| 中文摘要 | 第3-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 细胞膜蛋白质组学技术研究进展 | 第18-46页 |
| 1.1 哺乳动物细胞质膜的结构与功能简述 | 第21-22页 |
| 1.2 膜的富集和膜蛋白的制备 | 第22-27页 |
| 1.2.1 细胞质膜的分离富集 | 第22-26页 |
| 1.2.2 膜蛋白的抽提与溶解 | 第26-27页 |
| 1.3 膜蛋白的分离策略 | 第27-31页 |
| 1.3.1 基于电泳系统的分离策略 | 第28-30页 |
| 1.3.2 基于色谱系统的分离策略 | 第30-31页 |
| 1.4 膜蛋白的酶解与鉴定 | 第31-37页 |
| 1.4.1 膜蛋白的酶解 | 第31-34页 |
| 1.4.2 膜蛋白的鉴定 | 第34-37页 |
| 1.5 膜蛋白的生物信息学分析 | 第37-38页 |
| 1.6 定量膜蛋白质组研究 | 第38-42页 |
| 1.6.1 2DE-MS技术路线 | 第38-39页 |
| 1.6.2 稳定同位素标记技术路线 | 第39-41页 |
| 1.6.3 非标记定量技术路线 | 第41-42页 |
| 1.7 膜蛋白质组研究总结与展望 | 第42-46页 |
| 第二章 脱氧胆酸钠辅助难酶解蛋白的酶解与鉴定 | 第46-66页 |
| 2.1 前言 | 第46-48页 |
| 2.2 材料和方法 | 第48-55页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第48-49页 |
| 2.2.2 胰蛋白酶活性测定 | 第49页 |
| 2.2.3 SDC与质谱兼容性分析 | 第49-50页 |
| 2.2.4 肌红蛋白的去折叠和酶解 | 第50页 |
| 2.2.5 标准蛋白质混合物的酶解 | 第50-51页 |
| 2.2.6 大鼠海马膜富集组分的制备 | 第51页 |
| 2.2.7 大鼠海马膜蛋白的酶解 | 第51-52页 |
| 2.2.8 肌红蛋白的MALDI-TOF MS分析和鉴定 | 第52-53页 |
| 2.2.9 CapLC-MS/MS分析和蛋白质鉴定 | 第53页 |
| 2.2.10 数据处理和生物信息学分析 | 第53-55页 |
| 2.3 结果和讨论 | 第55-64页 |
| 2.3.1 SDC对胰蛋白酶活性的影响 | 第55-56页 |
| 2.3.2 SDC对肌红蛋白变性和酶解的影响 | 第56-58页 |
| 2.3.3 SDC与质谱的兼容性 | 第58-60页 |
| 2.3.4 标准蛋白质混合物的鉴定 | 第60-61页 |
| 2.3.5 大鼠海马膜蛋白的鉴定 | 第61-64页 |
| 2.4 结论 | 第64-66页 |
| 第三章 膜蛋白质组鸟枪法分析中酸不溶性去垢剂去除方法的评估与优化 | 第66-84页 |
| 3.1 前言 | 第66-68页 |
| 3.2 材料和方法 | 第68-73页 |
| 3.2.1 材料和试剂 | 第68页 |
| 3.2.2 大鼠肝脏质膜(PMs)的富集 | 第68-69页 |
| 3.2.3 大鼠肝脏质膜富集样本的溶液酶解 | 第69页 |
| 3.2.4 两种去除SDC方法的比较 | 第69-70页 |
| 3.2.5 SDC去除方法的优化 | 第70页 |
| 3.2.6 紫外检测和质谱分析肽段的损失 | 第70-71页 |
| 3.2.7 CapLC-MS/MS分析 | 第71页 |
| 3.2.8 数据处理和生物信息学分析 | 第71-73页 |
| 3.3 结果 | 第73-81页 |
| 3.3.1 紫外检测和质谱分析SDC去除过程中的肽段损失 | 第73-75页 |
| 3.3.2 不同SDC去除方法对肽段和蛋白质鉴定的影响 | 第75-81页 |
| 3.4 讨论 | 第81-84页 |
| 第四章 月桂酸钠在大鼠肝脏膜蛋白质组分析中的应用研究 | 第84-108页 |
| 4.1 引言 | 第84-86页 |
| 4.2 材料和方法 | 第86-93页 |
| 4.2.1 材料和试剂 | 第86-87页 |
| 4.2.2 大鼠肝脏质膜组分的制备 | 第87-88页 |
| 4.2.3 几种不同去垢剂溶解抽提膜蛋白的效果比较 | 第88页 |
| 4.2.4 去垢剂对胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶活性的影响 | 第88-89页 |
| 4.2.5 相转移法去除去垢剂 | 第89页 |
| 4.2.6 SL与质谱的兼容性分析 | 第89-90页 |
| 4.2.7 标准蛋白混合物的溶液酶解 | 第90页 |
| 4.2.8 大鼠肝脏质膜组分的溶液酶解 | 第90-91页 |
| 4.2.9 CapLC-MS/MS分析 | 第91-92页 |
| 4.2.10 数据处理和生物信息学分析 | 第92-93页 |
| 4.3 结果和讨论 | 第93-105页 |
| 4.3.1 去垢剂的结构分析 | 第93-94页 |
| 4.3.2 溶解膜片能力的比较 | 第94-96页 |
| 4.3.3 SL对蛋白酶活性的影响 | 第96-97页 |
| 4.3.4 SL与质谱的兼容性 | 第97-98页 |
| 4.3.5 标准蛋白质混合物的鉴定 | 第98-101页 |
| 4.3.6 大鼠肝脏膜蛋白的鉴定 | 第101-105页 |
| 4.4 结论 | 第105-108页 |
| 第五章 通过电转移和DMF辅助的酶解和肽段回收提高胶分离蛋白质的鉴定效率 | 第108-134页 |
| 5.1 前言 | 第108-110页 |
| 5.2 材料和方法 | 第110-117页 |
| 5.2.1 材料和试剂 | 第110页 |
| 5.2.2 标准蛋白质混合物的SDS-PAGE和不同方法的酶解 | 第110-113页 |
| 5.2.3 MALDI-TOF MS分析 | 第113-114页 |
| 5.2.4 大鼠海马细胞质膜的富集与蛋白质的分析 | 第114-115页 |
| 5.2.5 CapLC-MS/MS分析 | 第115-116页 |
| 5.2.6 数据处理和生物信息学分析 | 第116-117页 |
| 5.3 结果 | 第117-134页 |
| 5.3.1 DMF和PVDF浓度的优化 | 第117-119页 |
| 5.3.2 不同酶解方法的比较 | 第119-123页 |
| 5.3.3 大鼠海马膜富集样品中蛋白质的比较分析 | 第123-129页 |
| 5.3.4 讨论 | 第129-134页 |
| 第六章 主要研究结果与进一步研究设想 | 第134-138页 |
| 6.1 主要研究结论 | 第134-136页 |
| 6.2 进一步研究设想 | 第136-138页 |
| 参考文献 | 第138-164页 |
| 缩写表 | 第164-166页 |
| 附表3.1 | 第166-168页 |
| 附表5.1 | 第168-195页 |
| 附表5.2 | 第195-201页 |
| 附表5.3 | 第201-202页 |
| 攻读学位期间发表论文目录 | 第202-204页 |
| 致谢 | 第204-206页 |
