| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 主要符号说明 | 第7-11页 |
| 1 引言 | 第11-16页 |
| 1.1 植物生长发育的研究 | 第11页 |
| 1.2 果实生长发育中的变化 | 第11-14页 |
| 1.2.1 外界条件对果实的影响 | 第13-14页 |
| 1.3 蛋白质组学的发展及主要研究技术 | 第14-15页 |
| 1.4 本研究的意义与内容 | 第15-16页 |
| 2 实验方法 | 第16-21页 |
| 2.1 实验材料 | 第16页 |
| 2.2 实验试剂与仪器 | 第16页 |
| 2.3 实验方法 | 第16-18页 |
| 2.3.1 果实蛋白质提取 | 第16-17页 |
| 2.3.3 iTRAQ标记 | 第17页 |
| 2.3.4 高效液相色谱分馏 | 第17页 |
| 2.3.5 LC-MS/MS分析样品 | 第17-18页 |
| 2.4 生物信息学分析 | 第18-21页 |
| 2.4.1 MS/MS数据分析及数据库检索 | 第18页 |
| 2.4.2 GO注释 | 第18页 |
| 2.4.3 结构域注释 | 第18-19页 |
| 2.4.4 亚细胞定位分析 | 第19页 |
| 2.4.5 蛋白质相对定量 | 第19-20页 |
| 2.4.6 差异表达蛋白GO/结构域/KEGG Pathway富集分析 | 第20页 |
| 2.4.7 聚类分析 | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-108页 |
| 3.1 草莓蛋白质组信息统计 | 第21-23页 |
| 3.1.1 MS/MS数据质量控制验证 | 第21页 |
| 3.1.2 蛋白质组鉴定信息 | 第21-23页 |
| 3.2 蛋白质组注释 | 第23-25页 |
| 3.2.1 蛋白质组GO注释 | 第23页 |
| 3.2.2 蛋白质组的亚细胞定位分析 | 第23-25页 |
| 3.3 蛋白质相对定量分析 | 第25-27页 |
| 3.4 差异表达蛋白GO二级分类分析 | 第27-37页 |
| 3.5 差异表达蛋白亚细胞定位分析 | 第37-43页 |
| 3.6 差异表达蛋白GO富集分析 | 第43-68页 |
| 3.7 差异表达蛋白结构域富集分析 | 第68-86页 |
| 3.8 差异表达蛋白Pathway富集分析 | 第86-104页 |
| 3.9 聚类分析 | 第104-108页 |
| 3.9.1 显著富集的GO功能类别聚类分析 | 第104-105页 |
| 3.9.2 显著富集的结构域和代谢途径聚类分析 | 第105-108页 |
| 4 结论 | 第108-109页 |
| 展望 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-114页 |
| 作者简历 | 第114页 |