| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 前言 | 第9-20页 |
| ·ncRNA概述 | 第9-10页 |
| ·ncRNA的基本概念 | 第9页 |
| ·ncRNA的发现 | 第9-10页 |
| ·原核生物sRNA的研究进展 | 第10-14页 |
| ·sRNA的分类 | 第10-12页 |
| ·sRNA的功能与作用机制 | 第12-14页 |
| ·利用生物信息学预测根瘤菌的sRNA | 第14-16页 |
| ·QRNA的原理 | 第14-15页 |
| ·deepBase的原理 | 第15-16页 |
| ·预测根瘤菌sRNA需要满足的条件 | 第16页 |
| ·预测sRNA的深入鉴定方法 | 第16-18页 |
| ·直接测序 | 第16页 |
| ·cDNA文库测序 | 第16页 |
| ·生物芯片分析 | 第16-17页 |
| ·Northern印迹杂交 | 第17页 |
| ·基因组SELEX技术 | 第17页 |
| ·质谱法(mass spectrometry) | 第17-18页 |
| ·功能性的RNA组学方法——RNA鉴定后技术 | 第18页 |
| ·研究目的与意义 | 第18-20页 |
| 第二章 材料与方法 | 第20-25页 |
| ·相关软件、数据库及根瘤菌 | 第20页 |
| ·预测方法 | 第20-22页 |
| ·选择根瘤菌的基因间区域 | 第20页 |
| ·根据根瘤菌的相关性寻找同源性 | 第20-21页 |
| ·根据某些中断解析联盟体 | 第21页 |
| ·联盟体输入到QRNA进行运算 | 第21-22页 |
| ·RT-PCR、Northern杂交与荧光定量RT-PCR验证 | 第22-24页 |
| ·RT-PCR | 第22页 |
| ·Northern杂交 | 第22-23页 |
| ·荧光定量RT-PCR | 第23-24页 |
| ·sRNA靶标预测 | 第24-25页 |
| 第三章 结果与分析 | 第25-48页 |
| ·华癸中慢生根瘤菌7653R基因组基因间隔区的sRNA预测 | 第25-27页 |
| ·RT-PCR | 第27-28页 |
| ·Northern杂交与荧光定量RT-PCR检测 | 第28-43页 |
| ·SraG RNA | 第29-30页 |
| ·CsrB RNA | 第30-32页 |
| ·SraC RNA | 第32-33页 |
| ·MicFRNA | 第33-35页 |
| ·RsmY RNA | 第35-36页 |
| ·HgcC RNA | 第36-38页 |
| ·RtT RNA | 第38-39页 |
| ·ISO61 RNA | 第39-41页 |
| ·Qrr RNA | 第41-42页 |
| ·小结 | 第42-43页 |
| ·靶位点预测 | 第43-48页 |
| 第四章 总结与讨论 | 第48-51页 |
| ·总结 | 第48-49页 |
| ·讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 致谢 | 第55页 |