| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词 | 第13-14页 |
| 上篇 利用近等基因系对水稻抽穗期QTL-DTH3B的精细定位 | 第14-46页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-26页 |
| 1 植物开花的基本研究 | 第14-18页 |
| 1.1 植物开花的成花素假说 | 第14-15页 |
| 1.2 调控植物开花的信号途径 | 第15-18页 |
| 1.2.1 光周期途径 | 第15-16页 |
| 1.2.2 春化途径 | 第16-17页 |
| 1.2.3 赤霉素途径 | 第17页 |
| 1.2.4 自主开花途径 | 第17-18页 |
| 1.2.5 年龄途径 | 第18页 |
| 2 水稻开花的基本研究 | 第18-25页 |
| 2.1 水稻抽穗期QTL的研究现状 | 第18-20页 |
| 2.1.1 水稻抽穗期QTL的定位 | 第18-20页 |
| 2.2 水稻抽穗期QTL间的互作 | 第20页 |
| 2.3 水稻抽穗期基因/QTL的克隆与功能分析 | 第20-25页 |
| 2.3.1 Hd1的克隆与功能分析 | 第20-21页 |
| 2.3.2 Hd3a与RFT1的克隆与功能分析 | 第21页 |
| 2.3.3 Ehd1的克隆与功能分析 | 第21页 |
| 2.3.4 Hd6的克隆与功能分析 | 第21-22页 |
| 2.3.5 DTH8/Ghd8/Hd5的克隆与功能分析 | 第22-23页 |
| 2.3.6 Hd17/Ef7/OsELF3/OsELF3-1f的克隆与功能分析 | 第23页 |
| 2.3.7 DTH2的克隆与功能分析 | 第23-24页 |
| 2.3.8 DTH7/OsPRR37/Ghd7.1/Hd2的克隆与功能分析 | 第24-25页 |
| 3 本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 水稻抽穗期QTL-DTH3B的精细定位与侯选基因预测 | 第26-46页 |
| 1 材料与方法 | 第26-33页 |
| 1.1 NIL的分离 | 第26-28页 |
| 1.2 田间栽培 | 第28页 |
| 1.3 控制条件下栽培 | 第28页 |
| 1.4 性状考察 | 第28-29页 |
| 1.4.1 抽穗期调查 | 第28-29页 |
| 1.4.2 种子成熟度统计 | 第29页 |
| 1.5 DNA的提取 | 第29页 |
| 1.6 PCR反应 | 第29-30页 |
| 1.7 分子标记开发 | 第30页 |
| 1.8 QTL分析 | 第30页 |
| 1.9 候选基因预测与测序分析 | 第30-31页 |
| 1.10 节律表达材料的种植与取样 | 第31页 |
| 1.11 RNA提取与Quantitative RT-PCR分析 | 第31页 |
| 1.11.1 RNA的提取 | 第31-32页 |
| 1.11.2 RT-PCR (reverse transcription PCR,逆转录) | 第32-33页 |
| 1.11.3 Quantitative RT-PCR (qRT-PCR)分析 | 第33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-43页 |
| 2.1 抽穗期QTL分析和NIL(DTH3b)的分离 | 第33-34页 |
| 2.2 表型描述 | 第34-36页 |
| 2.3 DTH3b的精细定位 | 第36-38页 |
| 2.3.1 DTH3b的遗传分析 | 第36-37页 |
| 2.3.2 DTH3b的定位策略与精细定位 | 第37-38页 |
| 2.4 交换单株的后代验证 | 第38-39页 |
| 2.5 定位区间内DTH3b的候选基因预测 | 第39-40页 |
| 2.6 DTH3b在LD下通过上调成花素基因Hd3a和RFT1来调控水稻开花 | 第40-43页 |
| 3 讨论 | 第43-46页 |
| 3.1 DTH3b或为一个新的抽穗期位点且编码新型的抽穗期基因 | 第43-44页 |
| 3.2 DTH3b或独立于Hd1和Ehd1途径直接调控Hd3a和RFT1的表达 | 第44页 |
| 3.3 DTH3b或能应用到未来的育种工作中 | 第44-46页 |
| 下篇 利用近等基因系对水稻长芒基因AWN3的图位克隆 | 第46-76页 |
| 第三章 文献综述 | 第46-54页 |
| 1 植物的驯化 | 第46-47页 |
| 2 植物的返祖现象 | 第47-49页 |
| 2.1 返祖现象的发现 | 第48页 |
| 2.2 返祖现象的产生原因 | 第48-49页 |
| 3 水稻长芒基因的研究概况 | 第49-51页 |
| 3.1 水稻长芒表型的QTLs的定位 | 第49-50页 |
| 3.2 水稻芒表型的QTL/基因的克隆与功能分析 | 第50-51页 |
| 4 已克隆的粒长相关QTL/基因 | 第51-52页 |
| 5 本研究的研究意义 | 第52-54页 |
| 第四章 水稻长芒基因AWN3的图位克隆 | 第54-74页 |
| 1 材料与方法 | 第54-58页 |
| 1.1 NIL的分离 | 第54-55页 |
| 1.2 田间栽培 | 第55页 |
| 1.3 性状考察 | 第55-56页 |
| 1.3.1 芒表型调查 | 第55-56页 |
| 1.4 DNA提取 | 第56页 |
| 1.5 RNA提取 | 第56页 |
| 1.6 QTL分析及分子标记开发 | 第56页 |
| 1.7 候选基因预测与测序分析 | 第56页 |
| 1.8 水稻遗传转化的载体构建 | 第56页 |
| 1.8.1 Awn3基因组全长互补载体的构建 | 第56页 |
| 1.8.2 Actin::Awn3过表达载体的构建 | 第56页 |
| 1.9 水稻遗传转化 | 第56-58页 |
| 1.9.1 载体转化农杆菌 | 第56-57页 |
| 1.9.2 农杆菌介导水稻遗传转化流程 | 第57-58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-70页 |
| 2.1 长芒表型的QTL分析及NIL(Awn3)的分离 | 第58-59页 |
| 2.2 NIL(Awn3)在不同环境条件下的芒表型 | 第59-61页 |
| 2.3 Awn3的芒表型在F2群体中的分布 | 第61-62页 |
| 2.4 Awn3的精细定位 | 第62-63页 |
| 2.5 Awn3的候选基因预测 | 第63页 |
| 2.6 转基因功能验证 | 第63-68页 |
| 2.6.1 Awn3基因组全长互补载体的转基因验证 | 第63-65页 |
| 2.6.2 Actin::Awn3过表达载体的转基因验证 | 第65-68页 |
| 2.7 Awn3编码蛋白的结构域分析 | 第68-69页 |
| 2.8 Awn3的表达分析 | 第69-70页 |
| 3 讨论 | 第70-74页 |
| 3.1 Awn3是水稻中第二个成功克隆的长芒基因 | 第70页 |
| 3.2 Awn3具有一因多效性 | 第70-71页 |
| 3.3 芒与人工选择的关系 | 第71-74页 |
| 第五章 全文结论 | 第74-76页 |
| 本研究的创新点 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-88页 |
| 附录 | 第88-96页 |
| 博士在读期间发表的学术论文 | 第96-98页 |
| 致谢 | 第98页 |
