摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
引言 | 第10-12页 |
第一章 绪论 | 第12-18页 |
1.1 B细胞表位预测研究背景 | 第12-13页 |
1.1.1 免疫系统及免疫信息学 | 第12-13页 |
1.1.2 B细胞表位 | 第13页 |
1.2 研究的目的与意义 | 第13-14页 |
1.3 国内外研究现状 | 第14-16页 |
1.4 本文主要研究内容 | 第16-18页 |
第二章 B细胞表位预测方法基础研究 | 第18-33页 |
2.1 B细胞表位预测方法简介 | 第18-22页 |
2.1.1 基于序列特征的B细胞表位预测 | 第18-19页 |
2.1.2 基于抗原 3D结构的B细胞表位预测 | 第19-20页 |
2.1.3 基于抗原抗体结合特异性的B细胞表位预测 | 第20页 |
2.1.4 基于模拟表位的B细胞表位预测 | 第20-22页 |
2.2 B细胞表位预测数据库介绍 | 第22-26页 |
2.2.1 Protein Data Bank(PDB) | 第23页 |
2.2.2 Immune Epitope Database (IEDB) | 第23-24页 |
2.2.3 Mimotope Database(MimoDB) | 第24-25页 |
2.2.4 Mimotope Benchmark Datasets | 第25-26页 |
2.3 本文选取的构象性B细胞表位的预测特征分析 | 第26-32页 |
2.3.1 数据集选取 | 第26-28页 |
2.3.2 预测特征分析 | 第28-32页 |
2.4 本章小结 | 第32-33页 |
第三章 基于模拟表位和抗原抗体结合特异性的构象性B细胞表位预测算法研究 | 第33-50页 |
3.1 算法思想 | 第33页 |
3.2 算法流程 | 第33-43页 |
3.2.1 背景数据集 | 第33-34页 |
3.2.2 测试数据集 | 第34-35页 |
3.2.3 相关工具介绍 | 第35-38页 |
3.2.4 算法流程 | 第38-43页 |
3.3 算法预测结果分析 | 第43-49页 |
3.3.1 评价参数 | 第43-44页 |
3.3.2 影响预测结果的因素 | 第44-46页 |
3.3.3 测试集预测结果 | 第46-47页 |
3.3.4 与其他算法的比较 | 第47-49页 |
3.4 本章小结 | 第49-50页 |
第四章 基于模拟表位和抗原 3D结构信息的构象性B细胞表位预测算法研究 | 第50-59页 |
4.1 算法思想 | 第50-51页 |
4.2 算法流程 | 第51-53页 |
4.2.1 测试数据集 | 第51-52页 |
4.2.2 算法流程 | 第52-53页 |
4.3 算法预测结果分析 | 第53-58页 |
4.3.1 评价参数 | 第53页 |
4.3.2 影响预测结果的因素 | 第53-54页 |
4.3.3 测试集预测结果 | 第54-56页 |
4.3.4 与其他算法的比较 | 第56-58页 |
4.4 本章小结 | 第58-59页 |
第五章 基于表位属性信息融合的构象性B细胞表位预测算法研究 | 第59-66页 |
5.1 算法思想 | 第59页 |
5.2 算法流程 | 第59-62页 |
5.2.1 背景数据集 | 第59页 |
5.2.2 测试数据集 | 第59-60页 |
5.2.3 相关工具介绍 | 第60页 |
5.2.4 算法流程 | 第60-62页 |
5.3 算法预测结果分析 | 第62-65页 |
5.3.1 评价参数 | 第62页 |
5.3.2 影响预测结果的因素 | 第62-63页 |
5.3.3 测试集预测结果 | 第63-64页 |
5.3.4 与其他算法的比较 | 第64-65页 |
5.4 本章小结 | 第65-66页 |
第六章 基于信息融合和计算智能的构象性B细胞表位预测平台实现 | 第66-75页 |
6.1 预测平台算法思想 | 第67-68页 |
6.2 预测平台开发 | 第68-74页 |
6.3 本章小结 | 第74-75页 |
第七章 总结与展望 | 第75-77页 |
7.1 总结 | 第75页 |
7.2 展望 | 第75-77页 |
参考文献 | 第77-83页 |
致谢 | 第83-84页 |
在学期间公开发表论文及著作情况 | 第84页 |