摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
1 绪论 | 第9-14页 |
·引言 | 第9页 |
·非编码RNA | 第9-11页 |
·微小RNA | 第9-10页 |
·小核RNA | 第10页 |
·核仁小分子RNA | 第10-11页 |
·高通量测序 | 第11-12页 |
·高通量测序简介 | 第11页 |
·Illumina公司的Solexa测序技术 | 第11-12页 |
·利用高通量测序分析非编码RNA | 第12页 |
·研究的目的和意义 | 第12-14页 |
2 样本总RNA的提取、质检与混合 | 第14-25页 |
·实验材料 | 第14-15页 |
·实验样本信息 | 第14-15页 |
·实验材料与试剂 | 第15页 |
·实验仪器 | 第15页 |
·实验方法 | 第15-19页 |
·TotalRNA的提取(Trizol法) | 第15-16页 |
·样品浓度检测(NanoDrop微量紫外分光光度计) | 第16页 |
·样本质量检测(Agilent Bioanalyzer) | 第16-18页 |
·样本的混合 | 第18-19页 |
·结果与分析 | 第19-24页 |
·样品浓度测量结果 | 第19-20页 |
·样本质量检测结果 | 第20-24页 |
·样本混合后浓度 | 第24页 |
·本章小结 | 第24-25页 |
3 创建文库样本的准备 | 第25-32页 |
·实验材料 | 第25-26页 |
·实验样本 | 第25页 |
·实验材料与试剂 | 第25页 |
·实验仪器 | 第25-26页 |
·实验方法 | 第26-29页 |
·RNA的纯化与浓缩 | 第26-27页 |
·核糖体的去除 | 第27-28页 |
·割胶回收100-200nt非编码RNA | 第28-29页 |
·结果与分析 | 第29-31页 |
·RNA纯化与浓缩结果 | 第29-30页 |
·核糖体去除结果 | 第30-31页 |
·本章小结 | 第31-32页 |
4 100-200bp长度的非编码RNA cDNA文库的创建 | 第32-40页 |
·实验材料 | 第32页 |
·实验材料试剂 | 第32页 |
·实验仪器 | 第32页 |
·实验方法 | 第32-38页 |
·文库的创建 | 第32-36页 |
·文库浓度检测(Qubit fluorometer) | 第36页 |
·文库质量检测 | 第36-38页 |
·结果与分析 | 第38页 |
·文库浓度检测结果 | 第38页 |
·文库质量检测结果 | 第38页 |
·本章小结 | 第38-40页 |
5 100-200bp长度的非编码RNA cDNA的测序与数据分析 | 第40-49页 |
·100-200nt文库的测序 | 第40页 |
·数据处理 | 第40-41页 |
·数据的基本信息 | 第40页 |
·序列比对 | 第40页 |
·获取注释信息 | 第40-41页 |
·新非编码RNA的预测 | 第41页 |
·结果与分析 | 第41-48页 |
·数据的基本信息结果 | 第41-44页 |
·获取的数据比对结果 | 第44页 |
·非编码RNA的注释 | 第44-45页 |
·新非编码RNA的发现 | 第45-48页 |
·本章小结 | 第48-49页 |
6 结论 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-55页 |
附录 | 第55-56页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第56-57页 |
致谢 | 第57-58页 |