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苏云金芽胞杆菌幕虫亚种YBT-020晶胞粘连基因簇的克隆及内生质粒pBMB26和pBMB28序列分析与功能验证

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩略语表第13-14页
1 前言第14-36页
   ·芽胞的研究综述第14-22页
     ·芽胞的结构及芽胞的形成第14-17页
       ·芽胞的结构第14-16页
       ·芽胞的形成第16-17页
     ·芽胞衣和芽胞外壁的结构组成与形成第17-22页
       ·芽胞衣和芽胞外壁的结构组成第17-19页
       ·芽胞衣和芽胞外壁的形成第19-22页
   ·苏云金芽胞杆菌及其杀虫晶体蛋白第22-26页
     ·苏云金芽胞杆菌简介第22页
     ·苏云金芽胞杆菌的杀虫晶体蛋白第22-26页
       ·杀虫晶体蛋白的分类第22-23页
       ·杀虫晶体蛋白的定位第23-24页
       ·晶体蛋白基因的表达调控第24-26页
   ·苏云金芽胞杆菌质粒研究进展第26-29页
     ·苏云金芽胞杆菌质粒的分类第26-27页
     ·苏云金芽胞杆菌质粒的功能研究第27-29页
       ·编码毒素基因第27页
       ·携带转座因子第27-28页
       ·接合转移第28-29页
     ·苏云金芽胞杆菌质粒基因组的研究第29页
   ·蜡状芽胞杆菌群基因组的研究进展第29-32页
     ·炭疽芽胞杆菌第30-31页
     ·蜡状芽胞杆菌第31页
     ·苏云金芽胞杆菌第31-32页
     ·蜡状芽胞杆菌群其他菌株第32页
   ·晶胞粘连现象研究的研究进展第32-34页
   ·晶胞粘连现象的研究目的和意义第34-36页
2 材料和方法第36-51页
   ·实验材料第36-42页
     ·菌株、质粒和引物第36-40页
     ·供试抗生素第40-41页
     ·培养基第41页
     ·酶、试剂和试剂盒第41页
     ·缓冲液及配方第41-42页
   ·实验方法第42-51页
     ·分子生物学基本操作第42-44页
       ·苏云金芽胞杆菌质粒的制备第42-43页
       ·苏云金芽胞杆菌总DNA的制备第43页
       ·苏云金芽胞杆菌总DNA的快速制备第43页
       ·苏云金芽胞杆菌感受态细胞的制备及电转化第43-44页
       ·移码突变的构建策略第44页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020基因组细菌人工染色体(BAC)文库制备第44-46页
       ·基因组DNA片段的制备第44-45页
       ·BAC载体的制备第45页
       ·大肠杆菌电转化感受态细胞的制备第45-46页
       ·连接和转化第46页
       ·文库的筛选与保存第46页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020基因组穿梭BAC文库制备第46-47页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020基因组测序与拼接第47页
     ·覆盖质粒pBMB26和pBMB28全长的BAC克隆子的筛选第47-48页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020菌株基因中断突变子的筛选第48-49页
       ·苏云金芽胞杆菌YBT-020菌株基因中断载体的构建策略第48页
       ·苏云金芽胞杆菌YBT-020菌株基因中断突变株的筛选及验证第48-49页
     ·接合转移实验第49页
     ·苏云金芽胞杆菌质粒稳定性检测第49-50页
     ·苏云金芽胞杆菌伴胞晶体制备与电镜观察第50-51页
3 结果与分析第51-88页
   ·苏云金芽胞杆菌YBT-020基因组序列初步分析第51-54页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020基因组的基本特征第51-53页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020在蜡状芽胞杆菌群的分类地位第53-54页
   ·苏云金芽胞杆菌YBT-020晶胞粘连控制基因簇的克隆第54-68页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020晶胞粘连控制基因的定位第54-55页
       ·接合转移供体菌BMBJ1的获得第54页
       ·接合转移受体菌BMB171R1的获得第54页
       ·质粒pBMB26和pBMB28都和晶胞粘连表型相关第54-55页
     ·质粒pBMB26和pBMB28中控制晶胞粘连表型区域的确定第55-59页
       ·质粒pBMB26中控制晶胞粘连表型区域的确定第56-57页
       ·质粒pBMB28中控制晶胞粘连表型区域的确定第57-59页
     ·质粒pBMB26和pBMB28中控制晶胞粘连表型最小区域的确定第59-61页
     ·控制晶胞粘连表型最小区域的生物信息学分析第61-63页
     ·苏云金芽胞杆菌YBT-020晶胞粘连必需基因的敲除验证第63-68页
       ·质粒pBMB26中晶体蛋白基因cry26Aa的验证第63-65页
       ·质粒pBMB28中基因orf1和orf2的验证第65-67页
       ·质粒pBMB28中基因orf3-orf5验证第67-68页
   ·晶体蛋白基因cry26Aa的启动子在晶胞粘连中不起关键作用第68-69页
   ·苏云金芽胞杆菌YBT-020晶胞粘连表型具有晶体蛋白的特异性第69-70页
   ·苏云金芽胞杆菌YBT-020中晶体蛋白基因cry28Aa的作用第70-73页
     ·质粒pBMB28中含有cry28Aa的克隆子可以延长晶体的稳定时间第71-72页
     ·晶体蛋白基因cry28Aa的表达促进了伴胞晶体的稳定第72-73页
   ·质粒pBMB26序列分析及复制子克隆与鉴定第73-83页
     ·质粒pBMB26基本特征第73-74页
     ·质粒pBMB26复制子克隆与鉴定第74-83页
       ·质粒复制子克隆载体的构建第74-75页
       ·鉴定12kb的EcoRI包含了pBMB26的复制区第75-76页
       ·质粒pBMB26最小复制功能域的确定及分析第76-78页
       ·质粒pBMB26复制起始位点Ori的确定第78-80页
       ·GST-标签的ORF70和Ori之间存在蛋白质和DNA相互作用第80-81页
       ·最小复制子的复制稳定性和pBMB26的拷贝数第81页
       ·利用最小复制子pRep7构建穿梭载体第81-82页
       ·质粒pBMB26最小复制区在B.cereus群中的分布第82-83页
   ·质粒pBMB28序列分析及相关基因功能验证第83-88页
     ·质粒pBMB28基本特征第83页
     ·质粒pBMB28复制子克隆与鉴定及在质粒消除中的应用第83-86页
       ·质粒pBMB28复制子的克隆第83-84页
       ·质粒pBMB28最小复制区的鉴定第84-85页
       ·利用质粒不相容性消除质粒pBMB28及表型观察第85-86页
     ·质粒pBMB28接合转移区克隆与鉴定第86-88页
4 讨论第88-92页
   ·基因组分析YBT-020进化关系上更接近炭疽芽胞杆菌第88-89页
   ·采用构建BAC文库的方式筛选晶胞粘连控制基因第89页
   ·晶胞粘连现象形成模式的推测第89页
   ·在不同亚种中晶胞粘连表型控制基因不同第89-90页
   ·cry26Aa和cry28Aa基因的共表达可以有效的稳定伴胞晶体第90页
   ·质粒pBMB26的复制子为一种新型的复制子第90-92页
5 总结与创新点第92-93页
参考文献第93-105页
致谢第105-106页
已发表和待发表文献及申请专利第106页

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