前言 | 第1-5页 |
中文摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-12页 |
英文缩略词 | 第12-14页 |
第1章 绪论 | 第14-32页 |
·引言 | 第14-16页 |
·文献综述 | 第16-32页 |
·与生理性乳腺分泌有关的激素和基因 | 第16-17页 |
·乳管内液和分泌物的研究 | 第17-19页 |
·乳腺癌的分子研究前沿:miRNA 和高通量测序技术 | 第19-22页 |
·细胞微环境中 miRNA 的传递介质-外体 | 第22-26页 |
·微环境中的 miRNAs 在肿瘤发展过程中的作用 | 第26-32页 |
第2章 实验材料和方法 | 第32-46页 |
·材料 | 第32-34页 |
·实验对象和分组 | 第32页 |
·主要化学试剂和材料 | 第32-33页 |
·主要仪器设备 | 第33-34页 |
·方法 | 第34-44页 |
·乳管内液和血清标本的收集和保存 | 第34页 |
·小 RNA 的提取 | 第34-35页 |
·RNA 浓度和纯度的测定 | 第35页 |
·小 RNA 的高通量测序及生物信息学分析 | 第35-41页 |
·引物设计及纯度鉴定 | 第41-42页 |
·Real-Time RT-PCR | 第42-44页 |
·统计软件及方法 | 第44-46页 |
·高通量测序组间差异统计方法 | 第44页 |
·GO 和 KEGG 富集分析算法 | 第44-45页 |
·一般统计方法 | 第45-46页 |
第3章 实验结果 | 第46-72页 |
·RNA 提取和鉴定 | 第46页 |
·小 RNA 的高通量测序结果和分析 | 第46-67页 |
·原始数据测序的片段长度及分布 | 第46-49页 |
·两组间 sRNAs 的公共序列和特有序列的种类和数量 | 第49页 |
·基因组比对 | 第49-51页 |
·Genbank 比对 | 第51-52页 |
·已知 miRNA 比对 | 第52-54页 |
·预测新 miRNA | 第54-55页 |
·已知 miRNA 差异分析 | 第55-60页 |
·新 miRNA 的靶基因预测 | 第60页 |
·miRNA 碱基编辑 | 第60-62页 |
·候选 miRNAs 靶基因 GO 富集分析 | 第62-65页 |
·候选 miRNAs 的 KEGG 富集信号通路分析 | 第65-67页 |
·REAL-TIME RT-PCR 实验 | 第67-72页 |
·引物的纯度鉴定 | 第67-68页 |
·Real-time RT-PCR 验证结果 | 第68-69页 |
·Real-time RT-PCR 对比验证乳管内液和血清的表达量 | 第69-72页 |
第4章 讨论 | 第72-92页 |
·乳管内液小 RNA 高通量测序总结 | 第72页 |
·探讨两组都富集的重要信号转导通路 | 第72-76页 |
·“癌症中转录误调节”信号通路中的 miRNA 和 P53 基因 | 第72-74页 |
·“粘附连接”信号通路中 miRNAs 和靶基因信号通路分析 | 第74-76页 |
·探讨肿物合并积乳组明显下调的 MIRNAS 的靶基因和显著富集的重要信号通路 | 第76-82页 |
·“MAPK 信号转导”通路中相关的积乳 miRNAs | 第76-78页 |
·肿物组显著下调的 miRNAs 的已知功能研究 | 第78-82页 |
·探讨肿物合并积乳组 7 种上调 MIRNAS 的靶基因和显著富集的信号通路 | 第82-89页 |
·“肌动蛋白细胞骨架调节”信号通路中的支架蛋白相关 miRNAs | 第82-83页 |
·“局部粘附”和“细胞外基质受体反应”信号通路中共依赖于细胞外基质的相关miRNAs | 第83-84页 |
·“紧密连接”信号通路中的相关 miRNAs | 第84-85页 |
·“细胞内吞作用”信号通路中的相关 miRNAs | 第85页 |
·“细胞周期”信号通路中的相关 miRNAs | 第85页 |
·“癌症信号转导”信号通路中的相关 miRNAs | 第85页 |
·相关 miRNAs 的已知功能研究 | 第85-89页 |
·积乳性乳管内液内参的探讨 | 第89-90页 |
·积乳中特异性 MIRNAS 表达量明显高于血清 | 第90-92页 |
第5章 结论 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-104页 |
作者简介及攻读学位期间发表的学术论文 | 第104-106页 |
致谢 | 第106页 |