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ABH2调控rDNA转录与UHRF家族在DNA甲基化中的作用研究

摘要第1-8页
Abstract第8-15页
第一章 文献综述第15-49页
   ·DNA损伤第15页
   ·DNA损伤修复第15-17页
   ·DNA烷基化损伤第17-21页
     ·DNA烷基化简介第17-19页
     ·烷基化DNA损伤的修复第19-21页
   ·AlkB蛋白的研究第21-28页
     ·AlkB的发现以及功能第21-22页
     ·AlkB同源蛋白的研究第22-23页
     ·人AlkB家族蛋白的研究第23页
     ·AlkB同源蛋白的保守特性第23-25页
     ·AlkB家族的蛋白的生物学功能研究第25-28页
   ·rDNA转录第28-35页
     ·核仁结构以及相关蛋白第28-31页
     ·Pol Ⅰ介导的rDNA转录第31-32页
     ·rDNA转录相关蛋白的研究第32-34页
     ·Ku70在rDNA转录中的作用第34-35页
   ·表观遗传学简介第35-44页
     ·组蛋白甲基化修饰第36-40页
     ·DNA甲基化第40-44页
     ·组蛋白甲基化与DNA甲基化的联系第44页
   ·UHRF1与表观遗传调控第44-49页
     ·UHRF1介绍第45-46页
     ·UHRF1与癌症第46-47页
     ·UHRF家族成员UHRF2第47-49页
第二章 实验材料与方法第49-73页
   ·实验材料第49-51页
     ·质粒第49页
     ·抗体第49-50页
     ·细胞第50页
     ·酶类第50页
     ·组蛋白多肽第50页
     ·试剂盒及试剂第50-51页
   ·实验方法第51-73页
     ·质粒构建一般过程第51-54页
     ·GST融合蛋白的表达与纯化第54-55页
     ·GST pull-down实验第55页
     ·Histone peptide pull-down实验第55-56页
     ·从293T细胞中纯化Flag标签的目的蛋白第56页
     ·体外DNA甲基转移酶酶活检测第56-58页
     ·体内DNA甲基转移酶酶活检测第58-59页
     ·HPLC检测基因组DNA整体甲基化水平第59-61页
     ·稳定细胞株的建立第61-62页
     ·染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)第62-63页
     ·免疫荧光(IF)第63-64页
     ·293T细胞中ABH2复合体的分离及鉴定第64-65页
     ·MTS细胞存活力分析第65页
     ·荧光素酶报告基因检测ABH2的转录活性第65-66页
     ·BrUTP标记活细胞rRNA及免疫染色第66-67页
     ·免疫共沉淀反应第67页
     ·细胞总RNA的抽提第67-68页
     ·RT-PCR第68页
     ·流式细胞周期分析第68-69页
     ·体内泛素化分析第69页
     ·从昆虫细胞中分离纯化目的蛋白第69-73页
第三章 ABH2在rDNA转录中的调控研究第73-101页
   ·引言第73-74页
   ·实验结果第74-98页
     ·人源alkB蛋白的细胞定位第74-75页
     ·ABH2的核仁定位以及其定位信号的确定第75-76页
     ·ABH2核仁定位信号的鉴定第76-77页
     ·ABH2核仁定位依赖rRNA的合成第77-78页
     ·ABH2结合蛋白的分离纯化、鉴定和验证第78-83页
     ·ABH2具有转录调控的功能第83-85页
     ·ABH2激活细胞内rDNA转录第85-87页
     ·下调ABH2表达影响细胞增殖第87-88页
     ·ABH2结合rDNA启动子第88-89页
     ·ABH2表达下调引起DNA损伤第89-92页
     ·ABH2表达下调引起rDNA的DNA损伤第92-94页
     ·ABH2特异相应DNA烷基化损伤第94-98页
   ·讨论第98-101页
第四章 UHRF1与UHRF2在DNA甲基化中的功能研究第101-128页
   ·引言第101-102页
   ·实验结果第102-125页
     ·UHRF1与UHRF2识别和结合H3K9me和半甲基化DNA第102-104页
     ·UHRF2与UHRF1野生型及其缺失突变体在细胞中的定位第104-105页
     ·UHRF2与UHRF1在DNA甲基化中的作用第105-108页
     ·UHRF2影响DNMT3a/3b介导的起始性DNA甲基化第108-109页
     ·UHRF2和UHRF1对DNMTs酶活的影响第109-112页
     ·UHRF2和UHRF1与DNA甲基转移酶之间的相互作用第112-114页
     ·UHRF2与DNMT3a相互作用区域的鉴定第114-115页
     ·UHRF2介导DNMT3a的降解第115-117页
     ·TD点突变体和SRA点突变体表观遗传修饰结合能力的鉴定第117-120页
     ·UHRF1及突变体对Np95-/-整体DNA甲基化水平的影响第120-121页
     ·SRA结构域介导的碱基“翻转”对DNA甲基化的影响第121-125页
   ·实验结果讨论第125-128页
     ·UHRF2与UHRF1具有相似的结合特性第125-126页
     ·UHRF2与UHRF1在DNA甲基化中具有不一样的功能第126-127页
     ·UHRF1结合H3K9me以及SRA在DNA甲基化维持中的作用第127-128页
缩略语第128-130页
附录:部分引物列表第130-133页
攻读学位期间发表的学术论文第133-134页
参考文献第134-151页
致谢第151-152页

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