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导管内积乳miRNA表达谱提示乳腺上皮细胞微环境对肿瘤形成的潜在作用

前言第1-5页
中文摘要第5-7页
Abstract第7-12页
英文缩略词第12-14页
第1章 绪论第14-32页
   ·引言第14-16页
   ·文献综述第16-32页
     ·与生理性乳腺分泌有关的激素和基因第16-17页
       ·乳管内液和分泌物的研究第17-19页
     ·乳腺癌的分子研究前沿:miRNA 和高通量测序技术第19-22页
     ·细胞微环境中 miRNA 的传递介质-外体第22-26页
     ·微环境中的 miRNAs 在肿瘤发展过程中的作用第26-32页
第2章 实验材料和方法第32-46页
   ·材料第32-34页
     ·实验对象和分组第32页
     ·主要化学试剂和材料第32-33页
     ·主要仪器设备第33-34页
   ·方法第34-44页
     ·乳管内液和血清标本的收集和保存第34页
     ·小 RNA 的提取第34-35页
     ·RNA 浓度和纯度的测定第35页
     ·小 RNA 的高通量测序及生物信息学分析第35-41页
     ·引物设计及纯度鉴定第41-42页
     ·Real-Time RT-PCR第42-44页
   ·统计软件及方法第44-46页
     ·高通量测序组间差异统计方法第44页
     ·GO 和 KEGG 富集分析算法第44-45页
     ·一般统计方法第45-46页
第3章 实验结果第46-72页
   ·RNA 提取和鉴定第46页
   ·小 RNA 的高通量测序结果和分析第46-67页
     ·原始数据测序的片段长度及分布第46-49页
     ·两组间 sRNAs 的公共序列和特有序列的种类和数量第49页
     ·基因组比对第49-51页
     ·Genbank 比对第51-52页
     ·已知 miRNA 比对第52-54页
     ·预测新 miRNA第54-55页
     ·已知 miRNA 差异分析第55-60页
     ·新 miRNA 的靶基因预测第60页
     ·miRNA 碱基编辑第60-62页
     ·候选 miRNAs 靶基因 GO 富集分析第62-65页
     ·候选 miRNAs 的 KEGG 富集信号通路分析第65-67页
   ·REAL-TIME RT-PCR 实验第67-72页
     ·引物的纯度鉴定第67-68页
     ·Real-time RT-PCR 验证结果第68-69页
     ·Real-time RT-PCR 对比验证乳管内液和血清的表达量第69-72页
第4章 讨论第72-92页
   ·乳管内液小 RNA 高通量测序总结第72页
   ·探讨两组都富集的重要信号转导通路第72-76页
     ·“癌症中转录误调节”信号通路中的 miRNA 和 P53 基因第72-74页
     ·“粘附连接”信号通路中 miRNAs 和靶基因信号通路分析第74-76页
   ·探讨肿物合并积乳组明显下调的 MIRNAS 的靶基因和显著富集的重要信号通路第76-82页
     ·“MAPK 信号转导”通路中相关的积乳 miRNAs第76-78页
     ·肿物组显著下调的 miRNAs 的已知功能研究第78-82页
   ·探讨肿物合并积乳组 7 种上调 MIRNAS 的靶基因和显著富集的信号通路第82-89页
     ·“肌动蛋白细胞骨架调节”信号通路中的支架蛋白相关 miRNAs第82-83页
     ·“局部粘附”和“细胞外基质受体反应”信号通路中共依赖于细胞外基质的相关miRNAs第83-84页
     ·“紧密连接”信号通路中的相关 miRNAs第84-85页
     ·“细胞内吞作用”信号通路中的相关 miRNAs第85页
     ·“细胞周期”信号通路中的相关 miRNAs第85页
     ·“癌症信号转导”信号通路中的相关 miRNAs第85页
     ·相关 miRNAs 的已知功能研究第85-89页
   ·积乳性乳管内液内参的探讨第89-90页
   ·积乳中特异性 MIRNAS 表达量明显高于血清第90-92页
第5章 结论第92-94页
参考文献第94-104页
作者简介及攻读学位期间发表的学术论文第104-106页
致谢第106页

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