基于DNA资料的小麦族属间关系及演化分析
摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
1 文献综述 | 第11-17页 |
1.1 小麦族的分类系统和系统学研究 | 第11-14页 |
1.1.1 小麦族的重要性 | 第11-12页 |
1.1.2 分类历史与现状 | 第12-13页 |
1.1.3 小麦族的分子系统发育及进化研究现状 | 第13-14页 |
1.2 小麦族的起源和分化时间推断 | 第14-16页 |
1.3 生物地理学研究背景 | 第16-17页 |
1.4 本研究的目的与意义 | 第17页 |
2 材料与方法 | 第17-27页 |
2.1 实验材料 | 第17-18页 |
2.2 实验方法 | 第18-24页 |
2.2.1 总DNA的提取 | 第18-23页 |
2.2.2 引物设计、PCR扩增与序列测定 | 第23页 |
2.2.3 目的片段的克隆与测序 | 第23-24页 |
2.3 高变叶绿体基因筛选 | 第24页 |
2.4 数据分析方法 | 第24-27页 |
2.4.1 序列校对与比对 | 第24页 |
2.4.2 最大简约法(MP)分析 | 第24页 |
2.4.3 最大似然法(ML)分析 | 第24-26页 |
2.4.4 贝叶斯(BI)分析 | 第26页 |
2.4.5 核基因network分析 | 第26页 |
2.4.6 分化时间的计算 | 第26-27页 |
2.4.7 分化速率的推断 | 第27页 |
2.4.8 祖先分布区重建 | 第27页 |
3 结果与分析 | 第27-43页 |
3.1 小麦族系统发育重建 | 第27-35页 |
3.1.1 来自叶绿体基因的证据 | 第27-28页 |
3.1.2 来自核基因的证据 | 第28-30页 |
3.1.3 核基因network分析 | 第30-31页 |
3.1.4 叶绿体基因片段和核基因的合并分析 | 第31-35页 |
3.2 小麦族物种分歧时间估计 | 第35-42页 |
3.3 生物地理学(祖先分布区的重建) | 第42-43页 |
4 讨论 | 第43-49页 |
4.1 多倍体属供体基因组的可能起源 | 第43-45页 |
4.2 小麦族的系统发育关系 | 第45-47页 |
4.3 分歧时间与生物地理学 | 第47-49页 |
参考文献 | 第49-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第57页 |