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酵母谷胱甘肽转移酶Gtt2和甲硫氨酸亚砜还原酶Mxr1的结构与功能研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-18页
第一部分 酵母谷胱甘肽转移酶Gtt2 的结构与功能研究第18-64页
 第一章 谷胱甘肽转移酶的研究背景第18-28页
   ·引言第18页
   ·谷胱甘肽转移酶及其生化机理第18-28页
     ·谷胱甘肽转移酶的概述第18-20页
     ·谷胱甘肽转移酶的同源结构及底物结合位点第20-25页
     ·谷胱甘肽转移酶的催化机理第25-26页
     ·酿酒酵母中的谷胱甘肽转移酶第26-28页
 第二章 实验材料、设备与方法第28-40页
   ·实验材料与设备第28-29页
     ·菌株、质粒第28页
     ·试剂、酶第28页
     ·仪器设备第28-29页
   ·实验方法第29-40页
     ·重组质粒的构建第29-34页
     ·目的蛋白的表达与纯化第34-35页
     ·圆二色谱(Circular Dichroism,CD)分析第35-36页
     ·蛋白质结晶以及数据收集第36-38页
     ·晶体结构解析和精修第38页
     ·Gtt2 野生型及突变体的活性检测第38-39页
     ·Gtt2 结合的谷胱甘肽的pKa 值测定第39-40页
 第三章 结果与讨论第40-59页
   ·Gtt2 的纯化第40-42页
     ·Gtt2 的N 端信号肽第40页
     ·Gtt2 蛋白的表达与纯化第40-42页
   ·野生型Gtt2 及其突变体的圆二色谱实验结果第42-43页
   ·Gtt2 的晶体学研究第43-49页
     ·Gtt2 晶体的生长与优化第43页
     ·Gtt2 衍射数据的收集与处理以及晶体结构的解析第43-45页
     ·Gtt2 结构模型的质量评估第45-49页
   ·Gtt2 的晶体结构与活性位点第49-51页
     ·Gtt2 的总体结构第49-50页
     ·Gtt2 的活性位点第50-51页
   ·Gtt2:一种新的催化类型的谷胱甘肽转移酶第51-56页
     ·激活谷胱甘肽的因子的确定第51-54页
     ·检验传统的催化残基对Gtt2 的作用第54页
     ·Gly27 的重要作用第54-56页
     ·Gtt2 催化机理的模型第56页
   ·非典型性谷胱甘肽转移酶的多序列比对分析第56-59页
 本篇小结第59-60页
 参考文献第60-64页
第二部分 酵母甲硫氨酸亚砜还原酶Mxr1 结构与功能研究第64-112页
 第四章 甲硫氨酸亚砜还原酶的研究背景第64-74页
   ·引言第64页
   ·甲硫氨酸亚砜还原酶及其反应机制第64-74页
     ·甲硫氨酸亚砜还原酶的概述第64-66页
     ·甲硫氨酸亚砜还原酶MsrA 的同源结构及底物结合位点第66-70页
     ·甲硫氨酸亚砜还原酶MsrA 的催化机理第70-71页
     ·甲硫氨酸亚砜还原酶MsrA 的再生机制第71-72页
     ·酿酒酵母中的甲硫氨酸亚砜还原酶第72-74页
 第五章 实验材料、设备与方法第74-84页
   ·实验材料与设备第74-75页
     ·菌株、质粒第74页
     ·试剂、酶第74页
     ·仪器设备第74-75页
   ·实验方法第75-84页
     ·重组质粒的构建第75-78页
     ·目的蛋白的表达与纯化第78-79页
     ·参与Mxr1-Trx2 复合物形成的半胱氨酸分析第79-80页
     ·Mxr1-Trx2 复合物的制备第80-81页
     ·蛋白质结晶以及数据收集第81页
     ·晶体结构解析和精修第81-84页
 第六章 结果与讨论第84-107页
   ·Mxr1 和Trx2 的纯化第84-87页
     ·Mxr1 的纯化第84-86页
     ·Trx2C34S的纯化第86-87页
   ·Mxr1-Trx2 复合物的纯化第87-88页
   ·Mxr1 与Mxr1-Trx2 的晶体学研究第88-95页
     ·Mxr1 与Mxr1-Trx2 晶体的生长与优化第88-89页
     ·Mxr1 相关晶体衍射数据的收集、处理、结构解析第89-91页
     ·Mxr1 结构模型的质量评估第91-95页
   ·Mxr1 与Trx2 参与复合物形成半胱氨酸的鉴定第95-97页
   ·还原态Mxr1 的晶体结构第97-98页
   ·氧化态Mxr1 的晶体结构第98-100页
     ·Mxr1 氧化态单体的结构第98-99页
     ·Mxr1 氧化态二体的结构第99-100页
   ·Mxr1-Trx2 复合物的晶体结构第100-104页
     ·Mxr1-Trx2 的总体结构第100-102页
     ·Mxr1-Trx2 的相互作用界面第102-104页
   ·从Mxr1 的可塑性看MsrA 与MsrB 家族的底物多样性第104-105页
   ·从Trx 底物蛋白的可塑性看Trx 底物蛋白的多样性第105-107页
 本篇小结第107-108页
 参考文献第108-112页
第三部分 其他工作第112-122页
 第七章 其他Trx 底物蛋白与Trx 的复合物研究第112-118页
   ·引言第112页
   ·背景介绍、实验结果与讨论第112-118页
     ·Tsa1 及Tsa1-Trx2 的背景介绍、实验结果与讨论第112-114页
     ·Tsa2 及Tsa2-Trx2 的背景介绍、实验结果与讨论第114-115页
     ·Met16 及Met16-Trx2 的背景介绍、实验结果与讨论第115-116页
     ·Gpx3 及Gpx3-Trx2 的背景介绍、实验结果与讨论第116-118页
 第八章 参与合作的其他工作第118-119页
   ·概述第118-119页
 参考文献第119-122页
附录第122-126页
 A:pET28b 与pET29b 的载体改造第122页
 B:引物设计规则第122-123页
 C:大肠杆菌感受态的制备第123页
 D:聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)的实验流程第123-126页
致谢第126-127页
攻读学位期间发表的学术论文与参加的学术会议第127-129页

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