中文摘要 | 第1-3页 |
Abstract | 第3-5页 |
中文文摘 | 第5-11页 |
第一部分 文献综述 | 第11-27页 |
第一章 甘蔗的遗传多样性和基因组研究进展 | 第12-17页 |
·甘蔗遗传多样 | 第12-13页 |
·分子细胞遗传学 | 第13-14页 |
·甘蔗EST数据库 | 第14-16页 |
·甘蔗及其近源物种在基因组结构上的保守性和共线性 | 第16-17页 |
第二章 植物的糖代谢与蔗糖磷酸合成酶 | 第17-24页 |
·糖代谢 | 第17-20页 |
·蔗糖磷酸合成酶 | 第20-21页 |
·SPS的表达特性 | 第21-22页 |
·SPS的表达调控与修饰 | 第22-24页 |
第三章 本研究的目的与意义 | 第24-27页 |
第二部分 研究内容 | 第27-107页 |
第一章 甘蔗基因组研究 | 第27-47页 |
第一节 前言 | 第27页 |
第二节 材料与软件 | 第27-29页 |
·材料 | 第27-28页 |
·网络资源及应用软件 | 第28-29页 |
第三节 实验方法 | 第29-31页 |
·基因注释生物信息学方法流程 | 第29页 |
·重复序列分析 | 第29-30页 |
·BAC基因注释 | 第30-31页 |
第四节 结果与分析 | 第31-43页 |
·重复序列注释 | 第31-32页 |
·基因预测及功能注释 | 第32-37页 |
·SPS基因注释 | 第37-41页 |
·SPS基因结构 | 第37-38页 |
·SPS理化性质 | 第38-41页 |
·SPS磷酸化位点预测 | 第41页 |
·SPS基因组进化分析 | 第41-43页 |
第五节 讨论 | 第43-47页 |
第二章 甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因表达分析、同源克隆与亚细胞定位 | 第47-77页 |
第一节 前言 | 第47页 |
第二节 材料与试剂 | 第47-50页 |
·材料 | 第47-48页 |
·主要试剂和相关溶液的配制 | 第48-49页 |
·主要仪器和器材 | 第49-50页 |
第三节 实验方法 | 第50-67页 |
·SPS单倍型和SNP分析 | 第50-57页 |
·引物设计与合成 | 第50-52页 |
·甘蔗组织DNA的提取 | 第52-53页 |
·SPS基因的片段化克隆 | 第53-54页 |
·DNA文库构建 | 第54-57页 |
·SPS-cDNA克隆 | 第57-67页 |
·引物设计 | 第57页 |
·RNA提取 | 第57-58页 |
·RNA文库构建及数据分析 | 第58-59页 |
·反转录反应 | 第59页 |
·PCR反应 | 第59-61页 |
·目的片段回收纯化 | 第61-62页 |
·BP反应:SPS基因构建到入门载体 | 第62页 |
·BP反应产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞 | 第62-63页 |
·重组质粒阳性克隆的筛选及测序 | 第63-65页 |
·LR反应 | 第65页 |
·LR反应产物转化农杆菌GV3101感受态细胞 | 第65页 |
·LR反应阳性克隆筛选 | 第65-66页 |
·表达载体瞬时转染烟草 | 第66-67页 |
·SPS的亚细胞定位 | 第67页 |
第四节 实验结果 | 第67-73页 |
·SPS单倍型和SNP分析 | 第67-70页 |
·SPS基因片段化克隆 | 第67页 |
·甘蔗SPS基因表达谱 | 第67-70页 |
·SPS基因同源克隆 | 第70-71页 |
·RNA提取 | 第70-71页 |
·SPS同源克隆 | 第71页 |
·BP反应及测序 | 第71-72页 |
·LR反应结果 | 第72-73页 |
·SPS的亚细胞地位 | 第73页 |
第五节 讨论 | 第73-77页 |
第三章 植物表达载体转化拟南芥及纯合转基因植物的 | 第77-91页 |
第一节 前言 | 第77页 |
第二节 材料与试剂 | 第77-79页 |
·植物材料 | 第77页 |
·主要试剂和相关溶液配制 | 第77-79页 |
·主要仪器和器材 | 第79页 |
第三节 实验方法 | 第79-86页 |
·光暗磷酸化位点的定点突变 | 第79-80页 |
·植物表达载体的构建 | 第80页 |
·植物表达载体转化拟南芥 | 第80页 |
·转基因拟南芥纯合体的筛选 | 第80-86页 |
·拟南芥种植 | 第80-81页 |
·转基因拟南芥纯合体的筛选 | 第81-82页 |
·转基因拟南芥纯合体转录组水平鉴定 | 第82-83页 |
·转基因拟南芥SPS目的蛋白质检测 | 第83-86页 |
第四节 实验结果 | 第86-89页 |
·抗性苗的筛选 | 第86页 |
·转基因纯合体筛选 | 第86-88页 |
·SPS目的蛋白表达鉴定 | 第88-89页 |
·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第88页 |
·Western Blot | 第88-89页 |
第五节 讨论 | 第89-91页 |
第四章 蔗糖磷酸合成酶基因D家族功能研究 | 第91-105页 |
第一节 前言 | 第91页 |
第二节 材料与试剂 | 第91页 |
·植物材料 | 第91页 |
·主要试剂和仪器 | 第91页 |
第三节 实验方法 | 第91-97页 |
·转基因拟南芥SPS表达分析 | 第91-93页 |
·引物设计 | 第91-92页 |
·RNA提取 | 第92页 |
·cDNA合成 | 第92页 |
·荧光定量PCR | 第92-93页 |
·SPS蛋白提取 | 第93页 |
·蛋白酶活的测定 | 第93-94页 |
·碳水化合物测定 | 第94-97页 |
·蛋白抽提抽提 | 第94-95页 |
·葡萄糖、蔗糖、果糖含量测定 | 第95-96页 |
·蛋白含量测定 | 第96-97页 |
·淀粉含量测定 | 第97页 |
第四节 实验结果 | 第97-103页 |
·转基因拟南芥SPS表达分析 | 第97-99页 |
·转基因拟南芥酶活测定 | 第99-100页 |
·转基因拟南芥碳水化合物含量测定 | 第100-103页 |
第五节 讨论 | 第103-105页 |
第五章 结论 | 第105-107页 |
附录1 名词缩写表 | 第107-109页 |
附录2 | 第109-111页 |
参考文献 | 第111-117页 |
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第117-119页 |
致谢 | 第119-121页 |
个人简历 | 第121-123页 |