| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-23页 |
| ·水稻基因组研究进展 | 第9-14页 |
| ·水稻是研究单子叶植物的模式植物 | 第9-10页 |
| ·水稻遗传图谱及物理图谱的构建 | 第10-11页 |
| ·水稻基因组序列测定及分析 | 第11-12页 |
| ·水稻基因组的进化 | 第12-13页 |
| ·水稻功能基因组研究 | 第13-14页 |
| ·水稻(植物)抗病基因研究进展 | 第14-22页 |
| ·植物的抗病性 | 第14-18页 |
| ·植物抗病基因及其克隆 | 第18-20页 |
| ·水稻主要抗病基因研究 | 第20-22页 |
| ·开题设想 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-35页 |
| ·材料 | 第23-25页 |
| ·水稻材料 | 第23页 |
| ·BAC文库 | 第23页 |
| ·试剂和药品 | 第23-25页 |
| ·测序亚克隆文库构建及序列测定 | 第25-29页 |
| ·感受态细胞的的制备 | 第25-26页 |
| ·BAC DNA的提取 | 第26-27页 |
| ·大肠杆菌质粒DNA的小量制备(碱法) | 第27页 |
| ·构建用于测序的亚克隆文库 | 第27-28页 |
| ·鸟枪法BAC序列测定 | 第28-29页 |
| ·序列分析及同源性比较 | 第29页 |
| ·构建用于序列补空及含候选基因(NBS-LRR)克隆的亚克隆文库的构建 | 第29-33页 |
| ·BAC DNA提取 | 第29页 |
| ·BAC DNA的部分消化 | 第29-30页 |
| ·载体pCAMBIA1301的准备 | 第30-31页 |
| ·亚克隆文库构建 | 第31页 |
| ·准备DNA分子杂交膜 | 第31-32页 |
| ·DNA分子杂交筛选含NBS-LRR序列的克隆 | 第32-33页 |
| ·进一步分析筛选出的含NBS-LRR序列的克隆 | 第33页 |
| ·Xa4基因定位 | 第33-34页 |
| ·材料准备 | 第33页 |
| ·水稻基因组DNA的微量提取 | 第33-34页 |
| ·PCR及RFLP | 第34页 |
| ·Xa4物理图谱构建 | 第34页 |
| ·cDNA文库构建及文库筛选 | 第34-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-57页 |
| ·Xa4基因的定位及其共分离标记的获得 | 第35-36页 |
| ·Xa4的遗传特点 | 第35-36页 |
| ·Xa4的分子标记定位与共分离标记的获得 | 第36页 |
| ·Xa4候选BAC的筛选与物理图谱构建 | 第36-39页 |
| ·Xa4候选BAC的筛选 | 第36-37页 |
| ·覆盖Xa4的物理图谱构建 | 第37-39页 |
| ·候选BAC克隆14E19的亚克隆文库构建与序列测定 | 第39-43页 |
| ·测序亚克隆文库构建 | 第39-40页 |
| ·Shotgun测序 | 第40页 |
| ·序列完成图的获得 | 第40-42页 |
| ·序列完成图的验证 | 第42-43页 |
| ·序列分析 | 第43-48页 |
| ·14E19序列概况 | 第43页 |
| ·对14E19的基因预测 | 第43页 |
| ·14E19序列中4个NBS-LRR同源序列在水稻基因组中的分布 | 第43-46页 |
| ·14E19上分布的重复序列 | 第46-48页 |
| ·遗传定位确定有功能的Xa4拷贝 | 第48-50页 |
| ·mRNA分析 | 第50-52页 |
| ·Xa4B表达载体的构建与遗传转化 | 第52-53页 |
| ·Xa4B表达载体的构建 | 第52-53页 |
| ·Xa4B的遗传转化 | 第53页 |
| ·Xa4候选BAC克隆106P13的序列分析 | 第53-56页 |
| ·106P13上含更多的NBS-LRR序列 | 第53-54页 |
| ·106P13中的一个重复单位为90bp的重复序列 | 第54-56页 |
| ·结论 | 第56-57页 |
| 4 讨论 | 第57-62页 |
| ·关于水稻基因组的结构 | 第57-58页 |
| ·关于基因在转基因植物中不表达 | 第58-59页 |
| ·关于植物抗病基因和NBS-LRR编码的基因之间的关系 | 第59-61页 |
| ·关于后基因组时代的研究 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-71页 |
| 附录1 FgeneSH预测的Xa4B的氨基酸序列及结构 | 第71-72页 |
| 附录2 FgeneSH预测的Xa4基因家族其它拷贝的氨基酸序列 | 第72-76页 |
| 附录3 Fgenesh预测的部分NBS-LRR基因比较 | 第76-80页 |
| 附录4 14E19全序列 | 第80-102页 |
| 已发表及拟发表论文 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103页 |
