新一代基因组测序的概率统计模型
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-6页 |
1 引言 | 第6-13页 |
·基因组测序 | 第6-7页 |
·基因组测序历史及发展现状 | 第7页 |
·基因组测序技术 | 第7-10页 |
·传统的测序技术 | 第8-9页 |
·新一代基因组测序 | 第9-10页 |
·基因组测序的策略 | 第10-11页 |
·本课题的研究内容及结构安排 | 第11-13页 |
2 DNA 片段的拼装方法 | 第13-17页 |
·传统的拼装算法 | 第13-14页 |
·欧拉路径拼装思想 | 第14-15页 |
·欧拉拼装算法 | 第15-16页 |
·新一代基因测序的拼装算法 | 第16-17页 |
3 传统基因组测序的概率模型 | 第17-29页 |
·模型中的参数及概念介绍 | 第17-18页 |
·Lander—Waterman 模型 | 第18-21页 |
·Roach 的精确分析模型 | 第21-26页 |
·模型结果的分析与改进 | 第26-28页 |
·结论 | 第28-29页 |
4 新一代基因组测序的概率模型 | 第29-41页 |
·测序的错误 | 第29-31页 |
·新一代基因组测序的概率分析模型 | 第31-35页 |
·泊松过程近似 | 第35-39页 |
·覆盖深度m 与岛的片段数的概率分析 | 第35-38页 |
·蒙特卡罗模拟 | 第38-39页 |
·结论与展望 | 第39-41页 |
致谢 | 第41-42页 |
参考文献 | 第42-46页 |
附录 程序代码 | 第46-50页 |