TITLE PAGE | 第2-3页 |
ACKNOWLEDGMENT | 第3-4页 |
DECLARATION | 第4-5页 |
CERTIFICATION | 第5-6页 |
SOURCE OF PROJECT | 第6-7页 |
TABLE OF CONTENTS | 第7-10页 |
ABSTRACT IN ENGLISH | 第10页 |
ABSTRACT IN CHINESE | 第12-13页 |
Part Ⅰ Literature review | 第13-39页 |
CHARTER Ⅰ General introduction to Vibrio parahaemolyticus | 第14-21页 |
1.1 V. parahaemoloyticus as the etiological agent | 第14-16页 |
1.1.1 Morphlogy | 第14-15页 |
1.1.2 Culture Characteristics | 第15页 |
1.1.3 Antigenic Structure | 第15-16页 |
1.2 Health Impact | 第16-17页 |
1.2.1 Epidemiology | 第16页 |
1.2.2 Symptoms and mode of transmission | 第16-17页 |
1.3 Prevalence and incidence of V. parahaemolyticus | 第17-18页 |
References | 第18-21页 |
CHARTER Ⅱ Recent advances on molecular identification and typing of Vibrio parahaemolyticus | 第21-39页 |
2.1 Detection of V. parahaemolyticus by conventional methods | 第21-22页 |
2.2 Immunology methods | 第22-24页 |
2.3 Molecular methods | 第24-27页 |
2.3.1 PCR methods | 第24-26页 |
2.3.2 Real time PCR | 第26页 |
2.3.3 DNA hybridization | 第26-27页 |
2.4 Molecular typing | 第27-30页 |
2.4.1 Random amplified polymorphic DNA (RAPD) typing | 第27-28页 |
2.4.2 ERIC-PCR typing | 第28页 |
2.4.3 Ribotyping | 第28-29页 |
2.4.4 Restriction fragment length polymorphism (RFLP) | 第29页 |
2.4.5 Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) | 第29-30页 |
References | 第30-39页 |
Part Ⅱ Experimental section | 第39-67页 |
CHAPTER Ⅲ Development of duplex PCR for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus | 第40-50页 |
3.1 Materials | 第41-42页 |
3.2 Methods | 第42-44页 |
3.2.1 Bacterial culture and preparation of genomic DNA | 第42页 |
3.2.2 Optimized PCR conditions | 第42-43页 |
3.2.3 Specificity and sensitivity testing | 第43页 |
3.2.4 Preparation of artificially contaminated shrimps | 第43-44页 |
3.3 Results | 第44-47页 |
3.3.1 Optimization of the duplex PCR conditions | 第44页 |
3.3.2 Specificity and sensitivity | 第44-45页 |
3.3.3 Detection of V. parahemolyticum in artificially contaminated shrimps | 第45-47页 |
3.4 Discussion | 第47-48页 |
References | 第48-50页 |
CHAPTER Ⅳ Isolation of Vibrio parahaemolyticus in seafoods using conventional methods followed by duplex PCR | 第50-58页 |
4.1 Materials | 第51页 |
4.2 Method | 第51-54页 |
4.2.1 Collection, transportation and preparation of samples | 第51-52页 |
4.2.2 Identification of V. parahaemolyticus by conventional methods | 第52-53页 |
4.2.3 Detection of V. parahaemolyticus by PCR | 第53-54页 |
4.3 Results | 第54-56页 |
4.3.1 Biochemical tests | 第54页 |
4.3.2 Duplex PCR results | 第54-56页 |
4.4 Discussion | 第56页 |
References | 第56-58页 |
CHAPTER Ⅴ Preliminary typing of V. parahaemolyticus isolates by pulsed-field gel electrophoresis | 第58-67页 |
5.1 Materials | 第59-60页 |
5.2 Methods | 第60-62页 |
5.2.1 Preparation of Unsheared DNA | 第60页 |
5.2.2 DNA Restriction | 第60-61页 |
5.2.3 Separation of DNA Fragments by PFGE | 第61-62页 |
5.3 Results and Discussion | 第62-65页 |
References | 第65-67页 |
Conclusions and Recommendations | 第67-68页 |
Appendix A Culture media | 第68-70页 |
Appendix B Reagents | 第70页 |