| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 1 文献综述 | 第12-22页 |
| 1.1 四川省藏系绵羊类型概述 | 第12-14页 |
| 1.2 遗传多样性及其研究意义 | 第14-16页 |
| 1.2.1 遗传多样性的概念及其意义 | 第14页 |
| 1.2.2 我国畜禽多样性的现状及存在问题 | 第14-15页 |
| 1.2.3 我国畜禽多样性的表现层次 | 第15-16页 |
| 1.3 动物线粒休DNA多态性研究进展 | 第16-20页 |
| 1.3.1 动物线粒体DNA的结构和遗传特征 | 第16-18页 |
| 1.3.2 动物线粒体DNA多态性研究现状 | 第18-20页 |
| 1.4 利用DNA序列构建系统进化树的方法 | 第20-21页 |
| 1.4.1 邻接法(NJ) | 第21页 |
| 1.4.2 非加权分组平均法(UPGMA) | 第21页 |
| 1.5 本研究的主要内容和目的意义 | 第21-22页 |
| 2 材料和方法 | 第22-27页 |
| 2.1 样品采集和DNA提取 | 第22-24页 |
| 2.1.1 材料来源 | 第22-23页 |
| 2.1.2 提取基因组DNA | 第23-24页 |
| 2.2 MTDNA D-LOOP区PCR扩增、检测和序列测定 | 第24-25页 |
| 2.2.1 引物设计 | 第24页 |
| 2.2.2 PCR反应体系和反应条件 | 第24-25页 |
| 2.2.3 mtDNA D-Loop区PCR的电泳检测 | 第25页 |
| 2.2.4 目的片段DNA序列测定 | 第25页 |
| 2.3 数据分析处理 | 第25-27页 |
| 2.3.1 序列编辑 | 第25-26页 |
| 2.3.2 序列比对 | 第26页 |
| 2.3.3 序列多态性分析 | 第26页 |
| 2.3.4 群体遗传结构分析 | 第26页 |
| 2.3.5 系统发育树的构建 | 第26页 |
| 2.3.6 网络分析 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-45页 |
| 3.1 DNA提取的效果 | 第27页 |
| 3.2 PCR扩增及测序结果 | 第27页 |
| 3.3 6个绵羊群体MTDNA D-LOOP区的全序列差异 | 第27-30页 |
| 3.3.1 所测绵羊个体D-Loop区全序列的长度差异 | 第27-30页 |
| 3.3.2 6个绵羊群体mtDNA D-Loop区的碱基组成 | 第30页 |
| 3.4 MTDNA D-LOOP变异位点 | 第30-31页 |
| 3.5 MTDNA D-LOOP区序列多态性 | 第31-33页 |
| 3.6 6个绵羊群体遗传距离分析 | 第33-34页 |
| 3.7 6个绵羊群体的系统进化分析 | 第34-43页 |
| 3.8 网络关系分析 | 第43-44页 |
| 3.9 群体扩张 | 第44-45页 |
| 4 讨论 | 第45-49页 |
| 4.1 6个绵羊群体MTDNA D-LOOP区的长度及碱基变异 | 第45-47页 |
| 4.2 6个绵羊群体MTDNA D-LOOP区遗传多样性分析 | 第47页 |
| 4.3 6个绵羊群体的遗传距离及分化 | 第47-48页 |
| 4.4 6个绵羊群体的起源与进化 | 第48-49页 |
| 4.5 布拖类群和贾洛类群的群体扩张 | 第49页 |
| 5 结论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录1 286条序列变异位点 | 第58-70页 |
| 附录2 6个群体MTDNA D-LOOP序列的碱基变异位置 | 第70-72页 |
