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甘蔗蔗糖磷酸合成酶家族基因演化和功能研究

中文摘要第1-3页
Abstract第3-5页
中文文摘第5-11页
第一部分 文献综述第11-27页
 第一章 甘蔗的遗传多样性和基因组研究进展第12-17页
   ·甘蔗遗传多样第12-13页
   ·分子细胞遗传学第13-14页
   ·甘蔗EST数据库第14-16页
   ·甘蔗及其近源物种在基因组结构上的保守性和共线性第16-17页
 第二章 植物的糖代谢与蔗糖磷酸合成酶第17-24页
   ·糖代谢第17-20页
   ·蔗糖磷酸合成酶第20-21页
   ·SPS的表达特性第21-22页
   ·SPS的表达调控与修饰第22-24页
 第三章 本研究的目的与意义第24-27页
第二部分 研究内容第27-107页
 第一章 甘蔗基因组研究第27-47页
  第一节 前言第27页
  第二节 材料与软件第27-29页
     ·材料第27-28页
     ·网络资源及应用软件第28-29页
  第三节 实验方法第29-31页
     ·基因注释生物信息学方法流程第29页
     ·重复序列分析第29-30页
     ·BAC基因注释第30-31页
  第四节 结果与分析第31-43页
     ·重复序列注释第31-32页
     ·基因预测及功能注释第32-37页
     ·SPS基因注释第37-41页
       ·SPS基因结构第37-38页
       ·SPS理化性质第38-41页
     ·SPS磷酸化位点预测第41页
     ·SPS基因组进化分析第41-43页
  第五节 讨论第43-47页
 第二章 甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因表达分析、同源克隆与亚细胞定位第47-77页
  第一节 前言第47页
  第二节 材料与试剂第47-50页
     ·材料第47-48页
     ·主要试剂和相关溶液的配制第48-49页
     ·主要仪器和器材第49-50页
  第三节 实验方法第50-67页
     ·SPS单倍型和SNP分析第50-57页
       ·引物设计与合成第50-52页
       ·甘蔗组织DNA的提取第52-53页
       ·SPS基因的片段化克隆第53-54页
       ·DNA文库构建第54-57页
     ·SPS-cDNA克隆第57-67页
       ·引物设计第57页
       ·RNA提取第57-58页
       ·RNA文库构建及数据分析第58-59页
       ·反转录反应第59页
       ·PCR反应第59-61页
       ·目的片段回收纯化第61-62页
       ·BP反应:SPS基因构建到入门载体第62页
       ·BP反应产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞第62-63页
       ·重组质粒阳性克隆的筛选及测序第63-65页
       ·LR反应第65页
       ·LR反应产物转化农杆菌GV3101感受态细胞第65页
       ·LR反应阳性克隆筛选第65-66页
       ·表达载体瞬时转染烟草第66-67页
       ·SPS的亚细胞定位第67页
  第四节 实验结果第67-73页
     ·SPS单倍型和SNP分析第67-70页
       ·SPS基因片段化克隆第67页
       ·甘蔗SPS基因表达谱第67-70页
     ·SPS基因同源克隆第70-71页
       ·RNA提取第70-71页
       ·SPS同源克隆第71页
     ·BP反应及测序第71-72页
     ·LR反应结果第72-73页
     ·SPS的亚细胞地位第73页
  第五节 讨论第73-77页
 第三章 植物表达载体转化拟南芥及纯合转基因植物的第77-91页
  第一节 前言第77页
  第二节 材料与试剂第77-79页
     ·植物材料第77页
     ·主要试剂和相关溶液配制第77-79页
     ·主要仪器和器材第79页
  第三节 实验方法第79-86页
     ·光暗磷酸化位点的定点突变第79-80页
     ·植物表达载体的构建第80页
     ·植物表达载体转化拟南芥第80页
     ·转基因拟南芥纯合体的筛选第80-86页
       ·拟南芥种植第80-81页
       ·转基因拟南芥纯合体的筛选第81-82页
       ·转基因拟南芥纯合体转录组水平鉴定第82-83页
       ·转基因拟南芥SPS目的蛋白质检测第83-86页
  第四节 实验结果第86-89页
     ·抗性苗的筛选第86页
     ·转基因纯合体筛选第86-88页
     ·SPS目的蛋白表达鉴定第88-89页
       ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳第88页
       ·Western Blot第88-89页
  第五节 讨论第89-91页
 第四章 蔗糖磷酸合成酶基因D家族功能研究第91-105页
  第一节 前言第91页
  第二节 材料与试剂第91页
     ·植物材料第91页
     ·主要试剂和仪器第91页
  第三节 实验方法第91-97页
     ·转基因拟南芥SPS表达分析第91-93页
       ·引物设计第91-92页
       ·RNA提取第92页
       ·cDNA合成第92页
       ·荧光定量PCR第92-93页
     ·SPS蛋白提取第93页
     ·蛋白酶活的测定第93-94页
     ·碳水化合物测定第94-97页
       ·蛋白抽提抽提第94-95页
       ·葡萄糖、蔗糖、果糖含量测定第95-96页
       ·蛋白含量测定第96-97页
       ·淀粉含量测定第97页
  第四节 实验结果第97-103页
     ·转基因拟南芥SPS表达分析第97-99页
     ·转基因拟南芥酶活测定第99-100页
     ·转基因拟南芥碳水化合物含量测定第100-103页
  第五节 讨论第103-105页
 第五章 结论第105-107页
附录1 名词缩写表第107-109页
附录2第109-111页
参考文献第111-117页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第117-119页
致谢第119-121页
个人简历第121-123页

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