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高山离子芥耐冷机理的转录组学研究

中文摘要第1-5页
Abstract第5-6页
目录第6-8页
图表目录第8-9页
縮写词列表第9-10页
第一章 引言第10-20页
   ·植物的冷驯化作用及其影响因素第10-12页
   ·植物对低温的生理、生化和分子生物学响应第12-15页
     ·碳水化合物类物质的变化第12-13页
     ·其他可溶性物质的变化第13页
     ·类黄酮次生代谢物质的变化第13页
     ·膜脂组成的变化第13-14页
     ·基因和蛋白质表达的变化第14-15页
   ·植物耐寒、抗冻的机理第15-17页
     ·低温损伤及植物耐受机理第15-16页
     ·低温保护剂的作用机理第16页
     ·类黄酮化合物的作用机理第16-17页
   ·植物冷调节基因表达的转录水平调控网络第17-18页
   ·高山植物在植物耐寒、抗冻机理研究中的意义第18-19页
   ·本论文的目的和意义第19-20页
第二章 材料和方法第20-29页
   ·植物材料培养和处理第20页
   ·RNA提取、测序和转录组从头组装第20-21页
   ·表达分析及差异表达基因(DEGs)鉴定第21-22页
   ·基因功能分类第22页
   ·高山离子芥qPCR定量引物的批量设计第22-23页
   ·实时定量PCR(qPCR)内参基因的筛选第23-24页
   ·qPCR定量分析第24-25页
   ·其他第25-29页
第三章 结果第29-62页
   ·测序结果分析第29-30页
     ·测序产量统计第29页
     ·组装结果第29-30页
   ·高山离子芥转录组所有基因的功能分类第30-32页
   ·基因表达分析及差异表达基因(DEG)筛选第32-39页
     ·基因表达分析第32-35页
     ·差异表达基因(DEG)筛选第35-39页
   ·高山离子芥qPCR内参基因筛选及DEG的表达验证第39-42页
     ·qPCR内参基因筛选第39-41页
     ·DEG表达的qPCR验证第41-42页
   ·高山离子芥与拟南芥冷调节DEG功能网络比较分析第42-62页
     ·高山离子芥与拟南芥转录组的比较分析方法第42页
     ·冷胁迫上调基因的GO网络分析第42-50页
     ·冷胁迫上调基因的KEGG网络分析第50-51页
     ·冷胁迫下调基因的GO功能网络分析第51-62页
第四章 讨论第62-68页
   ·转录组测序结果、基因表达分析及DEG筛选和鉴定第62-63页
   ·通过RNA-seq数据分析获取高质量高山离子芥qPCR内参基因第63页
   ·高山离子芥耐冷、抗冻的可能分子机理第63-66页
     ·冷胁迫选择性激活或抑制部分基因的表达第63-64页
     ·蛋白质翻译后修饰第64-65页
     ·植物次生物质合成第65页
     ·昼夜节律调节第65页
     ·生物胁迫及免疫反应第65-66页
     ·膜脂代谢第66页
   ·与拟南芥转录组的比较研究显示高山离子芥具有特殊耐寒机理第66-68页
第五章 结论第68-69页
参考文献第69-80页
在学期间的研究成果第80-81页
致谢第81页

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