| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 第一部分 相容性溶质结合蛋白OpuCC的结构与功能研究 | 第15-64页 |
| 第一章 枯草芽孢杆菌蛋白OpuCC的研究背景 | 第15-33页 |
| ·引言 | 第15-16页 |
| ·相容性溶质的特性与功能 | 第16-18页 |
| ·枯草芽孢杆菌的渗透压调节系统 | 第18-24页 |
| ·枯草芽孢杆菌对于渗透压胁迫的细胞响应 | 第19-20页 |
| ·枯草芽孢杆菌对于高渗胁迫的初始响应 | 第20-21页 |
| ·枯草芽孢杆菌对于脯氨酸的专一性摄入 | 第21页 |
| ·枯草芽孢杆菌对甘氨酸甜菜碱等的获取 | 第21-23页 |
| ·枯草芽孢杆菌中甘氨酸甜菜碱的合成途径 | 第23页 |
| ·相容性溶质的流出 | 第23-24页 |
| ·枯草芽孢杆菌OpuC转运系统 | 第24-27页 |
| ·枯草芽孢杆菌蛋白OpuCC的研究背景 | 第27-33页 |
| ·底物结合蛋白的特点和分类 | 第27-29页 |
| ·底物结合蛋白基于结构的分类 | 第29-31页 |
| ·相容性溶质结合蛋白结构的研究背景 | 第31-33页 |
| 第二章 实验材料、设备与方法 | 第33-45页 |
| ·实验材料和设备 | 第33-34页 |
| ·菌株、载体 | 第33页 |
| ·试剂、酶 | 第33页 |
| ·实验仪器和设备 | 第33-34页 |
| ·实验方法 | 第34-45页 |
| ·重组表达载体的构建 | 第34-37页 |
| ·OpuCC蛋白的表达与纯化 | 第37-39页 |
| ·OpuCC晶体生长和结构解析 | 第39-43页 |
| ·OpuCC的生化分析 | 第43-45页 |
| ·OpuCC及其突变体荧光光谱分析 | 第43页 |
| ·OpuCC及其突变体的ELISA分析 | 第43-45页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第45-57页 |
| ·OpuCC的多种相容性溶质结合特性 | 第45-46页 |
| ·OpuCC的整体结构和诱导契合效应 | 第46-49页 |
| ·OpuCC底物结合口袋的结构柔韧性 | 第49-51页 |
| ·OpuCC的单碱基突变导致的多底物结合特性 | 第51-53页 |
| ·OpuCC很可能是一个粘蛋白结合蛋白 | 第53-55页 |
| ·OpuCC和底物分子的对接计算分析 | 第55-57页 |
| 本篇小结 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 第二部分 粘蛋白结合蛋白Spr1345 的结构与功能研究 | 第64-110页 |
| 第四章 肺炎链球菌蛋白Spr1345 的研究背景 | 第64-81页 |
| ·引言 | 第64-66页 |
| ·肺炎链球菌鼻咽部的定植机理 | 第66-69页 |
| ·肺炎链球菌表面蛋白的功能和分类 | 第69-75页 |
| ·胆碱结合蛋白 | 第71-72页 |
| ·脂蛋白：参与底物转运和毒力的相关性 | 第72-73页 |
| ·含有LPxTG基序的多样化蛋白家族 | 第73-75页 |
| ·粘蛋白和粘蛋白结合蛋白 | 第75-81页 |
| ·粘蛋白（mucin）的功能及其分类 | 第75-79页 |
| ·粘蛋白和癌症之间的内在联系 | 第79-81页 |
| 第五章 实验材料、设备与方法 | 第81-87页 |
| ·实验材料和设备 | 第81-82页 |
| ·菌株、载体 | 第81页 |
| ·试剂、酶 | 第81页 |
| ·实验仪器和设备 | 第81-82页 |
| ·实验方法 | 第82-87页 |
| ·MucBD及相关版本蛋白克隆、表达与纯化 | 第82-83页 |
| ·MucBD蛋白晶体生长和结构解析 | 第83-85页 |
| ·Spr1345-MucBD的功能分析 | 第85-87页 |
| ·MucBD及相关版本的ELISA分析 | 第85页 |
| ·MucBD荧光细胞实验 | 第85-87页 |
| 第六章 结果与讨论 | 第87-102页 |
| ·Spr1345 的序列分析和蛋白纯化 | 第87-88页 |
| ·MF171 和MucBD的结构与功能比较 | 第88-91页 |
| ·MucBD可以粘附在人A549 上皮癌细胞上 | 第91-92页 |
| ·MucBD的整体结构 | 第92-94页 |
| ·MucBD和同源结构的比较分析 | 第94页 |
| ·MucBP家族蛋白的组成和系统分析 | 第94-98页 |
| ·MucBP的多样性 | 第94-95页 |
| ·PRD结构域可能的功能角色 | 第95-97页 |
| ·MucBD可能的糖结合位点 | 第97-98页 |
| ·Spr1345 和Spr1677S之间的结构与功能比较 | 第98-102页 |
| ·Spr1677S的晶体结构 | 第98-100页 |
| ·MucBD和Spr1677S的粘蛋白结合活性比较 | 第100-102页 |
| 本篇小结 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-110页 |
| 第三部分 高铁下酿酒酵母转录组研究概述 | 第110-128页 |
| 第七章 酵母转录组研究背景 | 第110-112页 |
| 第八章 实验方法 | 第112-114页 |
| ·酵母菌株的准备和生长曲线的测定 | 第112页 |
| ·RNA的抽提和单链RNA的合成 | 第112页 |
| ·基因芯片的构建与杂交 | 第112页 |
| ·半定量RT-PCR的测定 | 第112-113页 |
| ·细胞GFP荧光标记与检测 | 第113-114页 |
| 第九章 结果与讨论 | 第114-126页 |
| ·高铁对酵母细胞生长的促进作用 | 第114页 |
| ·高铁下酵母的转录组应答 | 第114-123页 |
| ·高铁作为一种压力是受Msn4 调控的 | 第123-125页 |
| ·酵母对于细胞代谢的双重效应 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-128页 |
| 附录 | 第128-132页 |
| A：pET28b(+)质粒图谱 | 第128-129页 |
| B：FITC荧光分子的蛋白标记 | 第129页 |
| C：大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第129-130页 |
| D：蛋白的表达检测 | 第130页 |
| E：酿酒酵母细胞的GFP融合质粒转化 | 第130-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文与参加的学术会议 | 第133-134页 |
