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绵羊臂二头肌转录组新转录本及新长非编码RNA的鉴别与验证

中文摘要第1-9页
Abstract第9-11页
1 前言第11-25页
   ·绵羊骨骼肌转录组学研究进展第11-14页
     ·转录组学第11-12页
     ·家养动物转录组学研究第12-13页
     ·绵羊骨骼肌转录组学研究第13-14页
   ·转录组学研究技术第14-18页
     ·转录组测序技术第14-16页
     ·转录组数据比对技术第16-17页
     ·转录组数据组装技术第17-18页
     ·基于转录组测序的新转录本发掘技术第18页
   ·长非编码RNA研究进展第18-23页
     ·长非编码RNA结构与来源第18-19页
     ·长非编码RNA功能研究第19-21页
     ·长非编码RNA鉴别研究进展第21-23页
   ·本研究的目的意义第23-25页
2 材料与方法第25-39页
   ·试验材料第25-27页
     ·转录组数据来源第25页
     ·样品采集及预处理第25页
     ·试验仪器与设备第25-26页
     ·试验试剂第26-27页
   ·试验方法第27-39页
     ·数据分析第27-32页
     ·获得注释转录本与新长非编码RNA可靠性验证第32-37页
     ·获得注释转录本与新长非编码RNA组织表达半定量分析第37-39页
3 结果与分析第39-54页
   ·转录组数据比对与新转录本初步识别第39-43页
     ·转录组数据与基因组的比对第39-40页
     ·新转录本的初步识别第40-41页
     ·新转录本特征第41-43页
   ·新转录本的鉴别与长非编码RNA的预测第43-47页
     ·新转录本编码潜能预测第43-44页
     ·新转录本序列比对分析第44页
     ·新转录本鉴别第44-45页
     ·长非编码RNA预测第45-46页
     ·长非编码RNA互作基因预测第46页
     ·长非编码RNA互作基因注释第46-47页
   ·获注释新转录本与长非编码RNA试验验证第47-54页
     ·序列信息与外显子结构检验第47-50页
     ·新转录本与长非编码RNA表达的半定量检测第50-54页
4 讨论第54-58页
   ·消除转录噪音有助于发现新转录本第54-55页
   ·新转录本的深入发掘完善了现有基因组注释第55页
   ·结合多种分析方法有助于长非编码RNA的预测第55-56页
   ·基因组注释信息的缺乏不利于小RNA前体长非编码RNA的预测第56-57页
   ·外显子结构特征与半定量分析证明了分析方法的可靠性第57-58页
5 结论第58-59页
参考文献第59-70页
致谢第70-71页
攻读学位期间发表论文情况第71页

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