第51-52页 |
| 4.4.2 Netrin 与 Fra 的相关分析 | 第52页 |
| 4.4.3 netrin 与 fra 的选择压力分析 | 第52-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-66页 |
| 附录一（netrin 基因序列号） | 第66-74页 |
| 附录二（fra 基因序列号） | 第74-77页 |
| 附录三（gapdh 基因序列号） | 第77-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第80页 |
