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Argonaute2蛋白和DNA双链断裂诱导产生的小RNA调控同源重组的机制研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
第一章 研究背景及意义第11-37页
   ·研究背景第11-36页
     ·sRNA的种类、特点和功能第11-17页
       ·siRNA第11-14页
       ·miRNA第14-16页
       ·piRNA第16-17页
       ·其他sRNA第17页
     ·sRNA通路的重要蛋白第17-22页
       ·RNaseⅢ家族蛋白第18-19页
       ·Argonaute蛋白第19-22页
       ·GW182第22页
     ·DSB的产生和特点第22-27页
       ·DSB的产生和特点第22-23页
       ·人工诱导DSB的定点发生第23-25页
       ·DNA损伤反应(DDR)第25-27页
     ·DSB的修复第27-32页
       ·NHEJ通路第28-29页
       ·HR通路第29-31页
       ·SSA通路第31页
       ·DSB修复通路的选择第31-32页
     ·sRNA与DNA损伤修复的关系第32-36页
       ·miRNA与DNA损伤修复第33-34页
       ·其他sRNA与DNA损伤修复第34-36页
   ·本研究的意义第36-37页
第二章 实验材料与方法第37-56页
   ·实验材料第37页
     ·细胞系第37页
     ·试剂第37页
   ·实验方法第37-56页
     ·细胞培养第38-39页
       ·细胞的复苏第38页
       ·细胞的传代培养第38页
       ·细胞的冻存第38-39页
       ·细胞的药物处理和IR处理第39页
     ·细胞的转染第39-41页
       ·siRNA转染第39-40页
       ·质粒转染第40页
       ·siRNA和质粒共转染第40-41页
     ·质粒的构建第41-46页
       ·PCR扩增目标片段第41页
       ·PCR产物的琼脂糖凝胶纯化第41-42页
       ·PCR产物末端加A第42页
       ·连接pMD19T载体第42-43页
       ·转化大肠杆菌第43页
       ·碱裂解法小量提取大肠杆菌质粒第43页
       ·Quick-change法构建定点突变质粒第43-44页
       ·酶切第44页
       ·连接目的载体第44-45页
       ·转染用质粒的中量提取(去内毒素)第45-46页
     ·半定量RT-CR检测基因表达水平第46-48页
       ·细胞总RNA的提取第46页
       ·DNA酶消化总RNA中的DNA第46-47页
       ·RNA反转合成cDNA第一链第47页
       ·半定量PCR第47-48页
     ·Western blot检测蛋白表达水平第48-50页
       ·细胞中总蛋白的提取和浓度测定第48页
       ·SDS聚丙烯酰胺凝胶的配制第48-49页
       ·Western blot第49-50页
     ·HR和NHEJ实验第50-51页
       ·HR 实验第50-51页
       ·NHEJ实验第51页
     ·细胞周期分析第51页
     ·免疫共沉淀实验分析蛋白-蛋白相互作用第51-52页
     ·免疫荧光染色和显微镜观察第52-53页
       ·免疫荧光染色第52-53页
       ·显微镜观察第53页
     ·ssDNA分析实验第53-54页
     ·RNA回补实验第54-56页
       ·从总RNA中分离19-28nt的小RNA第54-55页
       ·RNA回补的HR实验第55页
       ·RNA回补的免疫荧光染色实验第55-56页
第三章 实验结果与讨论第56-78页
   ·实验结果第56-75页
     ·Ago2和diRNA特异性参与HR修复第56-63页
       ·Ago2和Dicer参与HR修复第56-58页
       ·Ago2是4个Ago中唯一参与HR的Ago蛋白第58-59页
       ·Ago2和Dicer参与HR不是通过miRNA第59-60页
       ·diRNA参与HR第60-61页
       ·diRNA参与HR不是通过调控细胞周期的方式第61-62页
       ·diRNA特异性地参与HR而不参与NHEJ第62-63页
       ·小结第63页
     ·Ago2能与Rad51相互作用第63-66页
       ·Ago2能与Rad51相互作用第63-64页
       ·Ago2与Rad51的相互作用能被IR所增强第64-65页
       ·Ago2与Rad51的相互作用依赖于ATM和ATR第65-66页
       ·小结第66页
     ·Ago2募集Rad51到DSB位点第66-70页
       ·Ago2影响Rad51在DSB位点的聚集第66-67页
       ·Ago2不影响DNA损伤处理后细胞内ssDNA的形成第67-69页
       ·Ago2不影响Mrell、RPA在DSB位点的聚集第69-70页
       ·小结第70页
     ·Rad51介导HR修复依赖于Ago2/diRNA复合物第70-75页
       ·Ago2与Rad51的相互作用不依赖于diRNA第70-71页
       ·Rad51募集到DSB位点依赖于Ago2/diRNA复合物第71-73页
       ·Rad51介导HR修复依赖于Ago2/diRNA复合物第73-74页
       ·小结第74-75页
   ·讨论第75-78页
参考文献第78-92页
附录第92-98页
攻读博士期间发表的论文第98-99页
致谢第99-101页

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