| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略词 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-14页 |
| 2 材料与方法 | 第14-22页 |
| 2.1 实验材料 | 第14-16页 |
| 2.1.0 菌株来源 | 第14页 |
| 2.1.1 实验器材 | 第14-15页 |
| 2.1.2 主要试剂及生产厂家 | 第15页 |
| 2.1.3 主要试剂配方 | 第15-16页 |
| 2.1.4 生物信息学软件 | 第16页 |
| 2.1.5 网络服务器 | 第16页 |
| 2.1.6 NCBI中所用志贺菌菌株信息 | 第16页 |
| 2.2 方法 | 第16-22页 |
| 2.2.1 志贺菌复苏 | 第16页 |
| 2.2.2 志贺菌基因组DNA提取 | 第16-18页 |
| 2.2.3 志贺菌引物设计 | 第18-19页 |
| 2.2.4 志贺菌CRISPR扩增和测序 | 第19页 |
| 2.2.5 志贺菌CRISPR相关蛋白基因的扩增和测序 | 第19-20页 |
| 2.2.6 志贺菌CRISPR序列信息的分析 | 第20页 |
| 2.2.7 志贺菌CRISPR序列信息的分析 | 第20-21页 |
| 2.2.8 统计学分析方法 | 第21-22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-34页 |
| 3.1 志贺菌CRISPR的PCR扩增结果 | 第22页 |
| 3.2 志贺菌CRISPR相关蛋白基因的PCR扩增结果 | 第22-23页 |
| 3.3 志贺菌CRISPR的测序结果分析 | 第23-25页 |
| 3.3.1 I-E型CRISPR/Cas系统结果分析 | 第23-24页 |
| 3.3.2 CRISPR3 测序结果分析 | 第24-25页 |
| 3.4 志贺菌CRISPR的结构分析 | 第25-26页 |
| 3.4.1 重复序列分析 | 第25-26页 |
| 3.4.2 间隔序列同源性比对结果 | 第26页 |
| 3.5 志贺菌cas基因的测序结果分析 | 第26-31页 |
| 3.5.1 志贺菌cas2-cas1 基因序列分析 | 第26-27页 |
| 3.5.2 志贺菌cas6e-cas5 基因序列分析 | 第27-28页 |
| 3.5.3 志贺菌cas7 基因序列分析 | 第28-29页 |
| 3.5.4 志贺菌cse2 基因序列分析 | 第29-30页 |
| 3.5.5 志贺菌cse1-cas3 基因序列分析 | 第30-31页 |
| 3.6 志贺菌中CRISPR1/Cas系统在志贺菌中的分布 | 第31-32页 |
| 3.7 志贺菌中毒力相关基因的检测和分析 | 第32页 |
| 3.8 志贺菌中CRISPR与毒力相关基因的关联分析 | 第32-34页 |
| 4 讨论 | 第34-41页 |
| 5 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 综述 | 第46-60页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 个人简历和硕士期间发表的论文 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 附录 | 第63-71页 |
