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以秀丽线虫为模式生物研究可变剪接在低氧应答中的调控作用

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 文献综述第11-21页
   ·模式生物秀丽线虫中的低氧应答研究第11-14页
     ·HIF-1 介导的通路第12-13页
     ·胰岛素/胰岛素样受体DAF-2 通路第13-14页
     ·热休克蛋白及其他第14页
   ·可变剪接及其在低氧应答中调控作用第14-19页
     ·可变剪接(Alternative Splicing,AS)第15页
     ·HIF-1 的可变剪接在缺氧应答中的调控作用第15-16页
     ·脯氨酰羟化酶家族新成员: PHD(Proline Hydroxylase Domain)的可变剪接在缺氧应答中的调控作用第16-17页
     ·血管内皮生长因子(Vascular endothelial growth factor,VEGF)的可变剪接在缺氧应答中的调控作用第17页
     ·可变剪接在缺氧相关疾病中的调控作用第17-19页
   ·本研究的内容、目的及意义第19-21页
第二章 利用RNAi 文库筛查秀丽线虫体内与缺氧相关的剪接调节因子及其靶基因第21-30页
   ·材料第21-22页
     ·实验动物及试剂第21页
     ·实验仪器第21-22页
   ·方法第22-26页
     ·秀丽线虫饲养第22页
     ·利用CaCl_2 法制备HT115 感受态细胞第22页
     ·用于RNA 干涉的对照菌液的制备第22-23页
     ·秀丽线虫同步化培养第23页
     ·喂饲RNAi 流程第23-24页
     ·线虫的物理缺氧第24页
     ·规模化筛选影响缺氧损伤表型的基因第24-25页
     ·测序鉴定筛选的阳性克隆第25-26页
   ·结果第26-28页
     ·喂饲RNAi 筛选有效性检测第26-28页
   ·讨论第28-30页
第三章 利用功能丧失型突变株系验证RNAi 文库的筛查结果第30-39页
   ·材料第30-31页
     ·实验动物及试剂第30页
     ·实验仪器第30-31页
   ·方法第31-35页
     ·秀丽线虫饲养第31页
     ·基因功能丧失型突变株系的鉴定第31-33页
     ·基因功能丧失型突变株系的回交第33-34页
     ·秀丽线虫的同步化培养第34页
     ·秀丽线虫的缺氧处理第34页
     ·统计分析第34-35页
   ·结果第35-37页
     ·功能丧失型突变株系的鉴定第35页
     ·突变株系的回交第35-36页
     ·缺氧处理线虫突变株系第36-37页
   ·讨论第37-39页
第四章 物理缺氧模型中egl-9 剪接变体表达模式的变化第39-49页
   ·材料第40页
     ·实验动物第40页
     ·试剂第40页
   ·方法第40-44页
     ·线虫同步化培养第40页
     ·线虫的物理缺氧第40页
     ·线虫总RNA 的提取第40-41页
     ·反转录反应第41-42页
     ·设计鉴定egl-9 剪接变体的引物第42-43页
     ·PCR 检测基因egl-9 剪接变体缺氧前后的表达变化第43页
     ·PCR 产物测序鉴定第43-44页
     ·统计分析第44页
   ·结果第44-47页
     ·提取的总RNA 质量鉴定第44-45页
     ·egl-9 剪接变体缺氧前后mRNA 表达水平的变化第45-47页
   ·讨论第47-49页
第五章 egl-9 剪接变体表达载体的构建及转基因线虫的制备与鉴定第49-66页
   ·材料第49-50页
     ·实验动物及材料第49-50页
     ·试剂第50页
   ·方法第50-59页
     ·设计egl-9 剪接变体的扩增引物第50页
     ·线虫总RNA 的提取第50-51页
     ·RT 反应第51页
     ·剪接变体表达载体的构建第51-55页
     ·转基因线虫的制备第55-58页
     ·转基因线虫的鉴定第58-59页
   ·结果第59-63页
     ·构建egl-9 剪接变体的表达载体第59-60页
     ·成功制备转基因线虫第60-62页
     ·转基因线虫的鉴定第62-63页
   ·讨论第63-66页
第六章 结论第66-67页
参考文献第67-72页
附录第72-77页
致谢第77-78页
作者简介第78页
攻读学位期间发表或投稿的文章第78页

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