| 摘要 | 第1-13页 |
| ABSTRACT | 第13-18页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第18-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-37页 |
| ·前言 | 第19页 |
| ·猪肌肉生长发育及品质相关的候选基因研究进展 | 第19-25页 |
| ·已明确的主效基因 | 第19-21页 |
| ·其它主效基因 | 第21-25页 |
| ·基因差异表达的研究方法 | 第25-31页 |
| ·消减杂交 | 第25页 |
| ·mRNA差异显示技术(DD-PCR) | 第25-26页 |
| ·代表性序列差别分析(RDA) | 第26页 |
| ·抑制消减杂交技术(SSH) | 第26-28页 |
| ·基因表达序列的分析(SAGE) | 第28页 |
| ·基因芯片技术(Microarray) | 第28-31页 |
| ·基因芯片的使用操作 | 第29页 |
| ·基因芯片技术在猪的遗传育种中的应用 | 第29-31页 |
| ·电脑克隆在分离新基因中的应用 | 第31-32页 |
| ·拟分离基因的研究现状 | 第32-37页 |
| ·β1整合蛋白结合蛋白2(melusin) | 第32-33页 |
| ·载脂蛋白M(APOM) | 第33-34页 |
| ·肌肉强直性营养不良蛋白激酶(DMPK) | 第34-35页 |
| ·葡萄糖6磷酸酶转运亚基(G6PT) | 第35-37页 |
| 第二章 研究的目的和意义 | 第37-38页 |
| 第三章 材料与方法 | 第38-53页 |
| ·试验材料 | 第38-41页 |
| ·试验样品 | 第38-39页 |
| ·DNA样品 | 第38页 |
| ·组织样品 | 第38-39页 |
| ·主要试剂及配制 | 第39-41页 |
| ·主要试剂 | 第39页 |
| ·主要溶液 | 第39-41页 |
| ·主要仪器和设备 | 第41页 |
| ·试验方法 | 第41-53页 |
| ·总RNA的提取及cDNA第一链和SMART cDNA的合成 | 第41-44页 |
| ·总RNA的提取 | 第41-42页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第42页 |
| ·SMART cDNA的合成 | 第42-44页 |
| ·候选基因cDNA序列的分离 | 第44-45页 |
| ·利用电子克隆策略设计引物 | 第44页 |
| ·RT-PCR方法扩增cDNA | 第44-45页 |
| ·RACE-PCR | 第45页 |
| ·外源片段回收、克隆和测序 | 第45-46页 |
| ·PCR产物的回收 | 第45-46页 |
| ·载体连接 | 第46页 |
| ·连接产物的转化 | 第46页 |
| ·阳性克隆子鉴定及测序 | 第46页 |
| ·DNA序列的生物信息学分析 | 第46-47页 |
| ·候选基因基因组序列的分离 | 第47-48页 |
| ·猪血液基因组DNA的提取 | 第47-48页 |
| ·候选基因扩增基因组序列引物设计 | 第48页 |
| ·PCR反应 | 第48页 |
| ·PCR产物回收、纯化和克隆测序 | 第48页 |
| ·DNA序列的生物信息学分析 | 第48页 |
| ·表达谱分析 | 第48-51页 |
| ·RT-PCR组织表达谱分析 | 第50页 |
| ·Real-time RT-PCR不同品种、不同发育阶段骨骼肌中的表达分析 | 第50-51页 |
| ·多态位点的检测方法 | 第51-52页 |
| ·引物设计 | 第51页 |
| ·PCR-RFLP检测方法的建立 | 第51-52页 |
| ·统计分析 | 第52-53页 |
| ·分子标记在不同猪种中的等位基因频率及基因型频率计算 | 第52页 |
| ·分子标记的基因效应分析 | 第52-53页 |
| 第四章 结果与分析 | 第53-104页 |
| ·猪基因组DNA以及总RNA的提取与质量检测结果 | 第53-54页 |
| ·猪MELUSIN基因 | 第54-72页 |
| ·猪melusin基因cDNA序列克隆及序列分析 | 第54-58页 |
| ·猪melusin基因cDNA序列的扩增与测序 | 第54页 |
| ·猪melusin基因cDNA序列的生物信息学分析 | 第54-58页 |
| ·品种特异性melusin基因转录剪接体的分离与鉴定 | 第58-61页 |
| ·大白猪中特异表达转录本的分离 | 第58-59页 |
| ·特异表达转录本的生物信息学分析 | 第59-60页 |
| ·转录本melusin-1特异表达鉴定 | 第60-61页 |
| ·猪melusin基因基因组全长序列的克隆 | 第61-65页 |
| ·猪melusin基因DNA片断扩增结果 | 第61-62页 |
| ·猪melusin基因DNA序列生物信息学分析 | 第62-65页 |
| ·猪melusin基因的组织表达谱分析 | 第65页 |
| ·猪melusin基因的SNP检测及遗传效应分析 | 第65-72页 |
| ·猪melusin基因的SNP扫描结果 | 第65-66页 |
| ·5'调控区G419C的PCR-RFLP结果 | 第66-67页 |
| ·内含子1中A902G的PCR-RFLP结果 | 第67-68页 |
| ·内含子4中C3595T的PCR-RFLP结果 | 第68-69页 |
| ·单倍型构建及其遗传效应分析 | 第69-72页 |
| ·猪APOM基因 | 第72-84页 |
| ·猪APOM基因cDNA序列克隆及序列分析 | 第72-75页 |
| ·猪APOM基因cDNA序列的扩增及测序 | 第72页 |
| ·猪APOM基因cDNA序列的生物信息学分析 | 第72-75页 |
| ·猪APOM基因全长基因组序列的克隆 | 第75-79页 |
| ·猪APOM基因DNA片段扩增结果 | 第75-76页 |
| ·猪APOM基因DNA序列的生物信息学分析 | 第76-79页 |
| ·猪APOM基因的比较定位 | 第79-80页 |
| ·猪APOM基因的组织表达谱研究 | 第80-81页 |
| ·猪APOM基因的SNP检测及遗传效应分析 | 第81-84页 |
| ·猪APOM基因的SNP扫描结果 | 第81页 |
| ·内含子2中G2289C的PCR-RFLP结果 | 第81-82页 |
| ·内含子G2289C的遗传效应分析 | 第82-84页 |
| ·猪DMPK基因 | 第84-95页 |
| ·猪DMPK基因差异表达验证 | 第84-85页 |
| ·猪DMPK基因cDNA序列克隆及序列分析 | 第85-91页 |
| ·猪DMPK基因cDNA序列的扩增与测序 | 第85-86页 |
| ·猪DMPK基因cDNA序列的生物信息学分析 | 第86-91页 |
| ·猪DMPK全长基因组序列的克隆 | 第91-95页 |
| ·猪DMPK基因DNA片段扩增结果 | 第91-92页 |
| ·猪DMPK基因DNA序列生物信息学分析 | 第92-95页 |
| ·猪DMPK基因的组织表达谱分析 | 第95页 |
| ·猪G6PT基因 | 第95-104页 |
| ·猪G6PT基因差异表达验证 | 第95-96页 |
| ·猪G6PT基因cDNA序列克隆及序列分析 | 第96-101页 |
| ·猪G6PT基因cDNA序列的扩增及测序 | 第96-97页 |
| ·猪G6PT基因cDNA序列的生物信息学分析 | 第97-101页 |
| ·猪G6PT全长基因组序列的克隆 | 第101-103页 |
| ·猪G6PT基因DNA片段扩增结果 | 第101-102页 |
| ·猪G6PT基因DNA序列生物信息学分析 | 第102-103页 |
| ·猪G6PT基因的组织表达谱分析 | 第103-104页 |
| 第五章 讨论 | 第104-113页 |
| ·关于候选基因的筛选 | 第104-108页 |
| ·利用电子克隆策略分离猪新基因 | 第108-109页 |
| ·猪与其他物种基因组和氨基酸的保守性 | 第109页 |
| ·关于半定量和实时定量PCR | 第109-110页 |
| ·内含子SNPs的遗传效应分析 | 第110-111页 |
| ·分子标记在不同猪群间基因频率分布 | 第111页 |
| ·分子标记的遗传效应分析 | 第111-112页 |
| ·关于下一步工作 | 第112-113页 |
| 小结 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-126页 |
| 致谢 | 第126页 |
