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基于高通量测序的南方典型旅游城市空气细菌群落特征研究

摘要第3-8页
ABSTRACT第8-15页
第一章 绪论第23-35页
    1 前言第23页
    2 研究目的和意义第23-26页
    3 空气微生物研究概况第26-30页
        3.1 空气微生物研究方法第26-28页
        3.2 空气微生物研究进展第28-30页
    4 研究内容与技术路线第30-33页
        4.1 研究内容第30-32页
            4.1.1 杭州市空气微生物不同时空的多样性群落特征研究第31页
            4.1.2 西湖景区空气中微生物多样性特征研究第31页
            4.1.3 不同高度对空气微生物群落特征的影响研究第31页
            4.1.4 不同天气状况对空气微生物群落特征的影响研究第31页
            4.1.5 杭州市空气微生物与影响因素的关系研究第31-32页
        4.2 研究思路与技术路线第32-33页
    5 本章小结第33-35页
第二章 杭州市空气细菌群落时空变化特征研究第35-70页
    1 前言第35页
    2 研究材料与方法第35-47页
        2.1 研究样点简介第35-36页
        2.2 空气微生物浓度与粒径研究第36-38页
            2.2.1 空气微生物取样器介绍第36页
            2.2.2 取样方法第36-37页
            2.2.3 培养方法第37页
            2.2.4 空气微生物浓度计算方法第37-38页
            2.2.5 空气微生物粒径计算方法第38页
            2.2.6 统计分析和图表制作方法第38页
        2.3 空气细菌群落特征研究第38-46页
            2.3.1 取样器介绍第39页
            2.3.2 采样方法第39-40页
            2.3.3 液体样品浓缩方法第40页
            2.3.4 DNA提取方法第40-41页
            2.3.5 PCR扩增方法第41-42页
            2.3.6 高通量测序第42页
            2.3.7 分析方法说明第42-45页
            2.3.8 数据分析使用软件第45-46页
            2.3.9 数据分析使用数据库第46页
        2.4 主要试剂与仪器第46-47页
            2.4.1 实验用主要仪器第46页
            2.4.2 空气微生物浓度与粒径测定实验用主要试剂第46-47页
            2.4.3 空气细菌群落特征检测实验用主要试剂第47页
    3 结果与分析第47-68页
        3.1 杭州市空气微生物浓度的分布特征第47-49页
            3.1.1 杭州市空气细菌和真菌浓度空间分布特征第47-48页
            3.1.2 杭州市空气细菌和真菌浓度季节分布特征第48-49页
        3.2 杭州市空气细菌和真菌粒径分布特征第49-50页
            3.2.1 空气细菌粒径分布特征第49-50页
            3.2.2 空气真菌粒径分布特征第50页
        3.3 杭州市不同样点空气细菌群落结构特征第50-67页
            3.3.1 不同样点空气细菌Miseq数据量第50-51页
            3.3.2 杭州市不同样点空气细菌OTU分析第51-55页
                3.3.2.1 各样点不同季节OTU分析第51-53页
                3.3.2.2 各季节不同样点空气细菌OTU分析第53-55页
            3.3.3 杭州市空气细菌群落结构时空变化特征第55-62页
                3.3.3.1 不同样点空气细菌群落在门水平上季节变化特征第55-59页
                3.3.3.2 不同样点空气细菌群落在属水平上季节变化特征第59-62页
            3.3.4 各季节不同样点物种丰度热图第62-64页
            3.3.5 各季节不同样点空气细菌α多样性分析第64页
            3.3.6 各季节不同样点β多样性分析第64-67页
                3.3.6.1 样本聚类图第65-66页
                3.3.6.2 各样点不同季节空气细菌PCA分析第66-67页
        3.4 杭州市各样点不同季节空气细菌病原性分析第67-68页
    4 本章小结第68-70页
第三章 杭州市西湖景区空气细菌特征研究第70-87页
    1 前言第70页
    2 研究材料与方法第70-72页
        2.1 研究样点概况第70-71页
        2.2 西湖景区空气微生物浓度与粒径研究第71页
            2.2.1 空气微生物取样器简介第71页
            2.2.2 样品采集方法第71页
            2.2.3 样本培养方法第71页
            2.2.4 空气微生物浓度计算与统计分析方法第71页
        2.3 不同高度空气细菌菌群特征研究第71-72页
            2.3.1 采样器介绍第71页
            2.3.2 采样方法第71-72页
            2.3.3 液体样品浓缩方法第72页
            2.3.4 DNA提取方法第72页
            2.3.5 PCR扩增方法第72页
            2.3.6 高通量测序第72页
            2.3.7 分析方法说明第72页
            2.3.8 数据分析使用软件及数据库第72页
        2.4 主要试剂与仪器第72页
    3 结果与分析第72-86页
        3.1 西湖景区空气微生物浓度的分布特征第72-74页
            3.1.1 西湖景区空气细菌和真菌浓度空间分布特征第72-73页
            3.1.2 西湖景区空气细菌和真菌浓度季节分布特征第73-74页
        3.2 西湖景区空气细菌和真菌粒径分布特征第74-76页
            3.2.1 空气细菌粒径分布特征第74-75页
            3.2.2 空气真菌粒径分布特征第75-76页
        3.3 西湖景区空气细菌群落结构特征第76-84页
            3.3.1 西湖景区不同样点Miseq数据量第76页
            3.3.2 西湖景区不同样点OUT分析第76-77页
            3.3.3 西湖景区不同样点空气细菌群落结构分析第77-80页
                3.3.3.1 空气细菌在门水平上相对含量第77-78页
                3.3.3.2 空气细菌在科水平上相对含量第78-79页
                3.3.3.3 空气细菌在属水平上相对含量第79-80页
            3.3.4 西湖景区不同样点物种丰度热图第80-81页
            3.3.5 西湖景区不同样点空气细菌α多样性分析第81-82页
            3.3.6 西湖景区不同样点空气细菌β多样性分析第82-84页
                3.3.6.1 样本聚类分析第82页
                3.3.6.2 样本距离盒状图第82-83页
                3.3.6.3 PCA分析第83-84页
        3.4 西湖景区不同样点空气细菌病原性分析第84-86页
    4 本章小结第86-87页
第四章 不同高度对空气细菌特征的影响研究第87-102页
    1 前言第87页
    2 材料与方法第87-89页
        2.1 采样点概况第87-88页
        2.2 空气微生物在不同高度的浓度与粒径研究第88页
            2.2.1 空气微生物取样器简介第88页
            2.2.2 样品采集方法第88页
            2.2.3 样本培养方法第88页
            2.2.4 空气微生物浓度计算与统计分析方法第88页
        2.3 不同高度空气细菌菌群特征研究第88-89页
            2.3.1 采样器介绍第88页
            2.3.2 采样方法第88页
            2.3.3 液体样品浓缩方法第88-89页
            2.3.4 DNA提取方法第89页
            2.3.5 PCR扩增方法第89页
            2.3.6 高通量测序第89页
            2.3.7 分析方法说明第89页
            2.3.8 数据分析使用软件及数据库第89页
        2.4 主要试剂与仪器第89页
    3 结果与分析第89-101页
        3.1 不同高度空气微生物浓度的分布特征第89-91页
            3.1.1 不同高度对空气细菌和真菌浓度的影响第89-90页
            3.1.2 不同高度空气细菌和真菌浓度季节分布特征第90-91页
        3.2 不同高度空气细菌和真菌粒径分布特征第91-92页
            3.2.1 空气细菌粒径分布特征第91-92页
            3.2.2 空气真菌粒径分布特征第92页
        3.3 不同高度空气细菌群落结构特征第92-99页
            3.3.1 不同高度空气细菌Miseq数据量第92-93页
            3.3.2 不同高度对空气细菌OTU的影响第93页
            3.3.3 不同高度对空气细菌群落结构的影响第93-96页
                3.3.3.1 空气细菌门水平上相对含量第93-94页
                3.3.3.2 空气细菌科水平上相对含量第94-95页
                3.3.3.3 空气细菌属水平上相对含量第95-96页
            3.3.4 不同高度空气细菌物种丰度热图第96-97页
            3.3.5 不同高度空气细菌α多样性分析第97-98页
            3.3.6 不同高度空气细菌β多样性分析第98-99页
                3.3.6.1 样本聚类与差异性分析第98-99页
                3.3.6.2 样本距离盒状图第99页
        3.4 不同高度空气细菌病原性分析第99-101页
    4 本章小结第101-102页
第五章 天气特征对杭州市空气细菌群落结构的影响研究第102-115页
    1 前言第102页
    2 材料与方法第102-104页
        2.1 取样点概况第102-103页
        2.2 采样器介绍第103页
        2.3 采样方法及取样天气概况第103页
        2.4 液体样品浓缩方法第103页
        2.5 DNA提取方法第103页
        2.6 PCR扩增方法第103-104页
        2.7 高通量测序第104页
        2.8 分析方法说明第104页
        2.9 数据分析使用软件及数据库第104页
        2.10 主要试剂与仪器第104页
    3 结果与分析第104-113页
        3.1 不同天气空气细菌样本Miseq数据量第104页
        3.2 天气特征对空气中微生物OTU数量的影响第104-105页
        3.3 天气对空气细菌菌群结构的影响第105-108页
            3.3.1 不同天气空气微生物门水平上相对含量第105-106页
            3.3.2 不同天气空气微生物科水平上相对含量第106-107页
            3.3.3 不同天气空气微生物属水平上相对含量第107-108页
        3.4 物种丰度热图第108-109页
        3.5 不同天气空气细菌α多样性分析第109-110页
        3.6 不同天气空气细菌β多样性分析第110-112页
            3.6.1 样本聚类分析第110页
            3.6.2 不同天气空气细菌样本距离盒状图第110-111页
            3.6.3 PCA分析第111-112页
        3.7 不同天气空气细菌病原性分析第112-113页
    4 本章小结第113-115页
第六章 杭州市空气微生物特征与影响因素的关系研究第115-128页
    1 前言第115页
    2 材料与方法第115-117页
        2.1 空气微生物浓度与污染因子关系研究第115-116页
            2.1.1 取样点概况第115页
            2.1.2 空气微生物采样器介绍第115-116页
            2.1.3 样品采集方法第116页
            2.1.4 样本培养方法第116页
            2.1.5 空气微生物浓度计算与统计分析方法第116页
            2.1.6 空气质量数据来源第116页
        2.2 极端高温天气对空气微生物影响研究第116-117页
            2.2.1 研究样点概况第116页
            2.2.2 采样器介绍第116-117页
            2.2.3 采样方法第117页
            2.2.4 液体样品浓缩方法第117页
            2.2.5 DNA提取方法第117页
            2.2.6 PCR扩增方法第117页
            2.2.7 高通量测序第117页
            2.2.8 分析方法说明第117页
            2.2.9 数据分析使用软件及数据库第117页
        2.3 主要试剂与仪器第117页
    3 结果与分析第117-126页
        3.1 空气微生物浓度与污染因子的关系第117-122页
            3.1.1 空气微生物浓度与空气质量指数的关系第117-118页
            3.1.2 空气微生物浓度与二氧化硫浓度的关系第118-119页
            3.1.3 空气微生物浓度与二氧化氮浓度的关系第119页
            3.1.4 空气微生物浓度与臭氧浓度的关系第119-120页
            3.1.5 空气微生物浓度与一氧化碳浓度的关系第120页
            3.1.6 空气微生物与PM2.5浓度的关系第120-121页
            3.1.7 空气微生物浓度与PM10浓度的关系第121-122页
        3.2 极端高温天气对杭州城市空气微生物特征的影响研究第122-126页
            3.2.1 极端高温天气概况第122页
            3.2.2 极端高温天气前后空气微生物16SrDNA基因拷贝数分析第122-123页
            3.2.3 极端高温天气前后空气微生物群落结构分析第123-126页
    4 本章小结第126-128页
第七章 结论与展望第128-134页
    1 主要结论第128-133页
        1.1 杭州市空气微生物时空变化特征第128-129页
        1.2 杭州市西湖景区空气微生物群落特征第129-130页
        1.3 不同高度空气微生物群落特征第130-131页
        1.4 天气特征对杭州市空气细菌群落结构的影响第131-132页
        1.5 杭州市空气微生物特征与影响因素的关系第132-133页
    2 建议与展望第133-134页
参考文献第134-143页
攻读硕士学位期间主持参与项目及论文发表情况第143-144页
致谢第144-146页

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