| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-20页 |
| ·HBV概述 | 第12-13页 |
| ·HBV在宿主基因组中的整合 | 第13-14页 |
| ·肝脏的结构与发育 | 第14页 |
| ·HBV与肝癌 | 第14-15页 |
| ·第二代测序技术简介 | 第15-16页 |
| ·研究HBV整合位点的方法 | 第16-17页 |
| ·国内外研究现状 | 第17-18页 |
| ·本论文组织结构 | 第18-20页 |
| 第二章 基于全基因组测序数据的乙肝病毒整合事件研究 | 第20-36页 |
| ·材料和方法 | 第20-27页 |
| ·临床病例 | 第20-21页 |
| ·全基因组测序 | 第21-22页 |
| ·测序数据的mapping | 第22-23页 |
| ·PCR、Inverse-PCR、接头连接-PCR、单引物PCR | 第23-27页 |
| ·Inverse-PCR | 第23-24页 |
| ·接头连接-PCR | 第24-26页 |
| ·单引物PCR | 第26-27页 |
| ·结果 | 第27-36页 |
| ·测序数据的mapping | 第27-28页 |
| ·被HBV整合的基因 | 第28-29页 |
| ·HBV整合入宿主基因组的片段 | 第29-30页 |
| ·PCR、Inverse-PCR、接头连接-PCR、单引物PCR | 第30-32页 |
| ·HBV整合所揭示出的肿瘤细胞克隆性 | 第32-36页 |
| 第三章 乙肝病毒整合与拷贝数变异 | 第36-42页 |
| ·HBV整合与CNV共同出现 | 第36-37页 |
| ·位于拷贝数变异区域的基因 | 第37-38页 |
| ·QPCR证实拷贝数变异的存在 | 第38-39页 |
| ·整合位点周边杂合位点测序显示HBV整合与CNV的关系 | 第39-42页 |
| 第四章 结论 | 第42-48页 |
| ·本论文的结论 | 第42-46页 |
| ·HBV整合与癌症的关系 | 第42页 |
| ·HBV整合与CNV的关系 | 第42-43页 |
| ·HBV整合位点与肝细胞谱系 | 第43-45页 |
| ·使用PCR技术发掘HBV整合位点 | 第45-46页 |
| ·本论文的创新之处和研究意义 | 第46页 |
| ·本研究存在的不足和未来研究展望 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 简历 | 第54-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |